MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_016843	CCGT	2	8	1114802	1114809	0 %	25 %	25 %	50 %	378974611
23503	NC_016843	ATT	2	6	1114886	1114891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974611
23504	NC_016843	CTC	2	6	1114942	1114947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974611
23505	NC_016843	TTGT	2	8	1114964	1114971	0 %	75 %	25 %	0 %	378974611
23506	NC_016843	CAC	2	6	1115049	1115054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974611
23507	NC_016843	GAG	2	6	1115188	1115193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974611
23508	NC_016843	AC	3	6	1115253	1115258	50 %	0 %	0 %	50 %	378974612
23509	NC_016843	ATT	2	6	1115285	1115290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974612
23510	NC_016843	CTGTGC	2	12	1115335	1115346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974612
23511	NC_016843	AGG	2	6	1115356	1115361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974612
23512	NC_016843	GT	4	8	1115376	1115383	0 %	50 %	50 %	0 %	378974612
23513	NC_016843	TG	3	6	1115386	1115391	0 %	50 %	50 %	0 %	378974612
23514	NC_016843	GC	3	6	1115449	1115454	0 %	0 %	50 %	50 %	378974612
23515	NC_016843	ACG	2	6	1115553	1115558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974612
23516	NC_016843	GCG	2	6	1115614	1115619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974612
23517	NC_016843	GGA	3	9	1115644	1115652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974612
23518	NC_016843	TGC	2	6	1115671	1115676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974612
23519	NC_016843	AGG	2	6	1115760	1115765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974612
23520	NC_016843	AGA	2	6	1115830	1115835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974612
23521	NC_016843	TGCGA	2	10	1115844	1115853	20 %	20 %	40 %	20 %	378974612
23522	NC_016843	TCGTA	2	10	1115930	1115939	20 %	40 %	20 %	20 %	378974612
23523	NC_016843	AGA	2	6	1116013	1116018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974612
23524	NC_016843	CACT	2	8	1116086	1116093	25 %	25 %	0 %	50 %	378974612
23525	NC_016843	ACCTG	2	10	1116127	1116136	20 %	20 %	20 %	40 %	378974612
23526	NC_016843	TC	3	6	1116163	1116168	0 %	50 %	0 %	50 %	378974612
23527	NC_016843	GCG	2	6	1116196	1116201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974612
23528	NC_016843	CGA	2	6	1116314	1116319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974612
23529	NC_016843	GTA	2	6	1116353	1116358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974612
23530	NC_016843	GAA	2	6	1116364	1116369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974612
23531	NC_016843	AT	3	6	1116465	1116470	50 %	50 %	0 %	0 %	378974612
23532	NC_016843	GAA	2	6	1116548	1116553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974612
23533	NC_016843	GC	3	6	1116673	1116678	0 %	0 %	50 %	50 %	378974612
23534	NC_016843	CCA	2	6	1116706	1116711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974612
23535	NC_016843	CT	3	6	1116716	1116721	0 %	50 %	0 %	50 %	378974612
23536	NC_016843	GCG	2	6	1116755	1116760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23537	NC_016843	TC	3	6	1116762	1116767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23538	NC_016843	GCCCG	2	10	1116779	1116788	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23539	NC_016843	GAA	2	6	1116802	1116807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23540	NC_016843	CTA	2	6	1116823	1116828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974613
23541	NC_016843	CGCCTT	2	12	1116829	1116840	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378974613
23542	NC_016843	CAC	2	6	1116877	1116882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974613
23543	NC_016843	AGG	2	6	1116895	1116900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974613
23544	NC_016843	GT	3	6	1116903	1116908	0 %	50 %	50 %	0 %	378974613
23545	NC_016843	AT	3	6	1116931	1116936	50 %	50 %	0 %	0 %	378974613
23546	NC_016843	A	6	6	1117227	1117232	100 %	0 %	0 %	0 %	378974613
23547	NC_016843	CG	3	6	1117233	1117238	0 %	0 %	50 %	50 %	378974613
23548	NC_016843	ACT	2	6	1117243	1117248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974613
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23550	NC_016843	CCTG	2	8	1117341	1117348	0 %	25 %	25 %	50 %	378974613
23551	NC_016843	TAA	2	6	1117353	1117358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974613
23552	NC_016843	A	6	6	1117357	1117362	100 %	0 %	0 %	0 %	378974613
