MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016843	CCG	2	6	293370	293375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973852
6002	NC_016843	ATA	2	6	293409	293414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973852
6003	NC_016843	GC	3	6	293427	293432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_016843	ACA	2	6	293446	293451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_016843	TC	3	6	293467	293472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_016843	AGT	2	6	293498	293503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_016843	GCG	2	6	293504	293509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_016843	GCAC	2	8	293514	293521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_016843	GACC	2	8	293550	293557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_016843	CTT	2	6	293637	293642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973853
6011	NC_016843	T	7	7	293641	293647	0 %	100 %	0 %	0 %	378973853
6012	NC_016843	CCA	2	6	293690	293695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973853
6013	NC_016843	TG	3	6	293710	293715	0 %	50 %	50 %	0 %	378973853
6014	NC_016843	TCA	2	6	293746	293751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973853
6015	NC_016843	CCA	2	6	293813	293818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973853
6016	NC_016843	TCTGC	2	10	293894	293903	0 %	40 %	20 %	40 %	378973853
6017	NC_016843	CTT	2	6	293948	293953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973853
6018	NC_016843	CGG	2	6	293991	293996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973853
6019	NC_016843	GTA	2	6	294033	294038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973853
6020	NC_016843	TGC	2	6	294088	294093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973853
6021	NC_016843	GC	3	6	294133	294138	0 %	0 %	50 %	50 %	378973853
6022	NC_016843	TGA	2	6	294194	294199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973853
6023	NC_016843	GAAT	2	8	294308	294315	50 %	25 %	25 %	0 %	378973853
6024	NC_016843	GCG	2	6	294334	294339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973853
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6027	NC_016843	GGGTGA	2	12	294524	294535	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378973853
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6033	NC_016843	CGC	2	6	294821	294826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973853
6034	NC_016843	CGA	2	6	294842	294847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973853
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6036	NC_016843	TCG	2	6	294922	294927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973853
6037	NC_016843	GTA	2	6	294930	294935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973853
6038	NC_016843	GGA	2	6	294941	294946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973853
6039	NC_016843	ACA	2	6	295050	295055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_016843	GAG	2	6	295059	295064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016843	GAT	2	6	295094	295099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016843	TTTCC	2	10	295141	295150	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6043	NC_016843	GGA	2	6	295163	295168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016843	GC	3	6	295189	295194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_016843	GAG	2	6	295211	295216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016843	CTT	2	6	295257	295262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_016843	G	12	12	295283	295294	0 %	0 %	100 %	0 %	378973854
6048	NC_016843	AG	4	8	295295	295302	50 %	0 %	50 %	0 %	378973854
6049	NC_016843	CGTTG	2	10	295325	295334	0 %	40 %	40 %	20 %	378973854
6050	NC_016843	GTGC	2	8	295337	295344	0 %	25 %	50 %	25 %	378973854
6051	NC_016843	GCCG	2	8	295362	295369	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
6052	NC_016843	ATC	2	6	295382	295387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973854
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6056	NC_016843	TTCT	2	8	295474	295481	0 %	75 %	0 %	25 %	378973854
6057	NC_016843	CGC	2	6	295498	295503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973854
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6059	NC_016843	CAA	2	6	295593	295598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973854
6060	NC_016843	CAT	2	6	295608	295613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973854
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6063	NC_016843	TGA	2	6	295651	295656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973854
6064	NC_016843	GC	3	6	295676	295681	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
6065	NC_016843	CTG	2	6	295742	295747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973854
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6500	NC_016843	GCA	2	6	315475	315480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973870

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