MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016843	AACG	2	8	243678	243685	50 %	0 %	25 %	25 %	378973809
5002	NC_016843	AAG	2	6	243739	243744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973809
5003	NC_016843	GGT	2	6	243747	243752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973809
5004	NC_016843	TTG	2	6	243778	243783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973809
5005	NC_016843	GGA	2	6	243812	243817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973809
5006	NC_016843	GT	3	6	243820	243825	0 %	50 %	50 %	0 %	378973809
5007	NC_016843	T	6	6	243858	243863	0 %	100 %	0 %	0 %	378973809
5008	NC_016843	TTC	2	6	243867	243872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973809
5009	NC_016843	CTC	2	6	243956	243961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973809
5010	NC_016843	T	6	6	243975	243980	0 %	100 %	0 %	0 %	378973809
5011	NC_016843	ACA	2	6	243987	243992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973809
5012	NC_016843	GGA	2	6	244038	244043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973809
5013	NC_016843	TGA	2	6	244046	244051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973809
5014	NC_016843	CAA	2	6	244059	244064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973809
5015	NC_016843	TCT	2	6	244144	244149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_016843	TGCC	2	8	244182	244189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_016843	TGT	2	6	244215	244220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016843	T	6	6	244220	244225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016843	GAA	3	9	244255	244263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973810
5020	NC_016843	CGC	2	6	244314	244319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973810
5021	NC_016843	GCA	2	6	244369	244374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973810
5022	NC_016843	TGG	2	6	244410	244415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973810
5023	NC_016843	CGC	2	6	244470	244475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973810
5024	NC_016843	TTA	2	6	244488	244493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973810
5025	NC_016843	CGA	2	6	244521	244526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973810
5026	NC_016843	GC	3	6	244547	244552	0 %	0 %	50 %	50 %	378973810
5027	NC_016843	TGC	2	6	244621	244626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973810
5028	NC_016843	ATC	2	6	244634	244639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973810
5029	NC_016843	GCA	2	6	244653	244658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973810
5030	NC_016843	GAA	2	6	244695	244700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973811
5031	NC_016843	AAG	2	6	244831	244836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973811
5032	NC_016843	T	6	6	244901	244906	0 %	100 %	0 %	0 %	378973811
5033	NC_016843	TGC	2	6	244935	244940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973811
5034	NC_016843	TGC	2	6	244944	244949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973811
5035	NC_016843	AGG	2	6	244986	244991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973811
5036	NC_016843	ATG	2	6	245029	245034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973811
5037	NC_016843	GTCG	2	8	245041	245048	0 %	25 %	50 %	25 %	378973811
5038	NC_016843	GCT	2	6	245122	245127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973811
5039	NC_016843	CG	3	6	245161	245166	0 %	0 %	50 %	50 %	378973811
5040	NC_016843	ACG	2	6	245203	245208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973811
5041	NC_016843	AAG	2	6	245266	245271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973811
5042	NC_016843	AGT	2	6	245360	245365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973811
5043	NC_016843	GCT	2	6	245405	245410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973812
5044	NC_016843	CTT	3	9	245442	245450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973812
5045	NC_016843	AGC	2	6	245484	245489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973812
5046	NC_016843	CG	3	6	245504	245509	0 %	0 %	50 %	50 %	378973812
5047	NC_016843	CGTG	2	8	245523	245530	0 %	25 %	50 %	25 %	378973812
5048	NC_016843	GTG	2	6	245537	245542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973812
5049	NC_016843	TGG	2	6	245601	245606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973812
5050	NC_016843	CG	3	6	245653	245658	0 %	0 %	50 %	50 %	378973812
5051	NC_016843	TGCC	2	8	245685	245692	0 %	25 %	25 %	50 %	378973812
5052	NC_016843	GTG	2	6	245696	245701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973812
5053	NC_016843	GAAA	2	8	245769	245776	75 %	0 %	25 %	0 %	378973812
5054	NC_016843	ACG	2	6	245813	245818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973812
5055	NC_016843	GTG	2	6	245882	245887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973812
5056	NC_016843	GTT	2	6	245912	245917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016843	ATA	2	6	246012	246017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973813
