MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_016843	TCT	2	6	1019118	1019123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974521
21502	NC_016843	T	6	6	1019131	1019136	0 %	100 %	0 %	0 %	378974521
21503	NC_016843	GC	3	6	1019156	1019161	0 %	0 %	50 %	50 %	378974521
21504	NC_016843	CTC	2	6	1019361	1019366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974522
21505	NC_016843	T	6	6	1019385	1019390	0 %	100 %	0 %	0 %	378974522
21506	NC_016843	G	6	6	1019407	1019412	0 %	0 %	100 %	0 %	378974522
21507	NC_016843	CCCT	2	8	1019441	1019448	0 %	25 %	0 %	75 %	378974522
21508	NC_016843	CGAT	2	8	1019505	1019512	25 %	25 %	25 %	25 %	378974522
21509	NC_016843	GT	3	6	1019631	1019636	0 %	50 %	50 %	0 %	378974522
21510	NC_016843	CGT	2	6	1019642	1019647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974522
21511	NC_016843	CATC	2	8	1019687	1019694	25 %	25 %	0 %	50 %	378974522
21512	NC_016843	AACGC	2	10	1019771	1019780	40 %	0 %	20 %	40 %	378974522
21513	NC_016843	TCA	2	6	1019790	1019795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974522
21514	NC_016843	TTA	2	6	1019890	1019895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974522
21515	NC_016843	GCT	2	6	1019914	1019919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974522
21516	NC_016843	GCC	2	6	1019980	1019985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974522
21517	NC_016843	CA	4	8	1020133	1020140	50 %	0 %	0 %	50 %	378974522
21518	NC_016843	TGC	2	6	1020162	1020167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974522
21519	NC_016843	ATC	2	6	1020171	1020176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974522
21520	NC_016843	GC	4	8	1020198	1020205	0 %	0 %	50 %	50 %	378974522
21521	NC_016843	AC	3	6	1020263	1020268	50 %	0 %	0 %	50 %	378974522
21522	NC_016843	GCA	2	6	1020292	1020297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974522
21523	NC_016843	GCGCGT	2	12	1020303	1020314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378974522
21524	NC_016843	A	6	6	1020346	1020351	100 %	0 %	0 %	0 %	378974522
21525	NC_016843	TAA	2	6	1020400	1020405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974522
21526	NC_016843	GC	3	6	1020465	1020470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21527	NC_016843	AGC	2	6	1020503	1020508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21528	NC_016843	CAAC	2	8	1020573	1020580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21529	NC_016843	CTAC	2	8	1020600	1020607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21530	NC_016843	GCC	2	6	1020655	1020660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974523
21531	NC_016843	CGTG	2	8	1020677	1020684	0 %	25 %	50 %	25 %	378974523
21532	NC_016843	TG	4	8	1020683	1020690	0 %	50 %	50 %	0 %	378974523
21533	NC_016843	TGCG	2	8	1020722	1020729	0 %	25 %	50 %	25 %	378974523
21534	NC_016843	GATT	2	8	1020760	1020767	25 %	50 %	25 %	0 %	378974523
21535	NC_016843	AC	3	6	1020786	1020791	50 %	0 %	0 %	50 %	378974523
21536	NC_016843	TAC	2	6	1020826	1020831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974523
21537	NC_016843	CGT	2	6	1021023	1021028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974523
21538	NC_016843	ACA	2	6	1021045	1021050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974523
21539	NC_016843	AAG	2	6	1021076	1021081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974523
21540	NC_016843	ACC	2	6	1021110	1021115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974523
21541	NC_016843	CAA	2	6	1021157	1021162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974523
21542	NC_016843	CCA	2	6	1021283	1021288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974524
21543	NC_016843	GCAC	2	8	1021346	1021353	25 %	0 %	25 %	50 %	378974524
21544	NC_016843	CATAG	2	10	1021381	1021390	40 %	20 %	20 %	20 %	378974524
21545	NC_016843	GGA	2	6	1021393	1021398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974524
21546	NC_016843	A	6	6	1021398	1021403	100 %	0 %	0 %	0 %	378974524
21547	NC_016843	CG	3	6	1021481	1021486	0 %	0 %	50 %	50 %	378974524
21548	NC_016843	TGC	2	6	1021513	1021518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974524
21549	NC_016843	TCT	2	6	1021580	1021585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974524
21550	NC_016843	CCTG	2	8	1021616	1021623	0 %	25 %	25 %	50 %	378974524
21551	NC_016843	ACC	2	6	1021705	1021710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974524
21552	NC_016843	CCA	2	6	1021821	1021826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974524
21553	NC_016843	CG	4	8	1021829	1021836	0 %	0 %	50 %	50 %	378974524
21554	NC_016843	T	6	6	1021898	1021903	0 %	100 %	0 %	0 %	378974524
21555	NC_016843	CTG	2	6	1021924	1021929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974524
21556	NC_016843	AGGA	2	8	1021932	1021939	50 %	0 %	50 %	0 %	378974524
21557	NC_016843	GA	3	6	1021938	1021943	50 %	0 %	50 %	0 %	378974524
21558	NC_016843	GA	3	6	1021996	1022001	50 %	0 %	50 %	0 %	378974524
21559	NC_016843	AC	3	6	1022008	1022013	50 %	0 %	0 %	50 %	378974524
21560	NC_016843	CG	3	6	1022024	1022029	0 %	0 %	50 %	50 %	378974524
21561	NC_016843	TTCA	2	8	1022069	1022076	25 %	50 %	0 %	25 %	378974524
21562	NC_016843	CTC	2	6	1022101	1022106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21563	NC_016843	GC	3	6	1022125	1022130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21564	NC_016843	ACGG	2	8	1022143	1022150	25 %	0 %	50 %	25 %	378974525
