MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20503	NC_016842	ACG	2	6	973403	973408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973408
20504	NC_016842	CGA	2	6	973461	973466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973408
20505	NC_016842	TCA	2	6	973484	973489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973408
20506	NC_016842	GGC	2	6	973544	973549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20507	NC_016842	CCG	2	6	973659	973664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973409
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20509	NC_016842	CG	4	8	973873	973880	0 %	0 %	50 %	50 %	378973409
20510	NC_016842	CTG	2	6	973940	973945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973409
20511	NC_016842	CACG	2	8	974060	974067	25 %	0 %	25 %	50 %	378973409
20512	NC_016842	CA	3	6	974107	974112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20513	NC_016842	AC	3	6	974143	974148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20514	NC_016842	GGC	2	6	974189	974194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20515	NC_016842	CAC	2	6	974202	974207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20516	NC_016842	CAC	2	6	974254	974259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973410
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20518	NC_016842	TCA	2	6	974291	974296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973410
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20544	NC_016842	GAAA	2	8	975905	975912	75 %	0 %	25 %	0 %	378973412
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20547	NC_016842	N	47	47	976111	976157	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20549	NC_016842	N	59	59	976259	976317	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20554	NC_016842	TCC	2	6	976496	976501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20555	NC_016842	CAA	2	6	976529	976534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20558	NC_016842	N	25	25	976656	976680	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20563	NC_016842	CTT	2	6	977213	977218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20573	NC_016842	CCACG	2	10	978006	978015	20 %	0 %	20 %	60 %	378973414
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20575	NC_016842	CCGGAG	2	12	978066	978077	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378973414
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20588	NC_016842	GCAGGA	2	12	978413	978424	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378973414
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20591	NC_016842	CG	3	6	978624	978629	0 %	0 %	50 %	50 %	378973414
20592	NC_016842	CA	5	10	978664	978673	50 %	0 %	0 %	50 %	378973414
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20610	NC_016842	CG	4	8	979339	979346	0 %	0 %	50 %	50 %	378973414
20611	NC_016842	GCC	2	6	979375	979380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973414
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20996	NC_016842	CCA	2	6	995915	995920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973434
20997	NC_016842	ACAG	2	8	995923	995930	50 %	0 %	25 %	25 %	378973434
20998	NC_016842	AG	3	6	995929	995934	50 %	0 %	50 %	0 %	378973434
20999	NC_016842	GAT	2	6	995965	995970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973434
21000	NC_016842	AGA	2	6	995985	995990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973434

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