MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016843	AGT	2	6	147928	147933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973696
3002	NC_016843	CA	3	6	148007	148012	50 %	0 %	0 %	50 %	378973696
3003	NC_016843	CGC	2	6	148030	148035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973696
3004	NC_016843	GTC	2	6	148090	148095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973696
3005	NC_016843	CGC	2	6	148174	148179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973696
3006	NC_016843	AGT	2	6	148180	148185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973696
3007	NC_016843	CAC	2	6	148262	148267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973696
3008	NC_016843	TCG	2	6	148314	148319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_016843	C	9	9	148338	148346	0 %	0 %	0 %	100 %	378973697
3010	NC_016843	GTTC	2	8	148376	148383	0 %	50 %	25 %	25 %	378973697
3011	NC_016843	CG	3	6	148385	148390	0 %	0 %	50 %	50 %	378973697
3012	NC_016843	GCA	2	6	148395	148400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973697
3013	NC_016843	CG	3	6	148401	148406	0 %	0 %	50 %	50 %	378973697
3014	NC_016843	CGGCTG	2	12	148586	148597	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378973697
3015	NC_016843	TTC	2	6	148857	148862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973697
3016	NC_016843	CTTGC	2	10	148892	148901	0 %	40 %	20 %	40 %	378973697
3017	NC_016843	AGC	2	6	148997	149002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973698
3018	NC_016843	GAA	2	6	149042	149047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973698
3019	NC_016843	GGT	2	6	149085	149090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973698
3020	NC_016843	TTC	2	6	149091	149096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973698
3021	NC_016843	GCG	2	6	149105	149110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973698
3022	NC_016843	GC	3	6	149157	149162	0 %	0 %	50 %	50 %	378973698
3023	NC_016843	TCTT	2	8	149256	149263	0 %	75 %	0 %	25 %	378973698
3024	NC_016843	TGC	2	6	149290	149295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973698
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3027	NC_016843	AGC	2	6	149550	149555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973699
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3029	NC_016843	GC	3	6	149595	149600	0 %	0 %	50 %	50 %	378973699
3030	NC_016843	CTG	3	9	149610	149618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973699
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3033	NC_016843	CCA	2	6	149713	149718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973699
3034	NC_016843	GTC	2	6	149745	149750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973699
3035	NC_016843	GTG	2	6	149764	149769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973699
3036	NC_016843	GCA	3	9	149815	149823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973699
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3038	NC_016843	TAC	2	6	150053	150058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973700
3039	NC_016843	TGT	2	6	150114	150119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973700
3040	NC_016843	GT	3	6	150169	150174	0 %	50 %	50 %	0 %	378973700
3041	NC_016843	G	9	9	150201	150209	0 %	0 %	100 %	0 %	378973700
3042	NC_016843	ACT	2	6	150294	150299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973701
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3044	NC_016843	GTT	2	6	150586	150591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016843	GGCTGG	2	12	150592	150603	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3046	NC_016843	TCGGGC	2	12	150607	150618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_016843	GTAC	2	8	150643	150650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_016843	GCT	2	6	150686	150691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_016843	TCC	2	6	150720	150725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973702
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3051	NC_016843	GC	3	6	150814	150819	0 %	0 %	50 %	50 %	378973702
3052	NC_016843	GAC	2	6	150868	150873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973702
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3054	NC_016843	GCTT	2	8	150890	150897	0 %	50 %	25 %	25 %	378973702
3055	NC_016843	CCG	2	6	150905	150910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973702
3056	NC_016843	CTG	2	6	150930	150935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973702
3057	NC_016843	GTTTG	2	10	150946	150955	0 %	60 %	40 %	0 %	378973702
3058	NC_016843	G	6	6	150974	150979	0 %	0 %	100 %	0 %	378973702
3059	NC_016843	TCC	2	6	151004	151009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973702
3060	NC_016843	CCA	2	6	151029	151034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973702
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3062	NC_016843	GCGG	2	8	151138	151145	0 %	0 %	75 %	25 %	378973703
3063	NC_016843	GTC	2	6	151242	151247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973703
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3066	NC_016843	GC	3	6	151319	151324	0 %	0 %	50 %	50 %	378973703
3067	NC_016843	GCA	3	9	151368	151376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973703
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3069	NC_016843	CCG	2	6	151392	151397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973703
