MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016844	GGT	2	6	243873	243878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974871
5002	NC_016844	TTG	2	6	243904	243909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974871
5003	NC_016844	GGA	2	6	243938	243943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974871
5004	NC_016844	GT	3	6	243946	243951	0 %	50 %	50 %	0 %	378974871
5005	NC_016844	T	6	6	243984	243989	0 %	100 %	0 %	0 %	378974871
5006	NC_016844	TTC	2	6	243993	243998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974871
5007	NC_016844	CTC	2	6	244082	244087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974871
5008	NC_016844	T	6	6	244101	244106	0 %	100 %	0 %	0 %	378974871
5009	NC_016844	ACA	2	6	244113	244118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974871
5010	NC_016844	GGA	2	6	244164	244169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974871
5011	NC_016844	TGA	2	6	244172	244177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974871
5012	NC_016844	CAA	2	6	244185	244190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974871
5013	NC_016844	TCT	2	6	244270	244275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_016844	TGCC	2	8	244308	244315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_016844	TGT	2	6	244341	244346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016844	T	6	6	244346	244351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016844	GAA	3	9	244381	244389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974872
5018	NC_016844	CGC	2	6	244440	244445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974872
5019	NC_016844	GCA	2	6	244495	244500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974872
5020	NC_016844	TGG	2	6	244536	244541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974872
5021	NC_016844	CGC	2	6	244596	244601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974872
5022	NC_016844	TTA	2	6	244614	244619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974872
5023	NC_016844	CGA	2	6	244647	244652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974872
5024	NC_016844	GC	3	6	244673	244678	0 %	0 %	50 %	50 %	378974872
5025	NC_016844	TGC	2	6	244747	244752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974872
5026	NC_016844	ATC	2	6	244760	244765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974872
5027	NC_016844	GCA	2	6	244779	244784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974872
5028	NC_016844	GAA	2	6	244821	244826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974873
5029	NC_016844	AAG	2	6	244957	244962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974873
5030	NC_016844	T	6	6	245027	245032	0 %	100 %	0 %	0 %	378974873
5031	NC_016844	TGC	2	6	245061	245066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974873
5032	NC_016844	TGC	2	6	245070	245075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974873
5033	NC_016844	AGG	2	6	245112	245117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974873
5034	NC_016844	ATG	2	6	245155	245160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974873
5035	NC_016844	GTCG	2	8	245167	245174	0 %	25 %	50 %	25 %	378974873
5036	NC_016844	GCT	2	6	245248	245253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974873
5037	NC_016844	CG	3	6	245287	245292	0 %	0 %	50 %	50 %	378974873
5038	NC_016844	ACG	2	6	245329	245334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974873
5039	NC_016844	AAG	2	6	245392	245397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974873
5040	NC_016844	AGT	2	6	245486	245491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974873
5041	NC_016844	GCT	2	6	245531	245536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974874
5042	NC_016844	CTT	3	9	245568	245576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974874
5043	NC_016844	AGC	2	6	245610	245615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974874
5044	NC_016844	CG	3	6	245630	245635	0 %	0 %	50 %	50 %	378974874
5045	NC_016844	CGTG	2	8	245649	245656	0 %	25 %	50 %	25 %	378974874
5046	NC_016844	GTG	2	6	245663	245668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974874
5047	NC_016844	TGG	2	6	245727	245732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974874
5048	NC_016844	CG	3	6	245779	245784	0 %	0 %	50 %	50 %	378974874
5049	NC_016844	TGCC	2	8	245811	245818	0 %	25 %	25 %	50 %	378974874
5050	NC_016844	GTG	2	6	245822	245827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974874
5051	NC_016844	GAAA	2	8	245895	245902	75 %	0 %	25 %	0 %	378974874
5052	NC_016844	ACG	2	6	245939	245944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974874
5053	NC_016844	GTG	2	6	246008	246013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974874
5054	NC_016844	GTT	2	6	246038	246043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_016844	ATA	2	6	246138	246143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974875
5056	NC_016844	GGC	2	6	246145	246150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974875
5057	NC_016844	ATT	2	6	246167	246172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974875
5058	NC_016844	GGA	3	9	246226	246234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974875
5059	NC_016844	GAG	2	6	246305	246310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974875
5060	NC_016844	CAGA	2	8	246311	246318	50 %	0 %	25 %	25 %	378974875
5061	NC_016844	TGT	2	6	246325	246330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974875
5062	NC_016844	A	7	7	246356	246362	100 %	0 %	0 %	0 %	378974875
5063	NC_016844	TTA	2	6	246369	246374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974875
5064	NC_016844	GGCTT	2	10	246399	246408	0 %	40 %	40 %	20 %	378974875
5065	NC_016844	TGG	2	6	246426	246431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974875
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5067	NC_016844	GGC	2	6	246475	246480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974875
5068	NC_016844	T	8	8	246540	246547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_016844	CGT	2	6	246562	246567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_016844	TG	3	6	246568	246573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016844	TG	3	6	246718	246723	0 %	50 %	50 %	0 %	378974876
