MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016843	GGA	2	6	473230	473235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_016843	TG	3	6	473251	473256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_016843	TTG	2	6	473325	473330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974019
10004	NC_016843	GTT	2	6	473426	473431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974019
10005	NC_016843	TTC	3	9	473526	473534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974019
10006	NC_016843	G	6	6	473537	473542	0 %	0 %	100 %	0 %	378974019
10007	NC_016843	GCC	2	6	473564	473569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974019
10008	NC_016843	GCG	2	6	473573	473578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974019
10009	NC_016843	GGA	2	6	473612	473617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974019
10010	NC_016843	TCG	2	6	473619	473624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974019
10011	NC_016843	TG	3	6	473631	473636	0 %	50 %	50 %	0 %	378974019
10012	NC_016843	CT	3	6	473654	473659	0 %	50 %	0 %	50 %	378974019
10013	NC_016843	CGG	2	6	473712	473717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974019
10014	NC_016843	AGG	2	6	473760	473765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974019
10015	NC_016843	GC	4	8	473791	473798	0 %	0 %	50 %	50 %	378974019
10016	NC_016843	GGT	2	6	473800	473805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974019
10017	NC_016843	AGA	2	6	473848	473853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974019
10018	NC_016843	TTTC	2	8	473856	473863	0 %	75 %	0 %	25 %	378974019
10019	NC_016843	GTGGA	2	10	473883	473892	20 %	20 %	60 %	0 %	378974019
10020	NC_016843	GTGC	2	8	473906	473913	0 %	25 %	50 %	25 %	378974019
10021	NC_016843	GTG	2	6	473918	473923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974019
10022	NC_016843	TGC	2	6	473949	473954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974020
10023	NC_016843	GT	3	6	473990	473995	0 %	50 %	50 %	0 %	378974020
10024	NC_016843	GGA	2	6	474091	474096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974020
10025	NC_016843	TGCG	2	8	474107	474114	0 %	25 %	50 %	25 %	378974020
10026	NC_016843	GC	4	8	474290	474297	0 %	0 %	50 %	50 %	378974020
10027	NC_016843	TTG	2	6	474311	474316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974020
10028	NC_016843	GGAC	2	8	474357	474364	25 %	0 %	50 %	25 %	378974020
10029	NC_016843	GCGT	2	8	474413	474420	0 %	25 %	50 %	25 %	378974020
10030	NC_016843	GGT	2	6	474423	474428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974020
10031	NC_016843	GTG	2	6	474493	474498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974020
10032	NC_016843	GC	3	6	474501	474506	0 %	0 %	50 %	50 %	378974020
10033	NC_016843	GCG	2	6	474511	474516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974020
10034	NC_016843	GGATG	2	10	474525	474534	20 %	20 %	60 %	0 %	378974020
10035	NC_016843	CAGT	2	8	474535	474542	25 %	25 %	25 %	25 %	378974020
10036	NC_016843	GCA	2	6	474681	474686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974020
10037	NC_016843	GCTG	2	8	474837	474844	0 %	25 %	50 %	25 %	378974020
10038	NC_016843	TGG	2	6	474879	474884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974020
10039	NC_016843	GGA	2	6	475062	475067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974020
10040	NC_016843	T	8	8	475076	475083	0 %	100 %	0 %	0 %	378974020
10041	NC_016843	CG	3	6	475142	475147	0 %	0 %	50 %	50 %	378974020
10042	NC_016843	GCG	2	6	475209	475214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974021
10043	NC_016843	TGC	2	6	475226	475231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974021
10044	NC_016843	GGA	2	6	475286	475291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974021
10045	NC_016843	CGG	2	6	475383	475388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974021
10046	NC_016843	GCAC	2	8	475425	475432	25 %	0 %	25 %	50 %	378974021
10047	NC_016843	GAG	2	6	475495	475500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974021
10048	NC_016843	GCA	2	6	475673	475678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974021
10049	NC_016843	CGCT	2	8	475724	475731	0 %	25 %	25 %	50 %	378974021
10050	NC_016843	TCAG	2	8	475771	475778	25 %	25 %	25 %	25 %	378974021
10051	NC_016843	CTC	2	6	475886	475891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974021
10052	NC_016843	T	6	6	475908	475913	0 %	100 %	0 %	0 %	378974021
10053	NC_016843	GC	3	6	475946	475951	0 %	0 %	50 %	50 %	378974021
10054	NC_016843	GTAC	2	8	475973	475980	25 %	25 %	25 %	25 %	378974021
10055	NC_016843	T	6	6	476054	476059	0 %	100 %	0 %	0 %	378974021
