MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016844	ATA	2	6	293586	293591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974914
6002	NC_016844	GC	3	6	293604	293609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_016844	ACA	2	6	293623	293628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_016844	TC	3	6	293644	293649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_016844	AGT	2	6	293675	293680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016844	GCG	2	6	293681	293686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016844	GCAC	2	8	293691	293698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_016844	GACC	2	8	293727	293734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_016844	CTT	2	6	293814	293819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974915
6010	NC_016844	T	7	7	293818	293824	0 %	100 %	0 %	0 %	378974915
6011	NC_016844	CCA	2	6	293867	293872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974915
6012	NC_016844	TG	3	6	293887	293892	0 %	50 %	50 %	0 %	378974915
6013	NC_016844	TCA	2	6	293923	293928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974915
6014	NC_016844	CCA	2	6	293990	293995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974915
6015	NC_016844	TCTGC	2	10	294071	294080	0 %	40 %	20 %	40 %	378974915
6016	NC_016844	CTT	2	6	294125	294130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974915
6017	NC_016844	CGG	2	6	294168	294173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974915
6018	NC_016844	GTA	2	6	294210	294215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974915
6019	NC_016844	TGC	2	6	294265	294270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974915
6020	NC_016844	GC	3	6	294310	294315	0 %	0 %	50 %	50 %	378974915
6021	NC_016844	TGA	2	6	294371	294376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974915
6022	NC_016844	GAAT	2	8	294485	294492	50 %	25 %	25 %	0 %	378974915
6023	NC_016844	GCG	2	6	294511	294516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974915
6024	NC_016844	GCC	2	6	294525	294530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974915
6025	NC_016844	TTG	2	6	294535	294540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974915
6026	NC_016844	GGGTGA	2	12	294701	294712	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378974915
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6030	NC_016844	GGC	2	6	294888	294893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974915
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6035	NC_016844	TCG	2	6	295099	295104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974915
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6038	NC_016844	ACA	2	6	295227	295232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_016844	GAG	2	6	295236	295241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016844	GAT	2	6	295271	295276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016844	TTTCC	2	10	295318	295327	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6042	NC_016844	GGA	2	6	295340	295345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016844	GC	3	6	295366	295371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_016844	GAG	2	6	295388	295393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016844	CTT	2	6	295434	295439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_016844	G	10	10	295460	295469	0 %	0 %	100 %	0 %	378974916
6047	NC_016844	AG	5	10	295470	295479	50 %	0 %	50 %	0 %	378974916
6048	NC_016844	CGTTG	2	10	295502	295511	0 %	40 %	40 %	20 %	378974916
6049	NC_016844	GTGC	2	8	295514	295521	0 %	25 %	50 %	25 %	378974916
6050	NC_016844	GCCG	2	8	295539	295546	0 %	0 %	50 %	50 %	378974916
6051	NC_016844	ATC	2	6	295559	295564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974916
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6053	NC_016844	GTC	2	6	295605	295610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974916
6054	NC_016844	GC	3	6	295629	295634	0 %	0 %	50 %	50 %	378974916
6055	NC_016844	TTCT	2	8	295651	295658	0 %	75 %	0 %	25 %	378974916
6056	NC_016844	CGC	2	6	295675	295680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974916
6057	NC_016844	GCG	2	6	295739	295744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974916
6058	NC_016844	CAA	2	6	295770	295775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974916
6059	NC_016844	CAT	2	6	295785	295790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974916
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6062	NC_016844	TGA	2	6	295828	295833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974916
6063	NC_016844	GC	3	6	295853	295858	0 %	0 %	50 %	50 %	378974916
6064	NC_016844	CTG	2	6	295919	295924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974916
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6070	NC_016844	G	7	7	296212	296218	0 %	0 %	100 %	0 %	378974916
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6096	NC_016844	CGTG	2	8	297760	297767	0 %	25 %	50 %	25 %	378974916
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6103	NC_016844	TGG	2	6	298110	298115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6105	NC_016844	GTT	2	6	298126	298131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_016844	AGGT	2	8	298165	298172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_016844	GT	3	6	298185	298190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6110	NC_016844	CATG	2	8	298307	298314	25 %	25 %	25 %	25 %	378974917
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6499	NC_016844	GTCG	2	8	315463	315470	0 %	25 %	50 %	25 %	378974932
6500	NC_016844	TGGC	2	8	315509	315516	0 %	25 %	50 %	25 %	378974932

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