MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_016842	CGT	2	6	1019576	1019581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973456
21502	NC_016842	CATC	2	8	1019621	1019628	25 %	25 %	0 %	50 %	378973456
21503	NC_016842	AACGC	2	10	1019705	1019714	40 %	0 %	20 %	40 %	378973456
21504	NC_016842	TCA	2	6	1019724	1019729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973456
21505	NC_016842	TTA	2	6	1019824	1019829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973456
21506	NC_016842	GCT	2	6	1019848	1019853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973456
21507	NC_016842	GCC	2	6	1019914	1019919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973456
21508	NC_016842	CA	4	8	1020067	1020074	50 %	0 %	0 %	50 %	378973456
21509	NC_016842	TGC	2	6	1020096	1020101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973456
21510	NC_016842	ATC	2	6	1020105	1020110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973456
21511	NC_016842	GC	4	8	1020132	1020139	0 %	0 %	50 %	50 %	378973456
21512	NC_016842	AC	3	6	1020197	1020202	50 %	0 %	0 %	50 %	378973456
21513	NC_016842	GCA	2	6	1020226	1020231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973456
21514	NC_016842	GCGCGT	2	12	1020237	1020248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378973456
21515	NC_016842	A	6	6	1020280	1020285	100 %	0 %	0 %	0 %	378973456
21516	NC_016842	TAA	2	6	1020334	1020339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973456
21517	NC_016842	GC	3	6	1020399	1020404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21518	NC_016842	AGC	2	6	1020437	1020442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21519	NC_016842	CAAC	2	8	1020507	1020514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21520	NC_016842	CTAC	2	8	1020534	1020541	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21521	NC_016842	GCC	2	6	1020589	1020594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973457
21522	NC_016842	CGTG	2	8	1020611	1020618	0 %	25 %	50 %	25 %	378973457
21523	NC_016842	TG	4	8	1020617	1020624	0 %	50 %	50 %	0 %	378973457
21524	NC_016842	TGCG	2	8	1020656	1020663	0 %	25 %	50 %	25 %	378973457
21525	NC_016842	GATT	2	8	1020694	1020701	25 %	50 %	25 %	0 %	378973457
21526	NC_016842	AC	3	6	1020720	1020725	50 %	0 %	0 %	50 %	378973457
21527	NC_016842	TAC	2	6	1020760	1020765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973457
21528	NC_016842	CGT	2	6	1020957	1020962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973457
21529	NC_016842	ACA	2	6	1020979	1020984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973457
21530	NC_016842	AAG	2	6	1021010	1021015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973457
21531	NC_016842	ACC	2	6	1021044	1021049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973457
21532	NC_016842	CAA	2	6	1021091	1021096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973457
21533	NC_016842	CCA	2	6	1021217	1021222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973458
21534	NC_016842	GCAC	2	8	1021280	1021287	25 %	0 %	25 %	50 %	378973458
21535	NC_016842	CATAG	2	10	1021315	1021324	40 %	20 %	20 %	20 %	378973458
21536	NC_016842	GGA	2	6	1021327	1021332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973458
21537	NC_016842	A	6	6	1021332	1021337	100 %	0 %	0 %	0 %	378973458
21538	NC_016842	CG	3	6	1021415	1021420	0 %	0 %	50 %	50 %	378973458
21539	NC_016842	TGC	2	6	1021447	1021452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973458
21540	NC_016842	TCT	2	6	1021514	1021519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973458
21541	NC_016842	CCTG	2	8	1021550	1021557	0 %	25 %	25 %	50 %	378973458
21542	NC_016842	ACC	2	6	1021639	1021644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973458
21543	NC_016842	CCA	2	6	1021755	1021760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973458
21544	NC_016842	CG	4	8	1021763	1021770	0 %	0 %	50 %	50 %	378973458
21545	NC_016842	T	6	6	1021832	1021837	0 %	100 %	0 %	0 %	378973458
21546	NC_016842	CTG	2	6	1021858	1021863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973458
21547	NC_016842	AGGA	2	8	1021866	1021873	50 %	0 %	50 %	0 %	378973458
21548	NC_016842	GA	3	6	1021872	1021877	50 %	0 %	50 %	0 %	378973458
21549	NC_016842	GA	3	6	1021930	1021935	50 %	0 %	50 %	0 %	378973458
21550	NC_016842	AC	3	6	1021942	1021947	50 %	0 %	0 %	50 %	378973458
21551	NC_016842	CG	3	6	1021958	1021963	0 %	0 %	50 %	50 %	378973458
21552	NC_016842	TTCA	2	8	1022003	1022010	25 %	50 %	0 %	25 %	378973458
21553	NC_016842	CTC	2	6	1022035	1022040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21554	NC_016842	GC	3	6	1022059	1022064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21555	NC_016842	ACGG	2	8	1022077	1022084	25 %	0 %	50 %	25 %	378973459
21556	NC_016842	CTTCT	2	10	1022123	1022132	0 %	60 %	0 %	40 %	378973459
21557	NC_016842	GC	3	6	1022133	1022138	0 %	0 %	50 %	50 %	378973459
21558	NC_016842	AGC	2	6	1022142	1022147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21559	NC_016842	GCTC	2	8	1022154	1022161	0 %	25 %	25 %	50 %	378973459
21560	NC_016842	CTT	2	6	1022194	1022199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973459
21561	NC_016842	T	6	6	1022256	1022261	0 %	100 %	0 %	0 %	378973459
21562	NC_016842	CAT	2	6	1022401	1022406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973459
21563	NC_016842	CT	3	6	1022417	1022422	0 %	50 %	0 %	50 %	378973459
21564	NC_016842	CGC	2	6	1022534	1022539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973459
21565	NC_016842	ACC	2	6	1022585	1022590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973459
21566	NC_016842	ACC	2	6	1022663	1022668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973459
21567	NC_016842	GGT	2	6	1022728	1022733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973459
21568	NC_016842	GA	3	6	1022738	1022743	50 %	0 %	50 %	0 %	378973459
