MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016843	CCTT	2	8	76413	76420	0 %	50 %	0 %	50 %	378973638
1503	NC_016843	GTCA	2	8	76425	76432	25 %	25 %	25 %	25 %	378973638
1504	NC_016843	TCG	2	6	76441	76446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973638
1505	NC_016843	AT	3	6	76460	76465	50 %	50 %	0 %	0 %	378973638
1506	NC_016843	TCA	2	6	76495	76500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973638
1507	NC_016843	AAG	2	6	76503	76508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973638
1508	NC_016843	CGT	2	6	76525	76530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973638
1509	NC_016843	C	6	6	76549	76554	0 %	0 %	0 %	100 %	378973638
1510	NC_016843	GC	3	6	76580	76585	0 %	0 %	50 %	50 %	378973638
1511	NC_016843	GAAAA	2	10	76659	76668	80 %	0 %	20 %	0 %	378973638
1512	NC_016843	ACGT	2	8	76676	76683	25 %	25 %	25 %	25 %	378973638
1513	NC_016843	TTA	2	6	76765	76770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973638
1514	NC_016843	CGA	2	6	76771	76776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973638
1515	NC_016843	CAT	2	6	76872	76877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973638
1516	NC_016843	AAT	2	6	76908	76913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973638
1517	NC_016843	CA	3	6	76931	76936	50 %	0 %	0 %	50 %	378973638
1518	NC_016843	T	6	6	76971	76976	0 %	100 %	0 %	0 %	378973638
1519	NC_016843	AAG	2	6	76992	76997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973638
1520	NC_016843	T	9	9	77003	77011	0 %	100 %	0 %	0 %	378973638
1521	NC_016843	CTC	2	6	77106	77111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973638
1522	NC_016843	GCG	2	6	77118	77123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973638
1523	NC_016843	TCC	2	6	77135	77140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973638
1524	NC_016843	GCA	2	6	77170	77175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973638
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1526	NC_016843	GA	3	6	77253	77258	50 %	0 %	50 %	0 %	378973638
1527	NC_016843	GGC	2	6	77339	77344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973638
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1529	NC_016843	CCA	2	6	77357	77362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973638
1530	NC_016843	TGC	2	6	77421	77426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973638
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1532	NC_016843	TCC	2	6	77506	77511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973638
1533	NC_016843	GCG	2	6	77544	77549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973638
1534	NC_016843	AT	3	6	77572	77577	50 %	50 %	0 %	0 %	378973638
1535	NC_016843	CG	3	6	77624	77629	0 %	0 %	50 %	50 %	378973638
1536	NC_016843	GT	3	6	77695	77700	0 %	50 %	50 %	0 %	378973638
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1541	NC_016843	ACG	2	6	77949	77954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973638
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1544	NC_016843	GTA	2	6	78031	78036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973638
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1548	NC_016843	GCG	2	6	78330	78335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973638
1549	NC_016843	T	6	6	78383	78388	0 %	100 %	0 %	0 %	378973638
1550	NC_016843	GA	3	6	78398	78403	50 %	0 %	50 %	0 %	378973638
1551	NC_016843	TCC	2	6	78445	78450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973638
1552	NC_016843	GCTT	2	8	78507	78514	0 %	50 %	25 %	25 %	378973638
1553	NC_016843	CTGT	2	8	78526	78533	0 %	50 %	25 %	25 %	378973638
1554	NC_016843	T	6	6	78566	78571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016843	T	6	6	78587	78592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016843	AGT	2	6	78618	78623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016843	A	6	6	78747	78752	100 %	0 %	0 %	0 %	378973639
1558	NC_016843	GAA	2	6	78859	78864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973639
1559	NC_016843	T	6	6	78874	78879	0 %	100 %	0 %	0 %	378973639
1560	NC_016843	TGA	2	6	78907	78912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973639
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1562	NC_016843	ACG	2	6	78957	78962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973639
1563	NC_016843	GT	3	6	79030	79035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016843	GTC	2	6	79049	79054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_016843	GCT	2	6	79109	79114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973640
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1568	NC_016843	GAG	2	6	79172	79177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973640
1569	NC_016843	GCGCC	2	10	79348	79357	0 %	0 %	40 %	60 %	378973640
1570	NC_016843	ATG	2	6	79383	79388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973640
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1572	NC_016843	AGG	2	6	79494	79499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973640
1573	NC_016843	GCT	2	6	79594	79599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973640
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1592	NC_016843	ACA	2	6	80607	80612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973640
1593	NC_016843	CG	3	6	80613	80618	0 %	0 %	50 %	50 %	378973640
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1596	NC_016843	GCGT	2	8	80850	80857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_016843	TGGTG	2	10	80862	80871	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_016843	CGTGT	2	10	81004	81013	0 %	40 %	40 %	20 %	378973642
1603	NC_016843	CTT	2	6	81022	81027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973642
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1607	NC_016843	GC	3	6	81219	81224	0 %	0 %	50 %	50 %	378973642
1608	NC_016843	GTG	2	6	81262	81267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973642
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1610	NC_016843	T	6	6	81345	81350	0 %	100 %	0 %	0 %	378973642
1611	NC_016843	ATG	2	6	81559	81564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973642
1612	NC_016843	CG	3	6	81597	81602	0 %	0 %	50 %	50 %	378973642
1613	NC_016843	CAG	2	6	81639	81644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973642
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1621	NC_016843	GTG	2	6	82059	82064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973642
1622	NC_016843	G	6	6	82198	82203	0 %	0 %	100 %	0 %	378973642
1623	NC_016843	GTGA	2	8	82251	82258	25 %	25 %	50 %	0 %	378973642
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