MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016843	TC	3	6	660212	660217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14002	NC_016843	CAC	2	6	660221	660226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14003	NC_016843	CA	3	6	660277	660282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14004	NC_016843	GCA	2	6	660353	660358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_016843	CCGC	2	8	660518	660525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14006	NC_016843	CAG	2	6	660533	660538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_016843	GCC	2	6	660546	660551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974181
14008	NC_016843	CAC	2	6	660567	660572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974181
14009	NC_016843	GC	3	6	660578	660583	0 %	0 %	50 %	50 %	378974181
14010	NC_016843	GC	3	6	660586	660591	0 %	0 %	50 %	50 %	378974181
14011	NC_016843	CCA	2	6	660638	660643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974181
14012	NC_016843	GC	3	6	660646	660651	0 %	0 %	50 %	50 %	378974181
14013	NC_016843	GA	3	6	660705	660710	50 %	0 %	50 %	0 %	378974181
14014	NC_016843	CCG	2	6	660809	660814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974181
14015	NC_016843	CAC	2	6	660819	660824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974181
14016	NC_016843	CA	3	6	660842	660847	50 %	0 %	0 %	50 %	378974181
14017	NC_016843	CAG	2	6	660974	660979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974181
14018	NC_016843	CCT	2	6	660998	661003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974181
14019	NC_016843	TCA	2	6	661009	661014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974181
14020	NC_016843	CCT	2	6	661037	661042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974181
14021	NC_016843	CAC	2	6	661104	661109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974181
14022	NC_016843	TCA	2	6	661145	661150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974181
14023	NC_016843	CTG	2	6	661200	661205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974181
14024	NC_016843	CAAAAG	2	12	661223	661234	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378974181
14025	NC_016843	AAG	3	9	661249	661257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974181
14026	NC_016843	GCT	2	6	661259	661264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974181
14027	NC_016843	TCC	2	6	661277	661282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14028	NC_016843	GCACG	2	10	661326	661335	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14029	NC_016843	CG	3	6	661334	661339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14030	NC_016843	CAC	2	6	661363	661368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14031	NC_016843	AC	3	6	661406	661411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14032	NC_016843	CG	3	6	661478	661483	0 %	0 %	50 %	50 %	378974182
14033	NC_016843	AGA	2	6	661558	661563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974182
14034	NC_016843	CTC	2	6	661578	661583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974182
14035	NC_016843	AG	3	6	661588	661593	50 %	0 %	50 %	0 %	378974182
14036	NC_016843	ACG	2	6	661613	661618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_016843	GCG	2	6	661652	661657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_016843	GCT	2	6	661700	661705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_016843	GCGT	2	8	661746	661753	0 %	25 %	50 %	25 %	378974183
14040	NC_016843	C	6	6	661790	661795	0 %	0 %	0 %	100 %	378974183
14041	NC_016843	TCC	2	6	661983	661988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974183
14042	NC_016843	CGCT	2	8	661998	662005	0 %	25 %	25 %	50 %	378974183
14043	NC_016843	TAC	2	6	662023	662028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974183
14044	NC_016843	TCCCC	2	10	662061	662070	0 %	20 %	0 %	80 %	378974183
14045	NC_016843	GC	3	6	662095	662100	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14046	NC_016843	CTG	2	6	662130	662135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974183
14047	NC_016843	AGA	2	6	662151	662156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974183
14048	NC_016843	TGCG	2	8	662178	662185	0 %	25 %	50 %	25 %	378974183
14049	NC_016843	GC	5	10	662197	662206	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14050	NC_016843	CA	3	6	662297	662302	50 %	0 %	0 %	50 %	378974183
14051	NC_016843	ACT	2	6	662354	662359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974183
14052	NC_016843	GC	3	6	662378	662383	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14053	NC_016843	GGCA	2	8	662404	662411	25 %	0 %	50 %	25 %	378974183
14054	NC_016843	GAC	2	6	662435	662440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974183
14055	NC_016843	T	6	6	662441	662446	0 %	100 %	0 %	0 %	378974183
14056	NC_016843	GC	3	6	662456	662461	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14057	NC_016843	GCC	2	6	662562	662567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974183
14058	NC_016843	TGG	2	6	662586	662591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974183
14059	NC_016843	ACTG	2	8	662618	662625	25 %	25 %	25 %	25 %	378974183
14060	NC_016843	GCA	2	6	662666	662671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974183
14061	NC_016843	GC	3	6	662682	662687	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14062	NC_016843	CCTT	2	8	662697	662704	0 %	50 %	0 %	50 %	378974183