5058	NC_016843	GGC	2	6	246019	246024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973813
5059	NC_016843	ATT	2	6	246041	246046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973813
5060	NC_016843	GGA	3	9	246100	246108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973813
5061	NC_016843	GAG	2	6	246179	246184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973813
5062	NC_016843	CAGA	2	8	246185	246192	50 %	0 %	25 %	25 %	378973813
5063	NC_016843	TGT	2	6	246199	246204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973813
5064	NC_016843	A	7	7	246230	246236	100 %	0 %	0 %	0 %	378973813
5065	NC_016843	TTA	2	6	246243	246248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973813
5066	NC_016843	GGCTT	2	10	246273	246282	0 %	40 %	40 %	20 %	378973813
5067	NC_016843	TGG	2	6	246300	246305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973813
5068	NC_016843	GAAA	2	8	246325	246332	75 %	0 %	25 %	0 %	378973813
5069	NC_016843	GGC	2	6	246349	246354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973813
5070	NC_016843	T	8	8	246414	246421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016843	CGT	2	6	246436	246441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_016843	TG	3	6	246442	246447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016843	TG	3	6	246592	246597	0 %	50 %	50 %	0 %	378973814
5074	NC_016843	TCGGT	2	10	246639	246648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5075	NC_016843	G	7	7	246658	246664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016843	AC	3	6	246691	246696	50 %	0 %	0 %	50 %	378973815
5077	NC_016843	AG	3	6	246835	246840	50 %	0 %	50 %	0 %	378973815
5078	NC_016843	TGA	2	6	246930	246935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973815
5079	NC_016843	TTG	2	6	247007	247012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973815
5080	NC_016843	AAT	2	6	247024	247029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973815
5081	NC_016843	ATC	2	6	247099	247104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973815
5082	NC_016843	GTG	2	6	247120	247125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973815
5083	NC_016843	AAGG	2	8	247177	247184	50 %	0 %	50 %	0 %	378973815
5084	NC_016843	ATT	2	6	247207	247212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973815
5085	NC_016843	A	6	6	247252	247257	100 %	0 %	0 %	0 %	378973815
5086	NC_016843	TGCG	2	8	247313	247320	0 %	25 %	50 %	25 %	378973815
5087	NC_016843	ATC	2	6	247345	247350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973815
5088	NC_016843	GCT	2	6	247407	247412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973815
5089	NC_016843	GA	3	6	247487	247492	50 %	0 %	50 %	0 %	378973815
5090	NC_016843	ATCC	2	8	247495	247502	25 %	25 %	0 %	50 %	378973815
5091	NC_016843	GAT	2	6	247513	247518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973815
5092	NC_016843	CTG	2	6	247519	247524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973815
5093	NC_016843	ATT	2	6	247549	247554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973815
5094	NC_016843	TGTAT	2	10	247672	247681	20 %	60 %	20 %	0 %	378973815
5095	NC_016843	CGG	2	6	247721	247726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973815
5096	NC_016843	ACT	2	6	247825	247830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973815
5097	NC_016843	GAT	2	6	247849	247854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973815
5098	NC_016843	TCA	2	6	247877	247882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973815
5099	NC_016843	GAT	2	6	247909	247914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973815
5100	NC_016843	CGT	2	6	247933	247938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973815
5101	NC_016843	TTCG	2	8	247940	247947	0 %	50 %	25 %	25 %	378973815
5102	NC_016843	GGAAAC	2	12	248028	248039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378973815
5103	NC_016843	AC	3	6	248155	248160	50 %	0 %	0 %	50 %	378973815
5104	NC_016843	GCG	2	6	248163	248168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973815
5105	NC_016843	TGG	2	6	248187	248192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973815
5106	NC_016843	ACGC	2	8	248315	248322	25 %	0 %	25 %	50 %	378973815
5107	NC_016843	GTT	2	6	248374	248379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973815
5108	NC_016843	CTA	2	6	248421	248426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973815
5109	NC_016843	CGG	2	6	248444	248449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973815
5110	NC_016843	G	6	6	248498	248503	0 %	0 %	100 %	0 %	378973815
5111	NC_016843	TTTCTG	2	12	248564	248575	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378973815
5112	NC_016843	TC	3	6	248578	248583	0 %	50 %	0 %	50 %	378973815
5113	NC_016843	ATG	3	9	248600	248608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973815
5114	NC_016843	CG	3	6	248675	248680	0 %	0 %	50 %	50 %	378973815
5115	NC_016843	AGA	2	6	248771	248776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973815
