MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016843	GCT	2	6	637524	637529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974162
13502	NC_016843	TTTC	2	8	637656	637663	0 %	75 %	0 %	25 %	378974162
13503	NC_016843	GAATG	2	10	637726	637735	40 %	20 %	40 %	0 %	378974162
13504	NC_016843	T	6	6	637749	637754	0 %	100 %	0 %	0 %	378974162
13505	NC_016843	CAG	2	6	637871	637876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974162
13506	NC_016843	TTCA	2	8	637882	637889	25 %	50 %	0 %	25 %	378974162
13507	NC_016843	CAC	2	6	637900	637905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974162
13508	NC_016843	CCACC	2	10	637920	637929	20 %	0 %	0 %	80 %	378974162
13509	NC_016843	CG	3	6	637956	637961	0 %	0 %	50 %	50 %	378974162
13510	NC_016843	CA	3	6	637979	637984	50 %	0 %	0 %	50 %	378974162
13511	NC_016843	ACA	2	6	638022	638027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974162
13512	NC_016843	GTG	2	6	638044	638049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974162
13513	NC_016843	GC	3	6	638131	638136	0 %	0 %	50 %	50 %	378974162
13514	NC_016843	GGA	2	6	638322	638327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974162
13515	NC_016843	CG	3	6	638334	638339	0 %	0 %	50 %	50 %	378974162
13516	NC_016843	TATT	2	8	638341	638348	25 %	75 %	0 %	0 %	378974162
13517	NC_016843	GTA	2	6	638398	638403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974162
13518	NC_016843	GC	4	8	638419	638426	0 %	0 %	50 %	50 %	378974162
13519	NC_016843	CG	3	6	638428	638433	0 %	0 %	50 %	50 %	378974162
13520	NC_016843	CTC	2	6	638474	638479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974162
13521	NC_016843	AC	3	6	638701	638706	50 %	0 %	0 %	50 %	378974162
13522	NC_016843	CTG	2	6	638740	638745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974162
13523	NC_016843	TCG	2	6	638775	638780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974162
13524	NC_016843	CTT	2	6	638788	638793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974162
13525	NC_016843	GCAG	2	8	638796	638803	25 %	0 %	50 %	25 %	378974162
13526	NC_016843	TGCA	2	8	638849	638856	25 %	25 %	25 %	25 %	378974162
13527	NC_016843	GCG	2	6	638871	638876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974162
13528	NC_016843	AAG	2	6	638939	638944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974162
13529	NC_016843	A	6	6	639086	639091	100 %	0 %	0 %	0 %	378974163
13530	NC_016843	TG	3	6	639125	639130	0 %	50 %	50 %	0 %	378974163
13531	NC_016843	GCG	2	6	639157	639162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974163
13532	NC_016843	GGT	2	6	639269	639274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974163
13533	NC_016843	CG	3	6	639354	639359	0 %	0 %	50 %	50 %	378974163
13534	NC_016843	CAGA	2	8	639391	639398	50 %	0 %	25 %	25 %	378974163
13535	NC_016843	GAA	2	6	639569	639574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974163
13536	NC_016843	TGC	2	6	639587	639592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13537	NC_016843	GTG	2	6	639621	639626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974163
13538	NC_016843	ATTGG	2	10	639726	639735	20 %	40 %	40 %	0 %	378974163
13539	NC_016843	GCG	2	6	639744	639749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974163
13540	NC_016843	AC	3	6	639902	639907	50 %	0 %	0 %	50 %	378974163
13541	NC_016843	GCA	2	6	639944	639949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13542	NC_016843	A	6	6	639949	639954	100 %	0 %	0 %	0 %	378974163
13543	NC_016843	CAATC	2	10	640021	640030	40 %	20 %	0 %	40 %	378974163
13544	NC_016843	GTG	2	6	640166	640171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974163
13545	NC_016843	GTC	2	6	640256	640261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13546	NC_016843	CG	3	6	640297	640302	0 %	0 %	50 %	50 %	378974163
13547	NC_016843	TTG	2	6	640311	640316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974163
13548	NC_016843	TCCT	2	8	640426	640433	0 %	50 %	0 %	50 %	378974163
13549	NC_016843	CCG	2	6	640485	640490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974163
13550	NC_016843	AAAC	2	8	640587	640594	75 %	0 %	0 %	25 %	378974163
13551	NC_016843	CTG	2	6	640618	640623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13552	NC_016843	GGT	2	6	640715	640720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974163
13553	NC_016843	CGT	2	6	640839	640844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13554	NC_016843	GC	3	6	640866	640871	0 %	0 %	50 %	50 %	378974163
13555	NC_016843	ACG	2	6	640881	640886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13556	NC_016843	GTC	2	6	640982	640987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13557	NC_016843	TGA	2	6	640993	640998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974163
13558	NC_016843	A	6	6	641115	641120	100 %	0 %	0 %	0 %	378974163
13559	NC_016843	GGC	2	6	641143	641148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974163
13560	NC_016843	GCC	2	6	641182	641187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974163
13561	NC_016843	GCAC	2	8	641197	641204	25 %	0 %	25 %	50 %	378974163