23553	NC_016843	TCA	2	6	1117421	1117426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974613
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23555	NC_016843	CCA	2	6	1117503	1117508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974613
23556	NC_016843	ACT	2	6	1117517	1117522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974613
23557	NC_016843	A	6	6	1117564	1117569	100 %	0 %	0 %	0 %	378974613
23558	NC_016843	ACCC	2	8	1117592	1117599	25 %	0 %	0 %	75 %	378974613
23559	NC_016843	TGAT	2	8	1117628	1117635	25 %	50 %	25 %	0 %	378974613
23560	NC_016843	A	6	6	1117665	1117670	100 %	0 %	0 %	0 %	378974613
23561	NC_016843	GAATC	2	10	1117677	1117686	40 %	20 %	20 %	20 %	378974613
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23564	NC_016843	GC	4	8	1117995	1118002	0 %	0 %	50 %	50 %	378974613
23565	NC_016843	CA	3	6	1118007	1118012	50 %	0 %	0 %	50 %	378974613
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23568	NC_016843	GGA	2	6	1118068	1118073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974613
23569	NC_016843	AGAA	2	8	1118211	1118218	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23570	NC_016843	CGG	2	6	1118230	1118235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23571	NC_016843	GACG	2	8	1118272	1118279	25 %	0 %	50 %	25 %	378974614
23572	NC_016843	TTC	2	6	1118378	1118383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974614
23573	NC_016843	TCTGCA	2	12	1118418	1118429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974614
23574	NC_016843	CG	3	6	1118514	1118519	0 %	0 %	50 %	50 %	378974614
23575	NC_016843	ATC	2	6	1118528	1118533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974614
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23578	NC_016843	TCA	2	6	1118712	1118717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974614
23579	NC_016843	CTC	2	6	1118738	1118743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974614
23580	NC_016843	GC	3	6	1118758	1118763	0 %	0 %	50 %	50 %	378974614
23581	NC_016843	CACC	2	8	1118794	1118801	25 %	0 %	0 %	75 %	378974614
23582	NC_016843	TCC	2	6	1118823	1118828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974614
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23590	NC_016843	GCGA	2	8	1119201	1119208	25 %	0 %	50 %	25 %	378974615
23591	NC_016843	TTC	2	6	1119244	1119249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974615
23592	NC_016843	C	6	6	1119447	1119452	0 %	0 %	0 %	100 %	378974616
23593	NC_016843	GTA	2	6	1119471	1119476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974616
23594	NC_016843	CG	4	8	1119602	1119609	0 %	0 %	50 %	50 %	378974616
23595	NC_016843	GA	3	6	1119773	1119778	50 %	0 %	50 %	0 %	378974617
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23600	NC_016843	AGC	2	6	1119906	1119911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974617
23601	NC_016843	ACCA	2	8	1119914	1119921	50 %	0 %	0 %	50 %	378974617
23602	NC_016843	CAC	2	6	1119932	1119937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974617
23603	NC_016843	GAA	2	6	1120053	1120058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974617
23604	NC_016843	CTG	2	6	1120064	1120069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974617
23605	NC_016843	TGA	2	6	1120108	1120113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23606	NC_016843	CA	3	6	1120162	1120167	50 %	0 %	0 %	50 %	378974618
23607	NC_016843	ATGCGT	2	12	1120234	1120245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974618
23608	NC_016843	TTC	2	6	1120356	1120361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974618
23609	NC_016843	GCT	3	9	1120409	1120417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974618
23610	NC_016843	CAC	2	6	1120423	1120428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974618
23611	NC_016843	AGA	2	6	1120526	1120531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974618
23612	NC_016843	CTC	2	6	1120560	1120565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974618
23613	NC_016843	CA	3	6	1120573	1120578	50 %	0 %	0 %	50 %	378974618
23614	NC_016843	CCA	2	6	1120592	1120597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974618
23615	NC_016843	AC	3	6	1120631	1120636	50 %	0 %	0 %	50 %	378974618
23616	NC_016843	GCG	2	6	1120649	1120654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974618
23617	NC_016843	CTT	2	6	1120679	1120684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974618
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