5116	NC_016843	CCG	2	6	248789	248794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973815
5117	NC_016843	AGG	2	6	248813	248818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973815
5118	NC_016843	ACC	2	6	248867	248872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973815
5119	NC_016843	AGG	2	6	249044	249049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973815
5120	NC_016843	GAA	2	6	249150	249155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973815
5121	NC_016843	GTGC	2	8	249202	249209	0 %	25 %	50 %	25 %	378973815
5122	NC_016843	GAC	2	6	249255	249260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973815
5123	NC_016843	GCT	2	6	249273	249278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973815
5124	NC_016843	GAAG	2	8	249303	249310	50 %	0 %	50 %	0 %	378973815
5125	NC_016843	TTC	2	6	249318	249323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973815
5126	NC_016843	GGAG	2	8	249384	249391	25 %	0 %	75 %	0 %	378973815
5127	NC_016843	GGT	2	6	249417	249422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973815
5128	NC_016843	GC	3	6	249502	249507	0 %	0 %	50 %	50 %	378973815
5129	NC_016843	TCCT	2	8	249509	249516	0 %	50 %	0 %	50 %	378973815
5130	NC_016843	GAA	2	6	249517	249522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973815
5131	NC_016843	GAT	2	6	249538	249543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973815
5132	NC_016843	GCAG	2	8	249711	249718	25 %	0 %	50 %	25 %	378973815
5133	NC_016843	TGC	2	6	249743	249748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973815
5134	NC_016843	GACG	2	8	249751	249758	25 %	0 %	50 %	25 %	378973815
5135	NC_016843	ATT	2	6	249767	249772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973815
5136	NC_016843	GCA	2	6	249876	249881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973815
5137	NC_016843	CGGCG	2	10	249954	249963	0 %	0 %	60 %	40 %	378973815
5138	NC_016843	GAT	2	6	249997	250002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973815
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5141	NC_016843	T	6	6	250355	250360	0 %	100 %	0 %	0 %	378973816
5142	NC_016843	TAC	2	6	250377	250382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973816
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5144	NC_016843	TAC	2	6	250534	250539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973816
5145	NC_016843	A	6	6	250650	250655	100 %	0 %	0 %	0 %	378973816
5146	NC_016843	GGC	2	6	250708	250713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973816
5147	NC_016843	CGG	2	6	250718	250723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973816
5148	NC_016843	ACCTTG	2	12	250760	250771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973816
5149	NC_016843	TTG	2	6	250778	250783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973816
5150	NC_016843	GAT	2	6	250800	250805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973816
5151	NC_016843	TGC	2	6	250835	250840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973816
5152	NC_016843	GAT	2	6	250893	250898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973816
5153	NC_016843	ATC	2	6	251053	251058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973816
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5155	NC_016843	GAAA	2	8	251346	251353	75 %	0 %	25 %	0 %	378973816
5156	NC_016843	TGG	2	6	251507	251512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973816
5157	NC_016843	TG	3	6	251541	251546	0 %	50 %	50 %	0 %	378973816
5158	NC_016843	GGC	2	6	251607	251612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973816
5159	NC_016843	TGT	2	6	251636	251641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973816
5160	NC_016843	TAT	2	6	251716	251721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973816
5161	NC_016843	CT	3	6	251736	251741	0 %	50 %	0 %	50 %	378973816
5162	NC_016843	GGA	2	6	251778	251783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973816
5163	NC_016843	ATG	2	6	251788	251793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973816
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5166	NC_016843	CTT	2	6	252051	252056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973816
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5179	NC_016843	TGG	2	6	252539	252544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973816
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5193	NC_016843	ACCAC	2	10	253157	253166	40 %	0 %	0 %	60 %	378973816
5194	NC_016843	ATCG	2	8	253213	253220	25 %	25 %	25 %	25 %	378973816
5195	NC_016843	GTA	2	6	253276	253281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973816
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5205	NC_016843	G	7	7	253638	253644	0 %	0 %	100 %	0 %	378973816
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5211	NC_016843	TG	3	6	253859	253864	0 %	50 %	50 %	0 %	378973816
5212	NC_016843	TGA	2	6	253928	253933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973816
5213	NC_016843	TCAA	2	8	253969	253976	50 %	25 %	0 %	25 %	378973816
