MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_016842	TCT	2	6	782720	782725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973221
16503	NC_016842	CTG	2	6	782754	782759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973221
16504	NC_016842	T	6	6	782804	782809	0 %	100 %	0 %	0 %	378973221
16505	NC_016842	AGC	2	6	782832	782837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973221
16506	NC_016842	AC	3	6	782840	782845	50 %	0 %	0 %	50 %	378973221
16507	NC_016842	TGA	2	6	782880	782885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973221
16508	NC_016842	A	9	9	782906	782914	100 %	0 %	0 %	0 %	378973221
16509	NC_016842	A	6	6	782943	782948	100 %	0 %	0 %	0 %	378973221
16510	NC_016842	TAT	2	6	782957	782962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973221
16511	NC_016842	TGCG	2	8	782968	782975	0 %	25 %	50 %	25 %	378973221
16512	NC_016842	CTA	2	6	783047	783052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973221
16513	NC_016842	ACT	2	6	783096	783101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973222
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16515	NC_016842	TAC	2	6	783142	783147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973222
16516	NC_016842	CTT	2	6	783180	783185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973222
16517	NC_016842	A	7	7	783219	783225	100 %	0 %	0 %	0 %	378973222
16518	NC_016842	CGT	2	6	783256	783261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973222
16519	NC_016842	CCT	2	6	783282	783287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973222
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16521	NC_016842	GAG	2	6	783413	783418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973222
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16529	NC_016842	CCT	2	6	783885	783890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973222
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16532	NC_016842	CAA	2	6	784104	784109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973222
16533	NC_016842	T	6	6	784218	784223	0 %	100 %	0 %	0 %	378973222
16534	NC_016842	AC	3	6	784288	784293	50 %	0 %	0 %	50 %	378973222
16535	NC_016842	A	6	6	784300	784305	100 %	0 %	0 %	0 %	378973222
16536	NC_016842	AATAA	2	10	784363	784372	80 %	20 %	0 %	0 %	378973222
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16540	NC_016842	TGC	2	6	784531	784536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973222
16541	NC_016842	CCCT	2	8	784544	784551	0 %	25 %	0 %	75 %	378973222
16542	NC_016842	TAA	2	6	784599	784604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973222
16543	NC_016842	TCCA	2	8	784645	784652	25 %	25 %	0 %	50 %	378973222
16544	NC_016842	A	7	7	784660	784666	100 %	0 %	0 %	0 %	378973222
16545	NC_016842	CTT	3	9	784704	784712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973222
16546	NC_016842	GCA	2	6	784787	784792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973222
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16553	NC_016842	CAA	2	6	785052	785057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973222
16554	NC_016842	AAGAT	2	10	785087	785096	60 %	20 %	20 %	0 %	378973222
16555	NC_016842	AAC	2	6	785137	785142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973222
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16558	NC_016842	AGT	2	6	785188	785193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973222
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16561	NC_016842	TCT	2	6	785365	785370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973223
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16605	NC_016842	CCAC	2	8	787244	787251	25 %	0 %	0 %	75 %	378973225
16606	NC_016842	GAG	2	6	787253	787258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973225
16607	NC_016842	ACC	2	6	787395	787400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973225
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16609	NC_016842	CA	3	6	787448	787453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16610	NC_016842	CTAT	2	8	787491	787498	25 %	50 %	0 %	25 %	378973226
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16988	NC_016842	TTGC	2	8	804684	804691	0 %	50 %	25 %	25 %	378973245
16989	NC_016842	GAC	2	6	804753	804758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973245
16990	NC_016842	AAAC	2	8	804836	804843	75 %	0 %	0 %	25 %	378973245
16991	NC_016842	ACC	2	6	804844	804849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973245
16992	NC_016842	GC	3	6	804855	804860	0 %	0 %	50 %	50 %	378973245
16993	NC_016842	TCAT	2	8	804871	804878	25 %	50 %	0 %	25 %	378973245
16994	NC_016842	ATCGC	2	10	804892	804901	20 %	20 %	20 %	40 %	378973245
16995	NC_016842	GCGT	2	8	804969	804976	0 %	25 %	50 %	25 %	378973245
16996	NC_016842	ACTG	2	8	805007	805014	25 %	25 %	25 %	25 %	378973245
16997	NC_016842	A	7	7	805047	805053	100 %	0 %	0 %	0 %	378973245
16998	NC_016842	GC	3	6	805054	805059	0 %	0 %	50 %	50 %	378973245
16999	NC_016842	CT	3	6	805083	805088	0 %	50 %	0 %	50 %	378973245
17000	NC_016842	GAA	2	6	805125	805130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973245

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