13562	NC_016843	GCA	2	6	641217	641222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13563	NC_016843	CGA	2	6	641269	641274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974163
13564	NC_016843	TCAG	2	8	641304	641311	25 %	25 %	25 %	25 %	378974163
13565	NC_016843	ATG	2	6	641312	641317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974163
13566	NC_016843	GGA	2	6	641349	641354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974163
13567	NC_016843	CT	3	6	641396	641401	0 %	50 %	0 %	50 %	378974163
13568	NC_016843	CAC	2	6	641409	641414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974163
13569	NC_016843	AGA	2	6	641422	641427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974163
13570	NC_016843	TG	3	6	641439	641444	0 %	50 %	50 %	0 %	378974163
13571	NC_016843	GCACAC	2	12	641446	641457	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378974163
13572	NC_016843	TG	3	6	641509	641514	0 %	50 %	50 %	0 %	378974163
13573	NC_016843	GTG	2	6	641522	641527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974163
13574	NC_016843	CCG	2	6	641610	641615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974163
13575	NC_016843	GCA	2	6	641638	641643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974163
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13577	NC_016843	GTCT	2	8	641822	641829	0 %	50 %	25 %	25 %	378974164
13578	NC_016843	GC	3	6	641883	641888	0 %	0 %	50 %	50 %	378974164
13579	NC_016843	TCC	2	6	641955	641960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974164
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13581	NC_016843	TCT	2	6	642120	642125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974164
13582	NC_016843	TG	3	6	642128	642133	0 %	50 %	50 %	0 %	378974164
13583	NC_016843	GCG	2	6	642167	642172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974164
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13585	NC_016843	GTT	2	6	642227	642232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974164
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13589	NC_016843	A	9	9	642290	642298	100 %	0 %	0 %	0 %	378974164
13590	NC_016843	T	6	6	642317	642322	0 %	100 %	0 %	0 %	378974164
13591	NC_016843	AAC	2	6	642330	642335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974164
13592	NC_016843	A	6	6	642340	642345	100 %	0 %	0 %	0 %	378974164
13593	NC_016843	GC	3	6	642429	642434	0 %	0 %	50 %	50 %	378974164
13594	NC_016843	GCC	2	6	642437	642442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974164
13595	NC_016843	CTT	2	6	642482	642487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974164
13596	NC_016843	CG	3	6	642627	642632	0 %	0 %	50 %	50 %	378974164
13597	NC_016843	CCT	2	6	642637	642642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974164
13598	NC_016843	GCA	2	6	642832	642837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974165
13599	NC_016843	CAAC	2	8	642857	642864	50 %	0 %	0 %	50 %	378974165
13600	NC_016843	AGCCAT	2	12	642888	642899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378974165
13601	NC_016843	ATA	2	6	642907	642912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974165
13602	NC_016843	TTCC	2	8	643056	643063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13603	NC_016843	T	6	6	643082	643087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_016843	ATC	2	6	643103	643108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974166
13605	NC_016843	ATA	2	6	643115	643120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974166
13606	NC_016843	TGC	2	6	643130	643135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974166
13607	NC_016843	AGC	2	6	643217	643222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974166
13608	NC_016843	GAT	2	6	643232	643237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974166
13609	NC_016843	TTCC	2	8	643245	643252	0 %	50 %	0 %	50 %	378974166
13610	NC_016843	TAG	2	6	643297	643302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974166
13611	NC_016843	GAA	2	6	643341	643346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974166
13612	NC_016843	ACC	2	6	643365	643370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974166
13613	NC_016843	TTTC	2	8	643378	643385	0 %	75 %	0 %	25 %	378974166
13614	NC_016843	TGA	2	6	643426	643431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974166
13615	NC_016843	C	6	6	643477	643482	0 %	0 %	0 %	100 %	378974166
13616	NC_016843	CTA	2	6	643519	643524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974166
13617	NC_016843	CAA	2	6	643534	643539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974166
13618	NC_016843	CCA	2	6	643630	643635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974166
13619	NC_016843	TCG	2	6	643654	643659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974166
13620	NC_016843	GA	3	6	643674	643679	50 %	0 %	50 %	0 %	378974166
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13622	NC_016843	CTCG	2	8	643703	643710	0 %	25 %	25 %	50 %	378974166
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14000	NC_016843	AG	3	6	660188	660193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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