3070	NC_016843	GAC	2	6	151424	151429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973703
3071	NC_016843	CCA	2	6	151480	151485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973703
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3073	NC_016843	GTT	2	6	151776	151781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016843	CTGCGG	4	24	151784	151807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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3083	NC_016843	CA	3	6	152126	152131	50 %	0 %	0 %	50 %	378973706
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3085	NC_016843	CGGCTC	2	12	152289	152300	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_016843	GCT	2	6	152314	152319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_016843	TTCA	2	8	152518	152525	25 %	50 %	0 %	25 %	378973707
3088	NC_016843	TAA	2	6	152544	152549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973707
3089	NC_016843	TG	3	6	152581	152586	0 %	50 %	50 %	0 %	378973707
3090	NC_016843	CAC	2	6	152630	152635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973707
3091	NC_016843	GGTG	2	8	152775	152782	0 %	25 %	75 %	0 %	378973707
3092	NC_016843	AGT	2	6	152832	152837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973707
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3094	NC_016843	GC	3	6	152966	152971	0 %	0 %	50 %	50 %	378973707
3095	NC_016843	GC	3	6	153081	153086	0 %	0 %	50 %	50 %	378973707
3096	NC_016843	AGC	2	6	153139	153144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973707
3097	NC_016843	CAT	2	6	153193	153198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973707
3098	NC_016843	CAC	2	6	153229	153234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973707
3099	NC_016843	CT	4	8	153264	153271	0 %	50 %	0 %	50 %	378973707
3100	NC_016843	CCT	2	6	153368	153373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973707
3101	NC_016843	TGTTT	2	10	153391	153400	0 %	80 %	20 %	0 %	378973707
3102	NC_016843	TCGT	2	8	153401	153408	0 %	50 %	25 %	25 %	378973707
3103	NC_016843	TGC	2	6	153434	153439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973707
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3105	NC_016843	GTG	2	6	153539	153544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973707
3106	NC_016843	AGGA	2	8	153572	153579	50 %	0 %	50 %	0 %	378973707
3107	NC_016843	CCGGAG	2	12	153647	153658	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378973707
3108	NC_016843	CA	3	6	153736	153741	50 %	0 %	0 %	50 %	378973707
3109	NC_016843	GGAA	2	8	153795	153802	50 %	0 %	50 %	0 %	378973707
3110	NC_016843	AGA	2	6	153841	153846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973707
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3118	NC_016843	CTC	2	6	154150	154155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_016843	C	9	9	154170	154178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3120	NC_016843	CT	3	6	154269	154274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_016843	CGG	2	6	154318	154323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_016843	AGG	2	6	154328	154333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016843	GTG	3	9	154362	154370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973708
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3125	NC_016843	GGTCT	2	10	154426	154435	0 %	40 %	40 %	20 %	378973708
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3134	NC_016843	CGT	2	6	154891	154896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973708
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3199	NC_016843	GC	3	6	157692	157697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3231	NC_016843	GA	3	6	158978	158983	50 %	0 %	50 %	0 %	378973712
3232	NC_016843	GC	3	6	158995	159000	0 %	0 %	50 %	50 %	378973712
3233	NC_016843	AG	3	6	159036	159041	50 %	0 %	50 %	0 %	378973712
3234	NC_016843	CGGT	3	12	159119	159130	0 %	25 %	50 %	25 %	378973712
3235	NC_016843	A	7	7	159158	159164	100 %	0 %	0 %	0 %	378973712
3236	NC_016843	GGGC	2	8	159194	159201	0 %	0 %	75 %	25 %	378973712
3237	NC_016843	CAG	2	6	159237	159242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973712
3238	NC_016843	CGC	2	6	159264	159269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973712
3239	NC_016843	ACGA	2	8	159280	159287	50 %	0 %	25 %	25 %	378973712
3240	NC_016843	ACC	2	6	159316	159321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973712
3241	NC_016843	TCTT	2	8	159356	159363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3242	NC_016843	CTG	2	6	159402	159407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_016843	GCAAG	2	10	159505	159514	40 %	0 %	40 %	20 %	378973713
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3245	NC_016843	GGTG	2	8	159588	159595	0 %	25 %	75 %	0 %	378973713
3246	NC_016843	C	6	6	159702	159707	0 %	0 %	0 %	100 %	378973714
3247	NC_016843	CTT	2	6	159739	159744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973714
3248	NC_016843	CTGT	2	8	159759	159766	0 %	50 %	25 %	25 %	378973714
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3250	NC_016843	TGCG	2	8	159820	159827	0 %	25 %	50 %	25 %	378973714
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3371	NC_016843	CG	4	8	165462	165469	0 %	0 %	50 %	50 %	378973720
3372	NC_016843	A	9	9	165485	165493	100 %	0 %	0 %	0 %	378973720
3373	NC_016843	GGGA	2	8	165596	165603	25 %	0 %	75 %	0 %	378973720
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