5072	NC_016844	TCGGT	2	10	246765	246774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5073	NC_016844	G	6	6	246784	246789	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016844	AC	3	6	246816	246821	50 %	0 %	0 %	50 %	378974877
5075	NC_016844	AG	3	6	246960	246965	50 %	0 %	50 %	0 %	378974877
5076	NC_016844	TGA	2	6	247055	247060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974877
5077	NC_016844	TTG	2	6	247132	247137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974877
5078	NC_016844	AAT	2	6	247149	247154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974877
5079	NC_016844	ATC	2	6	247224	247229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974877
5080	NC_016844	GTG	2	6	247245	247250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974877
5081	NC_016844	AAGG	2	8	247302	247309	50 %	0 %	50 %	0 %	378974877
5082	NC_016844	ATT	2	6	247332	247337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974877
5083	NC_016844	A	6	6	247377	247382	100 %	0 %	0 %	0 %	378974877
5084	NC_016844	TGCG	2	8	247438	247445	0 %	25 %	50 %	25 %	378974877
5085	NC_016844	ATC	2	6	247470	247475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974877
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5087	NC_016844	GA	3	6	247612	247617	50 %	0 %	50 %	0 %	378974877
5088	NC_016844	ATCC	2	8	247620	247627	25 %	25 %	0 %	50 %	378974877
5089	NC_016844	GAT	2	6	247638	247643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974877
5090	NC_016844	CTG	2	6	247644	247649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974877
5091	NC_016844	ATT	2	6	247674	247679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974877
5092	NC_016844	TGTAT	2	10	247797	247806	20 %	60 %	20 %	0 %	378974877
5093	NC_016844	CGG	2	6	247846	247851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974877
5094	NC_016844	ACT	2	6	247950	247955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974877
5095	NC_016844	GAT	2	6	247974	247979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974877
5096	NC_016844	TCA	2	6	248002	248007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974877
5097	NC_016844	GAT	2	6	248034	248039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974877
5098	NC_016844	CGT	2	6	248058	248063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974877
5099	NC_016844	TTCG	2	8	248065	248072	0 %	50 %	25 %	25 %	378974877
5100	NC_016844	GGAAAC	2	12	248153	248164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378974877
5101	NC_016844	AC	3	6	248280	248285	50 %	0 %	0 %	50 %	378974877
5102	NC_016844	GCG	2	6	248288	248293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974877
5103	NC_016844	TGG	2	6	248312	248317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974877
5104	NC_016844	ACGC	2	8	248440	248447	25 %	0 %	25 %	50 %	378974877
5105	NC_016844	GTT	2	6	248499	248504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974877
5106	NC_016844	CTA	2	6	248546	248551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974877
5107	NC_016844	CGG	2	6	248569	248574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974877
5108	NC_016844	G	6	6	248623	248628	0 %	0 %	100 %	0 %	378974877
5109	NC_016844	TTTCTG	2	12	248689	248700	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378974877
5110	NC_016844	TC	3	6	248703	248708	0 %	50 %	0 %	50 %	378974877
5111	NC_016844	ATG	3	9	248725	248733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974877
5112	NC_016844	CG	3	6	248800	248805	0 %	0 %	50 %	50 %	378974877
5113	NC_016844	AGA	2	6	248896	248901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974877
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5115	NC_016844	AGG	2	6	248938	248943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974877
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5117	NC_016844	AGG	2	6	249169	249174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974877
5118	NC_016844	GAA	2	6	249275	249280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974877
5119	NC_016844	GTGC	2	8	249327	249334	0 %	25 %	50 %	25 %	378974877
5120	NC_016844	GAC	2	6	249380	249385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974877
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5123	NC_016844	TTC	2	6	249443	249448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974877
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5288	NC_016844	GAGG	2	8	257897	257904	25 %	0 %	75 %	0 %	378974881
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5321	NC_016844	T	6	6	259372	259377	0 %	100 %	0 %	0 %	378974882
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5329	NC_016844	GTA	2	6	259686	259691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974882
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5337	NC_016844	GTGC	2	8	260286	260293	0 %	25 %	50 %	25 %	378974882
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5349	NC_016844	TGA	2	6	260797	260802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974882
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5351	NC_016844	ATG	2	6	260827	260832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974882
5352	NC_016844	GAG	2	6	260847	260852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974882
5353	NC_016844	GA	3	6	260952	260957	50 %	0 %	50 %	0 %	378974882
5354	NC_016844	GTG	2	6	260983	260988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5361	NC_016844	TGA	2	6	261294	261299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974883
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5363	NC_016844	GGT	2	6	261325	261330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974883
5364	NC_016844	TTC	2	6	261379	261384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974883
5365	NC_016844	GGTGC	2	10	261407	261416	0 %	20 %	60 %	20 %	378974883
5366	NC_016844	GGA	2	6	261434	261439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974883
5367	NC_016844	GGT	3	9	261484	261492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974883
5368	NC_016844	GAAA	2	8	261493	261500	75 %	0 %	25 %	0 %	378974883
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