MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_016843	GCAA	2	8	926649	926656	50 %	0 %	25 %	25 %	378974435
19502	NC_016843	CA	3	6	926725	926730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19503	NC_016843	TCTT	2	8	926764	926771	0 %	75 %	0 %	25 %	378974436
19504	NC_016843	ATC	2	6	926789	926794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974436
19505	NC_016843	GTC	2	6	926801	926806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974436
19506	NC_016843	GC	3	6	926861	926866	0 %	0 %	50 %	50 %	378974436
19507	NC_016843	T	6	6	926915	926920	0 %	100 %	0 %	0 %	378974436
19508	NC_016843	GGTT	2	8	926941	926948	0 %	50 %	50 %	0 %	378974436
19509	NC_016843	TGC	2	6	927121	927126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974436
19510	NC_016843	CTC	2	6	927146	927151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974436
19511	NC_016843	CAT	2	6	927187	927192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974436
19512	NC_016843	ATCA	2	8	927338	927345	50 %	25 %	0 %	25 %	378974436
19513	NC_016843	GCA	2	6	927366	927371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974436
19514	NC_016843	TGC	2	6	927408	927413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974436
19515	NC_016843	ATTAT	2	10	927429	927438	40 %	60 %	0 %	0 %	378974436
19516	NC_016843	CG	3	6	927520	927525	0 %	0 %	50 %	50 %	378974436
19517	NC_016843	GA	3	6	927547	927552	50 %	0 %	50 %	0 %	378974436
19518	NC_016843	AAG	2	6	927600	927605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974436
19519	NC_016843	ATG	2	6	927678	927683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974436
19520	NC_016843	ATC	2	6	927695	927700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974436
19521	NC_016843	AGT	2	6	927718	927723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974436
19522	NC_016843	GC	3	6	927739	927744	0 %	0 %	50 %	50 %	378974436
19523	NC_016843	ATC	2	6	927773	927778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974436
19524	NC_016843	TTTCC	2	10	927847	927856	0 %	60 %	0 %	40 %	378974436
19525	NC_016843	GCC	2	6	927882	927887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974436
19526	NC_016843	TTC	2	6	927919	927924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974436
19527	NC_016843	GAG	2	6	927926	927931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974436
19528	NC_016843	TTC	2	6	927977	927982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974436
19529	NC_016843	T	7	7	927984	927990	0 %	100 %	0 %	0 %	378974436
19530	NC_016843	ATC	2	6	928002	928007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974436
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19532	NC_016843	GTT	2	6	928307	928312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974436
19533	NC_016843	A	6	6	928324	928329	100 %	0 %	0 %	0 %	378974436
19534	NC_016843	ATC	2	6	928373	928378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974436
19535	NC_016843	CCT	2	6	928426	928431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974436
19536	NC_016843	TCTT	2	8	928470	928477	0 %	75 %	0 %	25 %	378974436
19537	NC_016843	CTGT	2	8	928481	928488	0 %	50 %	25 %	25 %	378974436
19538	NC_016843	TCC	2	6	928494	928499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974436
19539	NC_016843	CAA	2	6	928531	928536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974436
19540	NC_016843	TTGCC	2	10	928545	928554	0 %	40 %	20 %	40 %	378974436
19541	NC_016843	CA	3	6	928605	928610	50 %	0 %	0 %	50 %	378974436
19542	NC_016843	CTT	2	6	928621	928626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974436
19543	NC_016843	GTT	2	6	928683	928688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974436
19544	NC_016843	CAAGCT	2	12	928705	928716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378974436
19545	NC_016843	TTC	2	6	928719	928724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974436
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19547	NC_016843	A	6	6	928783	928788	100 %	0 %	0 %	0 %	378974436
19548	NC_016843	GT	3	6	928916	928921	0 %	50 %	50 %	0 %	378974436
19549	NC_016843	TCTCT	2	10	928943	928952	0 %	60 %	0 %	40 %	378974436
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19551	NC_016843	ACACC	2	10	929050	929059	40 %	0 %	0 %	60 %	378974436
19552	NC_016843	CCA	2	6	929112	929117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974436
19553	NC_016843	GT	3	6	929118	929123	0 %	50 %	50 %	0 %	378974436
19554	NC_016843	T	7	7	929258	929264	0 %	100 %	0 %	0 %	378974436
19555	NC_016843	CGAT	2	8	929358	929365	25 %	25 %	25 %	25 %	378974436
19556	NC_016843	CTGA	2	8	929372	929379	25 %	25 %	25 %	25 %	378974436
19557	NC_016843	CAA	2	6	929407	929412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974436
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19559	NC_016843	A	6	6	929495	929500	100 %	0 %	0 %	0 %	378974436
19560	NC_016843	GCTC	2	8	929512	929519	0 %	25 %	25 %	50 %	378974436
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19565	NC_016843	GC	3	6	929640	929645	0 %	0 %	50 %	50 %	378974436
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19579	NC_016843	CA	4	8	930378	930385	50 %	0 %	0 %	50 %	378974436
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19585	NC_016843	ACAGGC	2	12	930612	930623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974436
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19587	NC_016843	CAG	3	9	930869	930877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974436
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19589	NC_016843	GCA	2	6	931008	931013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974436
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19603	NC_016843	CTG	2	6	931618	931623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974437
19604	NC_016843	CGC	2	6	931642	931647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974437
19605	NC_016843	ACG	2	6	931666	931671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974437
19606	NC_016843	CAGC	2	8	931674	931681	25 %	0 %	25 %	50 %	378974437
19607	NC_016843	CGA	2	6	931690	931695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974437
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19610	NC_016843	T	6	6	931868	931873	0 %	100 %	0 %	0 %	378974437
19611	NC_016843	CTG	2	6	931879	931884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974437
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19991	NC_016843	TGC	2	6	949479	949484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974451
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