MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016843	GTG	2	6	267666	267671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973828
5502	NC_016843	G	6	6	267746	267751	0 %	0 %	100 %	0 %	378973828
5503	NC_016843	CTT	2	6	267785	267790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973828
5504	NC_016843	GGA	2	6	267809	267814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973828
5505	NC_016843	AGG	2	6	267815	267820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973828
5506	NC_016843	GGAT	2	8	267865	267872	25 %	25 %	50 %	0 %	378973828
5507	NC_016843	GAG	2	6	267885	267890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973828
5508	NC_016843	TCG	2	6	267926	267931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973828
5509	NC_016843	GGA	2	6	268007	268012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973828
5510	NC_016843	AATC	2	8	268046	268053	50 %	25 %	0 %	25 %	378973828
5511	NC_016843	AAC	2	6	268110	268115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973828
5512	NC_016843	TCC	2	6	268152	268157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973828
5513	NC_016843	GT	3	6	268177	268182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016843	GCGCG	2	10	268241	268250	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5515	NC_016843	GAG	2	6	268306	268311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973829
5516	NC_016843	GGT	2	6	268317	268322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973829
5517	NC_016843	GT	3	6	268321	268326	0 %	50 %	50 %	0 %	378973829
5518	NC_016843	T	6	6	268402	268407	0 %	100 %	0 %	0 %	378973829
5519	NC_016843	CAG	2	6	268433	268438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973829
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5521	NC_016843	GTT	2	6	268608	268613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973830
5522	NC_016843	CTG	2	6	268624	268629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973830
5523	NC_016843	GTG	2	6	268644	268649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973830
5524	NC_016843	TGC	2	6	268663	268668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973830
5525	NC_016843	TTTTC	2	10	268670	268679	0 %	80 %	0 %	20 %	378973830
5526	NC_016843	TTA	2	6	268706	268711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973830
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5528	NC_016843	TTTTTC	2	12	268825	268836	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378973830
5529	NC_016843	ATG	2	6	268863	268868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973830
5530	NC_016843	T	6	6	268960	268965	0 %	100 %	0 %	0 %	378973830
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5533	NC_016843	TGCG	2	8	269026	269033	0 %	25 %	50 %	25 %	378973830
5534	NC_016843	GCC	2	6	269038	269043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973830
5535	NC_016843	GTG	2	6	269052	269057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973830
5536	NC_016843	CTT	2	6	269077	269082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973830
5537	NC_016843	T	8	8	269081	269088	0 %	100 %	0 %	0 %	378973830
5538	NC_016843	T	6	6	269102	269107	0 %	100 %	0 %	0 %	378973830
5539	NC_016843	GT	3	6	269124	269129	0 %	50 %	50 %	0 %	378973830
5540	NC_016843	GCG	2	6	269212	269217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_016843	CTA	2	6	269220	269225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_016843	GAG	2	6	269260	269265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_016843	TG	3	6	269289	269294	0 %	50 %	50 %	0 %	378973831
5544	NC_016843	G	9	9	269302	269310	0 %	0 %	100 %	0 %	378973831
5545	NC_016843	GCA	2	6	269441	269446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973831
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5547	NC_016843	TGAC	2	8	269509	269516	25 %	25 %	25 %	25 %	378973831
5548	NC_016843	AGA	2	6	269582	269587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973831
5549	NC_016843	CTC	2	6	269595	269600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973831
5550	NC_016843	CG	3	6	269623	269628	0 %	0 %	50 %	50 %	378973831
5551	NC_016843	TCA	3	9	269786	269794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973831
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5553	NC_016843	A	6	6	269835	269840	100 %	0 %	0 %	0 %	378973831
5554	NC_016843	TACAAT	2	12	270021	270032	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378973831
5555	NC_016843	GGT	2	6	270048	270053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973831
5556	NC_016843	GGA	2	6	270097	270102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973831
5557	NC_016843	GAAT	2	8	270113	270120	50 %	25 %	25 %	0 %	378973831
5558	NC_016843	GAAA	2	8	270206	270213	75 %	0 %	25 %	0 %	378973831
5559	NC_016843	CG	3	6	270227	270232	0 %	0 %	50 %	50 %	378973831
5560	NC_016843	GTG	2	6	270282	270287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973831
5561	NC_016843	CCCG	2	8	270330	270337	0 %	0 %	25 %	75 %	378973831
5562	NC_016843	GTTC	2	8	270402	270409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_016843	GCAC	2	8	270441	270448	25 %	0 %	25 %	50 %	378973832
5564	NC_016843	CG	3	6	270469	270474	0 %	0 %	50 %	50 %	378973832
5565	NC_016843	CG	4	8	270502	270509	0 %	0 %	50 %	50 %	378973832
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5579	NC_016843	AG	3	6	271112	271117	50 %	0 %	50 %	0 %	378973832
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5582	NC_016843	TG	3	6	271224	271229	0 %	50 %	50 %	0 %	378973833
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5594	NC_016843	GC	3	6	271810	271815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_016843	CA	3	6	271863	271868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_016843	GCTC	2	8	271871	271878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_016843	TCC	2	6	271880	271885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5598	NC_016843	CTT	2	6	271928	271933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973835
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5600	NC_016843	C	6	6	272049	272054	0 %	0 %	0 %	100 %	378973835
5601	NC_016843	GC	3	6	272090	272095	0 %	0 %	50 %	50 %	378973835
5602	NC_016843	CCCTGC	2	12	272181	272192	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378973835
5603	NC_016843	GC	5	10	272213	272222	0 %	0 %	50 %	50 %	378973835
5604	NC_016843	AT	3	6	272268	272273	50 %	50 %	0 %	0 %	378973835
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5608	NC_016843	T	6	6	272559	272564	0 %	100 %	0 %	0 %	378973835
5609	NC_016843	T	6	6	272597	272602	0 %	100 %	0 %	0 %	378973835
5610	NC_016843	GCG	2	6	272613	272618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973835
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5613	NC_016843	GGT	2	6	272772	272777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973835
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5616	NC_016843	TCT	2	6	273056	273061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973835
5617	NC_016843	GCAC	2	8	273098	273105	25 %	0 %	25 %	50 %	378973835
5618	NC_016843	GGGA	2	8	273142	273149	25 %	0 %	75 %	0 %	378973835
5619	NC_016843	GGA	2	6	273155	273160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973835
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5622	NC_016843	TAG	2	6	273268	273273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973835
5623	NC_016843	CACC	2	8	273276	273283	25 %	0 %	0 %	75 %	378973835
5624	NC_016843	GC	3	6	273322	273327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_016843	CGTGA	2	10	273335	273344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5754	NC_016843	GAA	2	6	280293	280298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5755	NC_016843	GAT	2	6	280327	280332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5757	NC_016843	GAT	2	6	280542	280547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5761	NC_016843	GGA	2	6	280755	280760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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