10056	NC_016843	ATTT	2	8	476101	476108	25 %	75 %	0 %	0 %	378974021
10057	NC_016843	CG	3	6	476270	476275	0 %	0 %	50 %	50 %	378974021
10058	NC_016843	TGC	2	6	476279	476284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974021
10059	NC_016843	TC	3	6	476295	476300	0 %	50 %	0 %	50 %	378974021
10060	NC_016843	GTG	2	6	476310	476315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_016843	CG	3	6	476330	476335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10062	NC_016843	GAG	2	6	476356	476361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_016843	GC	3	6	476382	476387	0 %	0 %	50 %	50 %	378974022
10064	NC_016843	TGA	2	6	476414	476419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974022
10065	NC_016843	TAT	2	6	476442	476447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974022
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10067	NC_016843	GAA	2	6	476538	476543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974022
10068	NC_016843	ATC	2	6	476547	476552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974022
10069	NC_016843	GA	3	6	476638	476643	50 %	0 %	50 %	0 %	378974022
10070	NC_016843	GTT	2	6	476664	476669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974022
10071	NC_016843	CTA	2	6	476711	476716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974022
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10073	NC_016843	GCGT	2	8	476723	476730	0 %	25 %	50 %	25 %	378974022
10074	NC_016843	CGG	2	6	476756	476761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974022
10075	NC_016843	TTA	2	6	476788	476793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974022
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10077	NC_016843	GAG	2	6	476893	476898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974022
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10081	NC_016843	GAT	2	6	476991	476996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974022
10082	NC_016843	TGA	2	6	477002	477007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974022
10083	NC_016843	GGT	2	6	477108	477113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974022
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10085	NC_016843	CG	3	6	477272	477277	0 %	0 %	50 %	50 %	378974022
10086	NC_016843	TAT	2	6	477284	477289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974022
10087	NC_016843	CTGA	2	8	477446	477453	25 %	25 %	25 %	25 %	378974022
10088	NC_016843	T	8	8	477477	477484	0 %	100 %	0 %	0 %	378974023
10089	NC_016843	GTC	2	6	477530	477535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974023
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10092	NC_016843	CTG	2	6	477697	477702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974023
10093	NC_016843	TGC	2	6	477752	477757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974023
10094	NC_016843	CGCGTA	2	12	477758	477769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974023
10095	NC_016843	CTTT	2	8	477777	477784	0 %	75 %	0 %	25 %	378974023
10096	NC_016843	CG	3	6	477798	477803	0 %	0 %	50 %	50 %	378974023
10097	NC_016843	CTT	2	6	477807	477812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974023
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10099	NC_016843	A	7	7	477922	477928	100 %	0 %	0 %	0 %	378974023
10100	NC_016843	TGC	2	6	477961	477966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974023
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10102	NC_016843	GCT	2	6	478108	478113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_016843	ATG	2	6	478114	478119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_016843	AGT	2	6	478126	478131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_016843	T	6	6	478143	478148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_016843	ACA	2	6	478185	478190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974024
10107	NC_016843	ACT	2	6	478237	478242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974024
10108	NC_016843	T	6	6	478259	478264	0 %	100 %	0 %	0 %	378974024
10109	NC_016843	TGA	2	6	478296	478301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974024
10110	NC_016843	TGGAT	2	10	478316	478325	20 %	40 %	40 %	0 %	378974024
10111	NC_016843	ACAGGA	2	12	478329	478340	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378974024
10112	NC_016843	TGC	2	6	478362	478367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974024
10113	NC_016843	ACG	2	6	478369	478374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974024
10114	NC_016843	ATT	2	6	478402	478407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974024
