MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_016843	AGCCG	2	10	901613	901622	20 %	0 %	40 %	40 %	378974413
19002	NC_016843	ACG	2	6	901631	901636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974413
19003	NC_016843	AC	3	6	901702	901707	50 %	0 %	0 %	50 %	378974413
19004	NC_016843	TCT	2	6	901718	901723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974413
19005	NC_016843	GAAA	2	8	901729	901736	75 %	0 %	25 %	0 %	378974413
19006	NC_016843	TGA	2	6	901784	901789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974413
19007	NC_016843	TGC	2	6	901852	901857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974413
19008	NC_016843	AC	3	6	901858	901863	50 %	0 %	0 %	50 %	378974413
19009	NC_016843	A	6	6	901884	901889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19010	NC_016843	AGC	2	6	901910	901915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_016843	CG	3	6	901996	902001	0 %	0 %	50 %	50 %	378974414
19012	NC_016843	CTG	2	6	902003	902008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974414
19013	NC_016843	TATCAG	2	12	902083	902094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378974414
19014	NC_016843	CCT	2	6	902099	902104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974414
19015	NC_016843	TTC	2	6	902117	902122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974414
19016	NC_016843	TAC	2	6	902254	902259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974414
19017	NC_016843	GCG	2	6	902265	902270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974414
19018	NC_016843	CG	3	6	902273	902278	0 %	0 %	50 %	50 %	378974414
19019	NC_016843	AC	4	8	902351	902358	50 %	0 %	0 %	50 %	378974414
19020	NC_016843	GCG	2	6	902361	902366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974414
19021	NC_016843	GCG	2	6	902381	902386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974414
19022	NC_016843	CG	3	6	902448	902453	0 %	0 %	50 %	50 %	378974414
19023	NC_016843	CGTG	2	8	902486	902493	0 %	25 %	50 %	25 %	378974414
19024	NC_016843	AAC	2	6	902511	902516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974414
19025	NC_016843	GC	3	6	902520	902525	0 %	0 %	50 %	50 %	378974414
19026	NC_016843	TCG	2	6	902579	902584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974414
19027	NC_016843	ACA	2	6	902614	902619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974414
19028	NC_016843	GACAC	2	10	902630	902639	40 %	0 %	20 %	40 %	378974414
19029	NC_016843	ACT	2	6	902706	902711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974415
19030	NC_016843	CAC	2	6	902734	902739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974415
19031	NC_016843	T	6	6	902743	902748	0 %	100 %	0 %	0 %	378974415
19032	NC_016843	CG	3	6	902752	902757	0 %	0 %	50 %	50 %	378974415
19033	NC_016843	CCGTC	2	10	902766	902775	0 %	20 %	20 %	60 %	378974415
19034	NC_016843	CTC	2	6	902841	902846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974415
19035	NC_016843	GTA	2	6	902879	902884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974415
19036	NC_016843	ACAA	2	8	902900	902907	75 %	0 %	0 %	25 %	378974415
19037	NC_016843	CCG	2	6	902984	902989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974415
19038	NC_016843	CG	4	8	902995	903002	0 %	0 %	50 %	50 %	378974415
19039	NC_016843	AATT	2	8	903081	903088	50 %	50 %	0 %	0 %	378974415
19040	NC_016843	CGC	2	6	903149	903154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974415
19041	NC_016843	AAG	2	6	903221	903226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974415
19042	NC_016843	T	6	6	903252	903257	0 %	100 %	0 %	0 %	378974415
19043	NC_016843	CAA	2	6	903339	903344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974415
19044	NC_016843	ATC	2	6	903358	903363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974415
19045	NC_016843	GCC	2	6	903364	903369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974415
19046	NC_016843	A	6	6	903407	903412	100 %	0 %	0 %	0 %	378974415
19047	NC_016843	GAAAG	2	10	903447	903456	60 %	0 %	40 %	0 %	378974415
19048	NC_016843	CCAA	2	8	903558	903565	50 %	0 %	0 %	50 %	378974415
19049	NC_016843	ATT	2	6	903571	903576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974415
19050	NC_016843	GAAA	2	8	903605	903612	75 %	0 %	25 %	0 %	378974415
19051	NC_016843	CG	3	6	903710	903715	0 %	0 %	50 %	50 %	378974415
19052	NC_016843	CA	3	6	903756	903761	50 %	0 %	0 %	50 %	378974415
19053	NC_016843	ACT	2	6	903805	903810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974415
19054	NC_016843	TAA	2	6	903894	903899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974415
19055	NC_016843	GAC	2	6	904073	904078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974416
19056	NC_016843	TC	3	6	904106	904111	0 %	50 %	0 %	50 %	378974416
19057	NC_016843	TGC	2	6	904188	904193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974416
19058	NC_016843	CCA	2	6	904244	904249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974416
19059	NC_016843	GTT	2	6	904308	904313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974416
