MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15003	NC_016843	TAT	2	6	706704	706709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974218
15004	NC_016843	GC	3	6	706711	706716	0 %	0 %	50 %	50 %	378974218
15005	NC_016843	CGA	2	6	706782	706787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974218
15006	NC_016843	TCA	2	6	706841	706846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974218
15007	NC_016843	TCG	2	6	706859	706864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974218
15008	NC_016843	AGT	2	6	706941	706946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974218
15009	NC_016843	TACG	2	8	706950	706957	25 %	25 %	25 %	25 %	378974218
15010	NC_016843	GCA	2	6	707044	707049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974218
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15012	NC_016843	CAC	2	6	707107	707112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974218
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15014	NC_016843	A	7	7	707160	707166	100 %	0 %	0 %	0 %	378974218
15015	NC_016843	ACTG	2	8	707194	707201	25 %	25 %	25 %	25 %	378974218
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15021	NC_016843	AT	3	6	707639	707644	50 %	50 %	0 %	0 %	378974219
15022	NC_016843	CGG	2	6	707682	707687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974219
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15030	NC_016843	TCCT	2	8	708806	708813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15039	NC_016843	TGC	2	6	709295	709300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974221
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15041	NC_016843	AG	3	6	709415	709420	50 %	0 %	50 %	0 %	378974221
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15043	NC_016843	ACT	2	6	709453	709458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974221
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15049	NC_016843	CTG	2	6	709750	709755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974221
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15061	NC_016843	A	6	6	710266	710271	100 %	0 %	0 %	0 %	378974221
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15065	NC_016843	ACC	2	6	710549	710554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974222
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15078	NC_016843	TGCA	2	8	711509	711516	25 %	25 %	25 %	25 %	378974222
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15091	NC_016843	TGA	2	6	712154	712159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974223
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15094	NC_016843	AGAA	2	8	712285	712292	75 %	0 %	25 %	0 %	378974223
15095	NC_016843	ATGCA	2	10	712308	712317	40 %	20 %	20 %	20 %	378974223
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15102	NC_016843	GC	3	6	712579	712584	0 %	0 %	50 %	50 %	378974223
15103	NC_016843	CG	3	6	712621	712626	0 %	0 %	50 %	50 %	378974223
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15106	NC_016843	CGCGC	2	10	712890	712899	0 %	0 %	40 %	60 %	378974223
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15109	NC_016843	A	7	7	713022	713028	100 %	0 %	0 %	0 %	378974223
15110	NC_016843	ACGT	2	8	713071	713078	25 %	25 %	25 %	25 %	378974223
15111	NC_016843	ACA	2	6	713126	713131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974223
15112	NC_016843	GCT	2	6	713164	713169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974223
15113	NC_016843	CCAAA	2	10	713222	713231	60 %	0 %	0 %	40 %	378974223
15114	NC_016843	GC	3	6	713256	713261	0 %	0 %	50 %	50 %	378974223
15115	NC_016843	AAG	2	6	713450	713455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974223
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15117	NC_016843	CTT	2	6	713471	713476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974223
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15122	NC_016843	CAG	2	6	713595	713600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974223
15123	NC_016843	ATA	2	6	713720	713725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974224
15124	NC_016843	TCC	2	6	713909	713914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974224
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15127	NC_016843	CGC	2	6	713991	713996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974224
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15140	NC_016843	GCA	2	6	714756	714761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974225
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15142	NC_016843	AGG	2	6	714840	714845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974225
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15161	NC_016843	GAAA	2	8	716064	716071	75 %	0 %	25 %	0 %	378974226
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15229	NC_016843	GC	3	6	719935	719940	0 %	0 %	50 %	50 %	378974229
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15237	NC_016843	ATC	2	6	720239	720244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974229
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15240	NC_016843	ACT	2	6	720334	720339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974229
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15242	NC_016843	TTCT	2	8	720401	720408	0 %	75 %	0 %	25 %	378974230
15243	NC_016843	TC	3	6	720417	720422	0 %	50 %	0 %	50 %	378974230
15244	NC_016843	CCTGTA	2	12	720462	720473	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974230
15245	NC_016843	TAC	2	6	720484	720489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974230
15246	NC_016843	AAC	2	6	720518	720523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974230
15247	NC_016843	ATG	2	6	720545	720550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974230