21569	NC_016842	GCT	2	6	1022812	1022817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21570	NC_016842	CTG	2	6	1022840	1022845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21571	NC_016842	A	6	6	1022851	1022856	100 %	0 %	0 %	0 %	378973459
21572	NC_016842	GCC	2	6	1022874	1022879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973459
21573	NC_016842	CTG	2	6	1022965	1022970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21574	NC_016842	CGT	2	6	1023020	1023025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21575	NC_016842	AT	3	6	1023053	1023058	50 %	50 %	0 %	0 %	378973459
21576	NC_016842	GAA	2	6	1023060	1023065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973459
21577	NC_016842	CAA	2	6	1023100	1023105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973459
21578	NC_016842	TCA	2	6	1023112	1023117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973459
21579	NC_016842	GGCA	2	8	1023148	1023155	25 %	0 %	50 %	25 %	378973459
21580	NC_016842	CTT	2	6	1023215	1023220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973459
21581	NC_016842	AAG	2	6	1023246	1023251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973459
21582	NC_016842	T	6	6	1023330	1023335	0 %	100 %	0 %	0 %	378973459
21583	NC_016842	TGC	2	6	1023345	1023350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21584	NC_016842	AC	3	6	1023509	1023514	50 %	0 %	0 %	50 %	378973459
21585	NC_016842	GAC	2	6	1023721	1023726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21586	NC_016842	CCA	2	6	1023760	1023765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973459
21587	NC_016842	AGCG	2	8	1023776	1023783	25 %	0 %	50 %	25 %	378973459
21588	NC_016842	GTG	2	6	1023795	1023800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973459
21589	NC_016842	A	6	6	1023906	1023911	100 %	0 %	0 %	0 %	378973459
21590	NC_016842	CAC	2	6	1023923	1023928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973459
21591	NC_016842	CCT	2	6	1023994	1023999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973459
21592	NC_016842	TCT	2	6	1024183	1024188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973459
21593	NC_016842	ACC	2	6	1024220	1024225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973459
21594	NC_016842	CTT	2	6	1024229	1024234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973459
21595	NC_016842	TTA	2	6	1024263	1024268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973459
21596	NC_016842	AAT	2	6	1024283	1024288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973459
21597	NC_016842	AC	3	6	1024352	1024357	50 %	0 %	0 %	50 %	378973459
21598	NC_016842	ATC	2	6	1024364	1024369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973459
21599	NC_016842	GCT	2	6	1024397	1024402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21600	NC_016842	CAT	2	6	1024411	1024416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973459
21601	NC_016842	ACCG	2	8	1024424	1024431	25 %	0 %	25 %	50 %	378973459
21602	NC_016842	TCT	2	6	1024444	1024449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973459
21603	NC_016842	ACC	2	6	1024520	1024525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973459
21604	NC_016842	CTT	2	6	1024556	1024561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973459
21605	NC_016842	AG	3	6	1024603	1024608	50 %	0 %	50 %	0 %	378973459
21606	NC_016842	TCGA	2	8	1024637	1024644	25 %	25 %	25 %	25 %	378973459
21607	NC_016842	TCC	2	6	1024739	1024744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973459
21608	NC_016842	GTA	2	6	1024832	1024837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973459
21609	NC_016842	CTGTG	2	10	1024964	1024973	0 %	40 %	40 %	20 %	378973459
21610	NC_016842	AGTC	2	8	1024997	1025004	25 %	25 %	25 %	25 %	378973459
21611	NC_016842	TCG	3	9	1025031	1025039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21612	NC_016842	CTT	2	6	1025068	1025073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973459
21613	NC_016842	A	7	7	1025111	1025117	100 %	0 %	0 %	0 %	378973459
21614	NC_016842	CG	3	6	1025131	1025136	0 %	0 %	50 %	50 %	378973459
21615	NC_016842	GCA	2	6	1025148	1025153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973459
21616	NC_016842	CCT	2	6	1025179	1025184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973459
21617	NC_016842	GGC	2	6	1025221	1025226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973459
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21619	NC_016842	GCA	2	6	1025286	1025291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973459
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21843	NC_016842	ACT	2	6	1036098	1036103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973474
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21847	NC_016842	CA	3	6	1036237	1036242	50 %	0 %	0 %	50 %	378973474
21848	NC_016842	GCT	2	6	1036255	1036260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973474
21849	NC_016842	CAG	2	6	1036304	1036309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973474
21850	NC_016842	CGAT	2	8	1036371	1036378	25 %	25 %	25 %	25 %	378973474
21851	NC_016842	GAG	2	6	1036499	1036504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973474
21852	NC_016842	AAG	2	6	1036506	1036511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973474
21853	NC_016842	CA	6	12	1036601	1036612	50 %	0 %	0 %	50 %	378973474
21854	NC_016842	ACGC	2	8	1036640	1036647	25 %	0 %	25 %	50 %	378973474
21855	NC_016842	CAC	2	6	1036688	1036693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973474
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21989	NC_016842	TGC	2	6	1042783	1042788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21998	NC_016842	C	7	7	1043422	1043428	0 %	0 %	0 %	100 %	378973481
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