5214	NC_016843	GTG	2	6	253996	254001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973816
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5216	NC_016843	GC	3	6	254134	254139	0 %	0 %	50 %	50 %	378973816
5217	NC_016843	GGC	2	6	254163	254168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973816
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5221	NC_016843	GCG	2	6	254319	254324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973816
5222	NC_016843	GGA	2	6	254379	254384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973816
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5224	NC_016843	TG	3	6	254516	254521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_016843	T	7	7	254546	254552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5226	NC_016843	T	6	6	254615	254620	0 %	100 %	0 %	0 %	378973817
5227	NC_016843	GT	3	6	254668	254673	0 %	50 %	50 %	0 %	378973817
5228	NC_016843	TGA	2	6	254681	254686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973817
5229	NC_016843	A	6	6	254697	254702	100 %	0 %	0 %	0 %	378973817
5230	NC_016843	TCTGC	2	10	254710	254719	0 %	40 %	20 %	40 %	378973817
5231	NC_016843	G	6	6	254867	254872	0 %	0 %	100 %	0 %	378973817
5232	NC_016843	GTG	2	6	254890	254895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973817
5233	NC_016843	GAG	2	6	254957	254962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_016843	CCG	2	6	255001	255006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973818
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5236	NC_016843	GTG	2	6	255028	255033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973818
5237	NC_016843	ATG	2	6	255055	255060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973818
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5239	NC_016843	TAT	2	6	255090	255095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973818
5240	NC_016843	GAG	2	6	255133	255138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973818
5241	NC_016843	CGG	2	6	255199	255204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973818
5242	NC_016843	TGG	2	6	255207	255212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973818
5243	NC_016843	GCA	2	6	255286	255291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973818
5244	NC_016843	GCA	2	6	255328	255333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973818
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5246	NC_016843	G	7	7	255596	255602	0 %	0 %	100 %	0 %	378973819
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5289	NC_016843	GAGG	2	8	257772	257779	25 %	0 %	75 %	0 %	378973819
5290	NC_016843	CG	3	6	257785	257790	0 %	0 %	50 %	50 %	378973819
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5302	NC_016843	GTG	2	6	258261	258266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973819
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5322	NC_016843	T	6	6	259247	259252	0 %	100 %	0 %	0 %	378973820
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5329	NC_016843	GCAT	2	8	259540	259547	25 %	25 %	25 %	25 %	378973820
5330	NC_016843	GTA	2	6	259561	259566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973820
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5338	NC_016843	GTGC	2	8	260161	260168	0 %	25 %	50 %	25 %	378973820
5339	NC_016843	GTT	2	6	260206	260211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973820
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5350	NC_016843	TGA	2	6	260672	260677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973820
5351	NC_016843	GAA	2	6	260683	260688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973820
5352	NC_016843	ATG	2	6	260702	260707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973820
5353	NC_016843	GAG	2	6	260722	260727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973820
5354	NC_016843	GA	3	6	260827	260832	50 %	0 %	50 %	0 %	378973820
5355	NC_016843	GTG	2	6	260858	260863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_016843	CGAG	2	8	260934	260941	25 %	0 %	50 %	25 %	378973821
5357	NC_016843	GGT	2	6	260976	260981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973821
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5361	NC_016843	CGA	2	6	261111	261116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973821
5362	NC_016843	TGA	2	6	261169	261174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973821
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5364	NC_016843	GGT	2	6	261200	261205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973821
5365	NC_016843	TTC	2	6	261254	261259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973821
5366	NC_016843	GGTGC	2	10	261282	261291	0 %	20 %	60 %	20 %	378973821
5367	NC_016843	GGA	2	6	261309	261314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973821
5368	NC_016843	GGT	3	9	261359	261367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973821
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5370	NC_016843	TTGCG	2	10	261382	261391	0 %	40 %	40 %	20 %	378973821
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