MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_016842	ATG	2	6	123840	123845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972612
2503	NC_016842	GCGT	2	8	123946	123953	0 %	25 %	50 %	25 %	378972612
2504	NC_016842	AAC	2	6	123973	123978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972612
2505	NC_016842	GTTC	2	8	123979	123986	0 %	50 %	25 %	25 %	378972612
2506	NC_016842	T	7	7	124011	124017	0 %	100 %	0 %	0 %	378972612
2507	NC_016842	GCG	2	6	124034	124039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972612
2508	NC_016842	CGCAG	2	10	124084	124093	20 %	0 %	40 %	40 %	378972612
2509	NC_016842	AGCAC	2	10	124120	124129	40 %	0 %	20 %	40 %	378972612
2510	NC_016842	TG	3	6	124134	124139	0 %	50 %	50 %	0 %	378972612
2511	NC_016842	GC	3	6	124188	124193	0 %	0 %	50 %	50 %	378972612
2512	NC_016842	ATA	2	6	124206	124211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378972612
2513	NC_016842	CACG	2	8	124223	124230	25 %	0 %	25 %	50 %	378972612
2514	NC_016842	TTG	2	6	124236	124241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972612
2515	NC_016842	T	6	6	124252	124257	0 %	100 %	0 %	0 %	378972612
2516	NC_016842	GCA	2	6	124282	124287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972612
2517	NC_016842	GC	4	8	124292	124299	0 %	0 %	50 %	50 %	378972612
2518	NC_016842	TCC	2	6	124353	124358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_016842	GC	3	6	124374	124379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_016842	ACTG	2	8	124394	124401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_016842	TG	3	6	124440	124445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_016842	GCT	2	6	124475	124480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_016842	TGAG	2	8	124537	124544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016842	CCTC	2	8	124591	124598	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2525	NC_016842	TG	4	8	124636	124643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_016842	TCC	2	6	124654	124659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_016842	AGA	2	6	124719	124724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_016842	GAG	2	6	124772	124777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_016842	TCTCAA	2	12	124817	124828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_016842	GT	3	6	124862	124867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_016842	GAAC	2	8	124901	124908	50 %	0 %	25 %	25 %	378972613
2532	NC_016842	TGG	2	6	124930	124935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972613
2533	NC_016842	GC	3	6	125039	125044	0 %	0 %	50 %	50 %	378972613
2534	NC_016842	AG	3	6	125064	125069	50 %	0 %	50 %	0 %	378972613
2535	NC_016842	GGCG	2	8	125078	125085	0 %	0 %	75 %	25 %	378972613
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2537	NC_016842	T	6	6	125124	125129	0 %	100 %	0 %	0 %	378972613
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2541	NC_016842	T	6	6	125286	125291	0 %	100 %	0 %	0 %	378972613
2542	NC_016842	CCT	2	6	125336	125341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378972613
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2546	NC_016842	CCT	2	6	125444	125449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378972613
2547	NC_016842	GGC	2	6	125510	125515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972613
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2549	NC_016842	T	6	6	125539	125544	0 %	100 %	0 %	0 %	378972613
2550	NC_016842	CTG	2	6	125568	125573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972613
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2553	NC_016842	AGCA	2	8	125664	125671	50 %	0 %	25 %	25 %	378972613
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2560	NC_016842	TCT	2	6	126002	126007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972613
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2562	NC_016842	A	6	6	126101	126106	100 %	0 %	0 %	0 %	378972613
2563	NC_016842	GC	3	6	126126	126131	0 %	0 %	50 %	50 %	378972613
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2567	NC_016842	CTTG	2	8	126386	126393	0 %	50 %	25 %	25 %	378972613
2568	NC_016842	CATTG	2	10	126414	126423	20 %	40 %	20 %	20 %	378972613
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2572	NC_016842	CAG	2	6	126689	126694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972614
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2574	NC_016842	CCGTG	2	10	126775	126784	0 %	20 %	40 %	40 %	378972614
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2581	NC_016842	GTA	2	6	127077	127082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972614
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2593	NC_016842	GCAT	2	8	127601	127608	25 %	25 %	25 %	25 %	378972614
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2609	NC_016842	T	8	8	128746	128753	0 %	100 %	0 %	0 %	378972615
2610	NC_016842	GAA	2	6	128825	128830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972615
2611	NC_016842	CTT	2	6	128874	128879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972615
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2751	NC_016842	GAGT	2	8	136316	136323	25 %	25 %	50 %	0 %	378972620
2752	NC_016842	AGC	2	6	136341	136346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972620
2753	NC_016842	CACT	2	8	136392	136399	25 %	25 %	0 %	50 %	378972620
2754	NC_016842	CTC	2	6	136404	136409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2755	NC_016842	C	10	10	136424	136433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2756	NC_016842	AGA	2	6	136442	136447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2758	NC_016842	GACA	2	8	136498	136505	50 %	0 %	25 %	25 %	378972621
2759	NC_016842	AG	3	6	136516	136521	50 %	0 %	50 %	0 %	378972621
2760	NC_016842	CCT	2	6	136569	136574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378972621
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2764	NC_016842	GCT	2	6	136710	136715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972621
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2766	NC_016842	GTCTT	2	10	136833	136842	0 %	60 %	20 %	20 %	378972621
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2775	NC_016842	GC	3	6	137011	137016	0 %	0 %	50 %	50 %	378972621
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2854	NC_016842	CTGC	2	8	140901	140908	0 %	25 %	25 %	50 %	378972626
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2857	NC_016842	CTG	2	6	141231	141236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972626
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