15248	NC_016843	CAT	2	6	720639	720644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974230
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15250	NC_016843	AG	3	6	720708	720713	50 %	0 %	50 %	0 %	378974230
15251	NC_016843	TAT	2	6	720763	720768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974230
15252	NC_016843	GGCA	2	8	720777	720784	25 %	0 %	50 %	25 %	378974230
15253	NC_016843	A	6	6	720796	720801	100 %	0 %	0 %	0 %	378974230
15254	NC_016843	CG	3	6	720816	720821	0 %	0 %	50 %	50 %	378974230
15255	NC_016843	TCT	2	6	720833	720838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974230
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15257	NC_016843	ATG	2	6	720868	720873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974230
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15259	NC_016843	A	6	6	720933	720938	100 %	0 %	0 %	0 %	378974230
15260	NC_016843	GCAG	2	8	720954	720961	25 %	0 %	50 %	25 %	378974230
15261	NC_016843	CGGA	2	8	721010	721017	25 %	0 %	50 %	25 %	378974230
15262	NC_016843	TGT	2	6	721047	721052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974230
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15264	NC_016843	CTT	2	6	721116	721121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974230
15265	NC_016843	CTT	2	6	721215	721220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974230
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15270	NC_016843	GCA	2	6	721366	721371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974230
15271	NC_016843	TC	4	8	721530	721537	0 %	50 %	0 %	50 %	378974231
15272	NC_016843	CGC	2	6	721611	721616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974231
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15274	NC_016843	CTT	2	6	721705	721710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974232
15275	NC_016843	CGA	2	6	721724	721729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974232
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15283	NC_016843	CTG	2	6	722510	722515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974233
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15293	NC_016843	TAC	2	6	723138	723143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974233
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15300	NC_016843	TG	3	6	723380	723385	0 %	50 %	50 %	0 %	378974233
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15308	NC_016843	GT	3	6	723691	723696	0 %	50 %	50 %	0 %	378974234
15309	NC_016843	GCC	2	6	723745	723750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974234
15310	NC_016843	ACAGC	2	10	723818	723827	40 %	0 %	20 %	40 %	378974234
15311	NC_016843	TCCA	2	8	723838	723845	25 %	25 %	0 %	50 %	378974234
15312	NC_016843	CCTG	2	8	723886	723893	0 %	25 %	25 %	50 %	378974234
15313	NC_016843	CT	3	6	723917	723922	0 %	50 %	0 %	50 %	378974234
15314	NC_016843	TGC	2	6	723951	723956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974234
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15327	NC_016843	CCA	2	6	724676	724681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974234
15328	NC_016843	TGA	3	9	724849	724857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974234
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15330	NC_016843	GCCA	2	8	724937	724944	25 %	0 %	25 %	50 %	378974234
15331	NC_016843	TCC	2	6	724981	724986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974234
15332	NC_016843	GTCT	2	8	725052	725059	0 %	50 %	25 %	25 %	378974234
15333	NC_016843	GAG	2	6	725079	725084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974234
15334	NC_016843	CG	3	6	725098	725103	0 %	0 %	50 %	50 %	378974234
15335	NC_016843	CGAA	2	8	725180	725187	50 %	0 %	25 %	25 %	378974234
15336	NC_016843	GGC	2	6	725204	725209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974234
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15339	NC_016843	CCTC	2	8	725368	725375	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15340	NC_016843	CTC	2	6	725401	725406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15341	NC_016843	AAGAC	2	10	725440	725449	60 %	0 %	20 %	20 %	378974235
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15344	NC_016843	T	6	6	725584	725589	0 %	100 %	0 %	0 %	378974235
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15347	NC_016843	CG	3	6	725655	725660	0 %	0 %	50 %	50 %	378974235
15348	NC_016843	AAG	2	6	725674	725679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974235
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15350	NC_016843	AC	3	6	725834	725839	50 %	0 %	0 %	50 %	378974235
15351	NC_016843	CAA	2	6	725864	725869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974235
15352	NC_016843	CAA	2	6	725882	725887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974235
15353	NC_016843	CCTGC	2	10	725900	725909	0 %	20 %	20 %	60 %	378974235
15354	NC_016843	CTC	2	6	725943	725948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15355	NC_016843	A	6	6	725999	726004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15356	NC_016843	CTG	2	6	726050	726055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15357	NC_016843	CGGC	2	8	726066	726073	0 %	0 %	50 %	50 %	378974236
15358	NC_016843	CTT	2	6	726110	726115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974236
15359	NC_016843	CG	3	6	726124	726129	0 %	0 %	50 %	50 %	378974236
15360	NC_016843	TGG	2	6	726169	726174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974236
15361	NC_016843	CGTA	2	8	726324	726331	25 %	25 %	25 %	25 %	378974236
15362	NC_016843	GCA	2	6	726358	726363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974236
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