19060	NC_016843	T	6	6	904372	904377	0 %	100 %	0 %	0 %	378974416
19061	NC_016843	GCG	2	6	904583	904588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974416
19062	NC_016843	CG	3	6	904604	904609	0 %	0 %	50 %	50 %	378974416
19063	NC_016843	CCT	2	6	904621	904626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974416
19064	NC_016843	GC	3	6	904630	904635	0 %	0 %	50 %	50 %	378974416
19065	NC_016843	CGC	2	6	904638	904643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974416
19066	NC_016843	ACTG	2	8	904648	904655	25 %	25 %	25 %	25 %	378974416
19067	NC_016843	CATA	2	8	904694	904701	50 %	25 %	0 %	25 %	378974416
19068	NC_016843	CTG	2	6	904704	904709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974416
19069	NC_016843	CA	3	6	904980	904985	50 %	0 %	0 %	50 %	378974416
19070	NC_016843	CCTG	2	8	905041	905048	0 %	25 %	25 %	50 %	378974416
19071	NC_016843	GCA	2	6	905054	905059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974416
19072	NC_016843	GCG	2	6	905204	905209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974416
19073	NC_016843	TCC	2	6	905214	905219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974416
19074	NC_016843	AATCC	2	10	905253	905262	40 %	20 %	0 %	40 %	378974416
19075	NC_016843	TCA	2	6	905345	905350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974416
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19078	NC_016843	CAC	2	6	905511	905516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974416
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19080	NC_016843	CG	3	6	905570	905575	0 %	0 %	50 %	50 %	378974416
19081	NC_016843	GCG	2	6	905591	905596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974416
19082	NC_016843	TCT	2	6	905611	905616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974416
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19085	NC_016843	CTGCGC	2	12	905726	905737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974416
19086	NC_016843	CTA	2	6	905738	905743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974416
19087	NC_016843	CCAA	2	8	905851	905858	50 %	0 %	0 %	50 %	378974416
19088	NC_016843	CACG	2	8	905915	905922	25 %	0 %	25 %	50 %	378974416
19089	NC_016843	GCA	3	9	905942	905950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974416
19090	NC_016843	GCA	2	6	905956	905961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974416
19091	NC_016843	CCTGC	2	10	905966	905975	0 %	20 %	20 %	60 %	378974416
19092	NC_016843	T	6	6	906013	906018	0 %	100 %	0 %	0 %	378974416
19093	NC_016843	GCG	2	6	906092	906097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974416
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19095	NC_016843	GCA	2	6	906202	906207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974416
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19100	NC_016843	GCAC	2	8	906334	906341	25 %	0 %	25 %	50 %	378974416
19101	NC_016843	CCA	2	6	906530	906535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974416
19102	NC_016843	GCG	2	6	906539	906544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974416
19103	NC_016843	AG	3	6	906585	906590	50 %	0 %	50 %	0 %	378974416
19104	NC_016843	CGT	2	6	906611	906616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974416
19105	NC_016843	CG	3	6	906713	906718	0 %	0 %	50 %	50 %	378974416
19106	NC_016843	GAG	2	6	906749	906754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974416
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19108	NC_016843	CA	3	6	906820	906825	50 %	0 %	0 %	50 %	378974416
19109	NC_016843	ATGC	2	8	906843	906850	25 %	25 %	25 %	25 %	378974416
19110	NC_016843	TCC	2	6	906857	906862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19111	NC_016843	GT	4	8	906887	906894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_016843	CTG	2	6	907004	907009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974417
19113	NC_016843	CTG	3	9	907049	907057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974417
19114	NC_016843	GCG	2	6	907129	907134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974417
19115	NC_016843	CGG	2	6	907137	907142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974417
19116	NC_016843	CA	3	6	907144	907149	50 %	0 %	0 %	50 %	378974417
19117	NC_016843	GTA	2	6	907156	907161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974417
19118	NC_016843	CGC	2	6	907257	907262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974417
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19122	NC_016843	A	7	7	907447	907453	100 %	0 %	0 %	0 %	378974417
19123	NC_016843	TGC	2	6	907494	907499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974417
19124	NC_016843	GCT	2	6	907507	907512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974417
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19126	NC_016843	GCAC	2	8	907635	907642	25 %	0 %	25 %	50 %	378974417
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19128	NC_016843	GCG	2	6	907675	907680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974417
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