21565	NC_016843	CTTCT	2	10	1022189	1022198	0 %	60 %	0 %	40 %	378974525
21566	NC_016843	GC	3	6	1022199	1022204	0 %	0 %	50 %	50 %	378974525
21567	NC_016843	AGC	2	6	1022208	1022213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974525
21568	NC_016843	GCTC	2	8	1022220	1022227	0 %	25 %	25 %	50 %	378974525
21569	NC_016843	CTT	2	6	1022260	1022265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974525
21570	NC_016843	T	6	6	1022322	1022327	0 %	100 %	0 %	0 %	378974525
21571	NC_016843	CAT	2	6	1022467	1022472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974525
21572	NC_016843	CT	3	6	1022483	1022488	0 %	50 %	0 %	50 %	378974525
21573	NC_016843	CGC	2	6	1022600	1022605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974525
21574	NC_016843	ACC	2	6	1022651	1022656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974525
21575	NC_016843	ACC	2	6	1022729	1022734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974525
21576	NC_016843	GGT	2	6	1022794	1022799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974525
21577	NC_016843	GA	3	6	1022804	1022809	50 %	0 %	50 %	0 %	378974525
21578	NC_016843	GCT	2	6	1022878	1022883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974525
21579	NC_016843	CTG	2	6	1022906	1022911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974525
21580	NC_016843	A	6	6	1022917	1022922	100 %	0 %	0 %	0 %	378974525
21581	NC_016843	GCC	2	6	1022940	1022945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974525
21582	NC_016843	CTG	2	6	1023031	1023036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974525
21583	NC_016843	CGT	2	6	1023086	1023091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974525
21584	NC_016843	AT	3	6	1023119	1023124	50 %	50 %	0 %	0 %	378974525
21585	NC_016843	GAA	2	6	1023126	1023131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974525
21586	NC_016843	CAA	2	6	1023166	1023171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974525
21587	NC_016843	TCA	2	6	1023178	1023183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974525
21588	NC_016843	GGCA	2	8	1023214	1023221	25 %	0 %	50 %	25 %	378974525
21589	NC_016843	CTT	2	6	1023281	1023286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974525
21590	NC_016843	AAG	2	6	1023312	1023317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974525
21591	NC_016843	T	6	6	1023396	1023401	0 %	100 %	0 %	0 %	378974525
21592	NC_016843	TGC	2	6	1023411	1023416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974525
21593	NC_016843	AC	3	6	1023575	1023580	50 %	0 %	0 %	50 %	378974525
21594	NC_016843	GAC	2	6	1023787	1023792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974525
21595	NC_016843	CCA	2	6	1023826	1023831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974525
21596	NC_016843	AGCG	2	8	1023842	1023849	25 %	0 %	50 %	25 %	378974525
21597	NC_016843	GTG	2	6	1023861	1023866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974525
21598	NC_016843	A	6	6	1023972	1023977	100 %	0 %	0 %	0 %	378974525
21599	NC_016843	CAC	2	6	1023989	1023994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974525
21600	NC_016843	CCT	2	6	1024060	1024065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974525
21601	NC_016843	TCT	2	6	1024249	1024254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974525
21602	NC_016843	ACC	2	6	1024286	1024291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974525
21603	NC_016843	CTT	2	6	1024295	1024300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974525
21604	NC_016843	TTA	2	6	1024329	1024334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974525
21605	NC_016843	AAT	2	6	1024349	1024354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974525
21606	NC_016843	AC	3	6	1024418	1024423	50 %	0 %	0 %	50 %	378974525
21607	NC_016843	ATC	2	6	1024430	1024435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974525
21608	NC_016843	GCT	2	6	1024463	1024468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974525
21609	NC_016843	CAT	2	6	1024477	1024482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974525
21610	NC_016843	ACCG	2	8	1024490	1024497	25 %	0 %	25 %	50 %	378974525
21611	NC_016843	TCT	2	6	1024510	1024515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974525
21612	NC_016843	ACC	2	6	1024586	1024591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974525
21613	NC_016843	CTT	2	6	1024622	1024627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974525
21614	NC_016843	AG	3	6	1024669	1024674	50 %	0 %	50 %	0 %	378974525
21615	NC_016843	TCGA	2	8	1024703	1024710	25 %	25 %	25 %	25 %	378974525
21616	NC_016843	TCC	2	6	1024805	1024810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974525
21617	NC_016843	GTA	2	6	1024898	1024903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974525
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21997	NC_016843	CGC	2	6	1042838	1042843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21998	NC_016843	TGC	2	6	1042849	1042854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21999	NC_016843	CAT	2	6	1043104	1043109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974546
22000	NC_016843	GCA	2	6	1043127	1043132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974546

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