14063	NC_016843	GC	3	6	662710	662715	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14064	NC_016843	GCA	2	6	662719	662724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974183
14065	NC_016843	GC	3	6	662733	662738	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14066	NC_016843	AC	3	6	662745	662750	50 %	0 %	0 %	50 %	378974183
14067	NC_016843	CG	3	6	662758	662763	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14068	NC_016843	GC	3	6	662771	662776	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14069	NC_016843	CG	3	6	662831	662836	0 %	0 %	50 %	50 %	378974183
14070	NC_016843	ACT	2	6	662872	662877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974183
14071	NC_016843	T	6	6	662947	662952	0 %	100 %	0 %	0 %	378974183
14072	NC_016843	AGA	2	6	662956	662961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974183
14073	NC_016843	TGC	2	6	663240	663245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974183
14074	NC_016843	CGC	2	6	663297	663302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974183
14075	NC_016843	CGG	2	6	663392	663397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974184
14076	NC_016843	ACGC	2	8	663400	663407	25 %	0 %	25 %	50 %	378974184
14077	NC_016843	CGG	2	6	663420	663425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974184
14078	NC_016843	CTC	2	6	663433	663438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974184
14079	NC_016843	CAG	2	6	663462	663467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974184
14080	NC_016843	GTCAG	2	10	663476	663485	20 %	20 %	40 %	20 %	378974184
14081	NC_016843	CTC	2	6	663500	663505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974184
14082	NC_016843	GTC	2	6	663511	663516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974184
14083	NC_016843	GCA	2	6	663518	663523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974184
14084	NC_016843	TG	3	6	663528	663533	0 %	50 %	50 %	0 %	378974184
14085	NC_016843	CGC	2	6	663564	663569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974184
14086	NC_016843	CCG	2	6	663632	663637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974184
14087	NC_016843	GCC	2	6	663646	663651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974184
14088	NC_016843	CGA	2	6	663670	663675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974184
14089	NC_016843	AGA	2	6	663730	663735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974184
14090	NC_016843	GC	3	6	663752	663757	0 %	0 %	50 %	50 %	378974184
14091	NC_016843	CA	3	6	663790	663795	50 %	0 %	0 %	50 %	378974184
14092	NC_016843	TG	3	6	663798	663803	0 %	50 %	50 %	0 %	378974184
14093	NC_016843	GTT	2	6	663814	663819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974184
14094	NC_016843	GC	3	6	663841	663846	0 %	0 %	50 %	50 %	378974184
14095	NC_016843	AGA	2	6	663949	663954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974184
14096	NC_016843	AGG	2	6	664077	664082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974184
14097	NC_016843	CGG	2	6	664111	664116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974184
14098	NC_016843	CTTT	2	8	664174	664181	0 %	75 %	0 %	25 %	378974184
14099	NC_016843	CTGCTC	2	12	664218	664229	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378974184
14100	NC_016843	GCG	2	6	664241	664246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974184
14101	NC_016843	GACGC	2	10	664283	664292	20 %	0 %	40 %	40 %	378974184
14102	NC_016843	CAGC	2	8	664338	664345	25 %	0 %	25 %	50 %	378974184
14103	NC_016843	GC	4	8	664428	664435	0 %	0 %	50 %	50 %	378974184
14104	NC_016843	CTC	2	6	664446	664451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974184
14105	NC_016843	GGT	2	6	664465	664470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974184
14106	NC_016843	A	6	6	664548	664553	100 %	0 %	0 %	0 %	378974184
14107	NC_016843	AGTT	2	8	664723	664730	25 %	50 %	25 %	0 %	378974184
14108	NC_016843	CTTG	2	8	664738	664745	0 %	50 %	25 %	25 %	378974184
14109	NC_016843	CAA	2	6	664769	664774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974184
14110	NC_016843	GCG	2	6	664833	664838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974184
14111	NC_016843	CA	4	8	664900	664907	50 %	0 %	0 %	50 %	378974184
14112	NC_016843	CGG	3	9	664912	664920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974184
14113	NC_016843	AC	3	6	664958	664963	50 %	0 %	0 %	50 %	378974184
14114	NC_016843	TAC	2	6	665048	665053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974184
14115	NC_016843	TC	3	6	665055	665060	0 %	50 %	0 %	50 %	378974184
14116	NC_016843	GT	3	6	665067	665072	0 %	50 %	50 %	0 %	378974184
14117	NC_016843	GC	3	6	665123	665128	0 %	0 %	50 %	50 %	378974184
14118	NC_016843	CAC	2	6	665185	665190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974184
14119	NC_016843	CT	3	6	665267	665272	0 %	50 %	0 %	50 %	378974184
14120	NC_016843	TTA	2	6	665340	665345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974184
14121	NC_016843	ACAT	2	8	665495	665502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14122	NC_016843	CTC	2	6	665561	665566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974185
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14124	NC_016843	ACG	2	6	665763	665768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974185
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