MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016843	TGC	2	6	497479	497484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10502	NC_016843	T	6	6	497526	497531	0 %	100 %	0 %	0 %	378974043
10503	NC_016843	CTG	2	6	497590	497595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10504	NC_016843	CTT	2	6	497610	497615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974043
10505	NC_016843	AGC	2	6	497633	497638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10506	NC_016843	CTTC	2	8	497715	497722	0 %	50 %	0 %	50 %	378974043
10507	NC_016843	CAC	2	6	497724	497729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974043
10508	NC_016843	CG	3	6	497756	497761	0 %	0 %	50 %	50 %	378974043
10509	NC_016843	GCA	2	6	497789	497794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10510	NC_016843	GCA	2	6	497831	497836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10511	NC_016843	CACG	2	8	497879	497886	25 %	0 %	25 %	50 %	378974043
10512	NC_016843	A	6	6	497977	497982	100 %	0 %	0 %	0 %	378974043
10513	NC_016843	CGC	2	6	498013	498018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974043
10514	NC_016843	GTT	2	6	498140	498145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974043
10515	NC_016843	GTC	2	6	498148	498153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10516	NC_016843	CTTC	2	8	498225	498232	0 %	50 %	0 %	50 %	378974043
10517	NC_016843	CTG	2	6	498336	498341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10518	NC_016843	AC	3	6	498387	498392	50 %	0 %	0 %	50 %	378974043
10519	NC_016843	CGT	2	6	498413	498418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10520	NC_016843	GTG	2	6	498457	498462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974043
10521	NC_016843	GC	3	6	498488	498493	0 %	0 %	50 %	50 %	378974043
10522	NC_016843	CGGGG	2	10	498572	498581	0 %	0 %	80 %	20 %	378974043
10523	NC_016843	CG	3	6	498590	498595	0 %	0 %	50 %	50 %	378974043
10524	NC_016843	CT	3	6	498628	498633	0 %	50 %	0 %	50 %	378974043
10525	NC_016843	CTC	2	6	498673	498678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974043
10526	NC_016843	TTC	2	6	498700	498705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974043
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10528	NC_016843	GCA	2	6	498771	498776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974043
10529	NC_016843	CCAG	2	8	498789	498796	25 %	0 %	25 %	50 %	378974043
10530	NC_016843	CTC	3	9	498820	498828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974043
10531	NC_016843	GC	3	6	498863	498868	0 %	0 %	50 %	50 %	378974043
10532	NC_016843	ACC	2	6	498869	498874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974043
10533	NC_016843	C	6	6	498873	498878	0 %	0 %	0 %	100 %	378974043
10534	NC_016843	AAG	2	6	498910	498915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974043
10535	NC_016843	ATT	2	6	498958	498963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974043
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10538	NC_016843	CG	3	6	499020	499025	0 %	0 %	50 %	50 %	378974044
10539	NC_016843	TCC	2	6	499026	499031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10540	NC_016843	GC	4	8	499048	499055	0 %	0 %	50 %	50 %	378974044
10541	NC_016843	CCT	2	6	499075	499080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10542	NC_016843	TCC	2	6	499092	499097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10543	NC_016843	CCT	2	6	499099	499104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10544	NC_016843	TCC	2	6	499116	499121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10545	NC_016843	CCT	2	6	499123	499128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10546	NC_016843	TCC	2	6	499140	499145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
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10553	NC_016843	CCT	2	6	499219	499224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10554	NC_016843	TCC	2	6	499236	499241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10555	NC_016843	CCT	2	6	499243	499248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
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10557	NC_016843	CCT	2	6	499267	499272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
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10560	NC_016843	TCC	2	6	499308	499313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
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10570	NC_016843	TCC	2	6	499428	499433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
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10588	NC_016843	TCC	2	6	499644	499649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10589	NC_016843	CCT	2	6	499651	499656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10590	NC_016843	TCC	2	6	499668	499673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10591	NC_016843	CCT	2	6	499675	499680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974044
10592	NC_016843	AGG	2	6	499835	499840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974044
10593	NC_016843	GAGGGC	2	12	499853	499864	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378974044
10594	NC_016843	TGG	2	6	499964	499969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974044
10595	NC_016843	CTGT	2	8	500005	500012	0 %	50 %	25 %	25 %	378974044
10596	NC_016843	TGC	2	6	500036	500041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974044
10597	NC_016843	TGCTG	2	10	500061	500070	0 %	40 %	40 %	20 %	378974044
10598	NC_016843	CTG	2	6	500093	500098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974044
10599	NC_016843	CTG	2	6	500102	500107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974044
10600	NC_016843	AAGGA	2	10	500109	500118	60 %	0 %	40 %	0 %	378974044
10601	NC_016843	AGGA	2	8	500163	500170	50 %	0 %	50 %	0 %	378974044
10602	NC_016843	GGC	2	6	500291	500296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974045
10603	NC_016843	CTG	2	6	500315	500320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974045
10604	NC_016843	GCG	2	6	500324	500329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974045
10605	NC_016843	T	7	7	500358	500364	0 %	100 %	0 %	0 %	378974045
10606	NC_016843	TGG	2	6	500400	500405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974045
10607	NC_016843	A	6	6	500406	500411	100 %	0 %	0 %	0 %	378974045
10608	NC_016843	GGAAG	2	10	500521	500530	40 %	0 %	60 %	0 %	378974045
10609	NC_016843	GC	3	6	500554	500559	0 %	0 %	50 %	50 %	378974045
10610	NC_016843	CAG	3	9	500563	500571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974045
10611	NC_016843	GGT	2	6	500587	500592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974045
10612	NC_016843	GAG	2	6	500651	500656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974045
10613	NC_016843	CTT	2	6	500675	500680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974045
10614	NC_016843	TGC	2	6	500815	500820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974045
10615	NC_016843	CTT	2	6	500834	500839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974045
10616	NC_016843	CT	3	6	500913	500918	0 %	50 %	0 %	50 %	378974045
10617	NC_016843	GAAA	2	8	500941	500948	75 %	0 %	25 %	0 %	378974045
10618	NC_016843	GCG	2	6	500957	500962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974045
10619	NC_016843	GAG	2	6	500989	500994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974045
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10621	NC_016843	TTG	2	6	501069	501074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974045
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