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10116	NC_016843	TG	3	6	478484	478489	0 %	50 %	50 %	0 %	378974024
10117	NC_016843	CAGA	2	8	478510	478517	50 %	0 %	25 %	25 %	378974024
10118	NC_016843	GTTT	2	8	478558	478565	0 %	75 %	25 %	0 %	378974024
10119	NC_016843	GGATC	2	10	478578	478587	20 %	20 %	40 %	20 %	378974024
10120	NC_016843	TTGAT	2	10	478694	478703	20 %	60 %	20 %	0 %	378974024
10121	NC_016843	AGT	2	6	478735	478740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974024
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10245	NC_016843	CTT	2	6	485923	485928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974030
10246	NC_016843	T	6	6	485997	486002	0 %	100 %	0 %	0 %	378974030
10247	NC_016843	GCA	2	6	486026	486031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974030
10248	NC_016843	ATCA	2	8	486076	486083	50 %	25 %	0 %	25 %	378974030
10249	NC_016843	TGT	2	6	486084	486089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974030
10250	NC_016843	GCG	2	6	486118	486123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974030
10251	NC_016843	A	6	6	486172	486177	100 %	0 %	0 %	0 %	378974030
10252	NC_016843	G	6	6	486268	486273	0 %	0 %	100 %	0 %	378974030
10253	NC_016843	GCC	2	6	486296	486301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974030
10254	NC_016843	GCA	2	6	486302	486307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974030
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10258	NC_016843	GTC	2	6	486601	486606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974030
10259	NC_016843	AGCAA	2	10	486768	486777	60 %	0 %	20 %	20 %	378974030
10260	NC_016843	TAC	2	6	486947	486952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974031
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10262	NC_016843	TTC	2	6	486972	486977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974031
10263	NC_016843	GAGG	2	8	486990	486997	25 %	0 %	75 %	0 %	378974031
10264	NC_016843	GA	3	6	487003	487008	50 %	0 %	50 %	0 %	378974031
10265	NC_016843	GAAG	2	8	487011	487018	50 %	0 %	50 %	0 %	378974031
10266	NC_016843	CGTG	2	8	487051	487058	0 %	25 %	50 %	25 %	378974031
10267	NC_016843	TCT	2	6	487072	487077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974031
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10280	NC_016843	AACA	2	8	487701	487708	75 %	0 %	0 %	25 %	378974031
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10283	NC_016843	G	6	6	487797	487802	0 %	0 %	100 %	0 %	378974031
10284	NC_016843	GTC	2	6	487819	487824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974031
10285	NC_016843	TGA	2	6	487913	487918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974031
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10287	NC_016843	CGTC	2	8	488032	488039	0 %	25 %	25 %	50 %	378974031
10288	NC_016843	CGTG	2	8	488040	488047	0 %	25 %	50 %	25 %	378974031
10289	NC_016843	CGG	2	6	488099	488104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974031
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10291	NC_016843	GTGC	2	8	488149	488156	0 %	25 %	50 %	25 %	378974031
10292	NC_016843	CA	3	6	488189	488194	50 %	0 %	0 %	50 %	378974031
10293	NC_016843	GGCG	2	8	488262	488269	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10294	NC_016843	CAG	2	6	488280	488285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10297	NC_016843	TGC	2	6	488426	488431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974032
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10302	NC_016843	ACC	2	6	488702	488707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974032
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10306	NC_016843	TGTA	2	8	488981	488988	25 %	50 %	25 %	0 %	378974032
10307	NC_016843	TG	3	6	489039	489044	0 %	50 %	50 %	0 %	378974032
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10313	NC_016843	A	6	6	489450	489455	100 %	0 %	0 %	0 %	378974032
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10327	NC_016843	AGG	2	6	490127	490132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10355	NC_016843	GC	4	8	491329	491336	0 %	0 %	50 %	50 %	378974034
10356	NC_016843	GT	3	6	491353	491358	0 %	50 %	50 %	0 %	378974034
10357	NC_016843	CTGG	2	8	491569	491576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10358	NC_016843	G	6	6	491575	491580	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10364	NC_016843	GGC	2	6	491721	491726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974035
10365	NC_016843	GC	4	8	491781	491788	0 %	0 %	50 %	50 %	378974035
10366	NC_016843	GGT	2	6	491793	491798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974035
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