MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_016842	GAA	2	6	876399	876404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973318
18503	NC_016842	CG	3	6	876474	876479	0 %	0 %	50 %	50 %	378973318
18504	NC_016842	AC	3	6	876539	876544	50 %	0 %	0 %	50 %	378973318
18505	NC_016842	TG	4	8	876548	876555	0 %	50 %	50 %	0 %	378973318
18506	NC_016842	TGC	2	6	876563	876568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973318
18507	NC_016842	TTCC	2	8	876825	876832	0 %	50 %	0 %	50 %	378973318
18508	NC_016842	T	7	7	876920	876926	0 %	100 %	0 %	0 %	378973318
18509	NC_016842	GCG	2	6	876977	876982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973318
18510	NC_016842	CAAA	2	8	876995	877002	75 %	0 %	0 %	25 %	378973318
18511	NC_016842	C	6	6	877056	877061	0 %	0 %	0 %	100 %	378973318
18512	NC_016842	A	6	6	877081	877086	100 %	0 %	0 %	0 %	378973318
18513	NC_016842	CG	4	8	877113	877120	0 %	0 %	50 %	50 %	378973318
18514	NC_016842	GAA	2	6	877181	877186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973318
18515	NC_016842	CACGCG	2	12	877219	877230	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378973318
18516	NC_016842	CTCG	2	8	877275	877282	0 %	25 %	25 %	50 %	378973318
18517	NC_016842	AC	3	6	877292	877297	50 %	0 %	0 %	50 %	378973318
18518	NC_016842	ACC	2	6	877442	877447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973319
18519	NC_016842	GCA	2	6	877480	877485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973319
18520	NC_016842	CG	3	6	877631	877636	0 %	0 %	50 %	50 %	378973319
18521	NC_016842	CTT	2	6	877643	877648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973319
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18526	NC_016842	TGC	2	6	877866	877871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973319
18527	NC_016842	TGC	2	6	877911	877916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973319
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18540	NC_016842	GCA	2	6	878302	878307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973319
18541	NC_016842	GC	3	6	878369	878374	0 %	0 %	50 %	50 %	378973319
18542	NC_016842	GC	4	8	878404	878411	0 %	0 %	50 %	50 %	378973319
18543	NC_016842	ACGT	2	8	878569	878576	25 %	25 %	25 %	25 %	378973319
18544	NC_016842	CGCT	2	8	878589	878596	0 %	25 %	25 %	50 %	378973319
18545	NC_016842	CT	3	6	878787	878792	0 %	50 %	0 %	50 %	378973319
18546	NC_016842	CA	3	6	878823	878828	50 %	0 %	0 %	50 %	378973319
18547	NC_016842	AAG	2	6	878852	878857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_016842	CA	3	6	878858	878863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18549	NC_016842	GAA	2	6	878886	878891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_016842	TG	3	6	878910	878915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_016842	GCAC	2	8	878999	879006	25 %	0 %	25 %	50 %	378973320
18552	NC_016842	TTG	2	6	879051	879056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973320
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18554	NC_016842	TGA	2	6	879142	879147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973320
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18556	NC_016842	GTT	2	6	879226	879231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973321
18557	NC_016842	GGA	2	6	879271	879276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973321
18558	NC_016842	TCC	2	6	879296	879301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973321
18559	NC_016842	GAG	2	6	879306	879311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973321
18560	NC_016842	CGA	2	6	879385	879390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973321
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18563	NC_016842	TC	3	6	879517	879522	0 %	50 %	0 %	50 %	378973322
18564	NC_016842	GCC	2	6	879682	879687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973322
18565	NC_016842	GAG	2	6	879826	879831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973322
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18568	NC_016842	T	7	7	879896	879902	0 %	100 %	0 %	0 %	378973322
18569	NC_016842	GGC	2	6	879918	879923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973322
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18571	NC_016842	GTA	2	6	880034	880039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973322
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18575	NC_016842	CCGC	2	8	880262	880269	0 %	0 %	25 %	75 %	378973323
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18578	NC_016842	ATCT	3	12	880423	880434	25 %	50 %	0 %	25 %	378973323
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18581	NC_016842	AGA	2	6	880485	880490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973323
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18583	NC_016842	GCG	2	6	880551	880556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973323
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18588	NC_016842	TGA	2	6	880773	880778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973323
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18590	NC_016842	GAG	2	6	880859	880864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973323
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18593	NC_016842	TGCA	2	8	880960	880967	25 %	25 %	25 %	25 %	378973323
18594	NC_016842	CG	3	6	880974	880979	0 %	0 %	50 %	50 %	378973323
18595	NC_016842	CAA	2	6	881050	881055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973323
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18598	NC_016842	AC	3	6	881277	881282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18599	NC_016842	GTA	2	6	881295	881300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18601	NC_016842	GC	3	6	881549	881554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18602	NC_016842	GCT	2	6	881772	881777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18603	NC_016842	ACGG	2	8	881874	881881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18604	NC_016842	GAA	2	6	881915	881920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18605	NC_016842	GTG	2	6	881952	881957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_016842	CTC	2	6	881983	881988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18607	NC_016842	CG	3	6	882029	882034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18608	NC_016842	ACGC	2	8	882059	882066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18609	NC_016842	T	6	6	882076	882081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_016842	CTC	2	6	882084	882089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18611	NC_016842	GT	3	6	882114	882119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18612	NC_016842	T	8	8	882133	882140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18613	NC_016842	GCA	2	6	882195	882200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18614	NC_016842	AGC	2	6	882260	882265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18615	NC_016842	CGC	2	6	882274	882279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18616	NC_016842	GGA	2	6	882310	882315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18617	NC_016842	AC	3	6	882357	882362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18618	NC_016842	AAAGAC	2	12	882457	882468	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18619	NC_016842	GGCT	2	8	882634	882641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18620	NC_016842	TCC	2	6	882683	882688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18621	NC_016842	GCA	2	6	882692	882697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18622	NC_016842	GC	3	6	882721	882726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18623	NC_016842	TTGT	2	8	882752	882759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18624	NC_016842	CGTG	2	8	882776	882783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18625	NC_016842	GCAC	2	8	882786	882793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18626	NC_016842	CGAA	2	8	882852	882859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18983	NC_016842	CCTCA	2	10	900839	900848	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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18994	NC_016842	TCT	2	6	901531	901536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973346
18995	NC_016842	GAAA	2	8	901542	901549	75 %	0 %	25 %	0 %	378973346
18996	NC_016842	TGA	2	6	901597	901602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973346
18997	NC_016842	TGC	2	6	901665	901670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973346
18998	NC_016842	AC	3	6	901671	901676	50 %	0 %	0 %	50 %	378973346
18999	NC_016842	A	6	6	901697	901702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19000	NC_016842	AGC	2	6	901723	901728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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