MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15003	NC_016842	CAAA	2	8	706928	706935	75 %	0 %	0 %	25 %	378973151
15004	NC_016842	A	7	7	706973	706979	100 %	0 %	0 %	0 %	378973151
15005	NC_016842	ACTG	2	8	707007	707014	25 %	25 %	25 %	25 %	378973151
15006	NC_016842	TCTG	2	8	707164	707171	0 %	50 %	25 %	25 %	378973152
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15009	NC_016842	TCT	2	6	707295	707300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973152
15010	NC_016842	AATT	2	8	707440	707447	50 %	50 %	0 %	0 %	378973152
15011	NC_016842	AT	3	6	707452	707457	50 %	50 %	0 %	0 %	378973152
15012	NC_016842	CGG	2	6	707495	707500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973152
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15015	NC_016842	TGC	2	6	708108	708113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973152
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15017	NC_016842	CG	3	6	708279	708284	0 %	0 %	50 %	50 %	378973152
15018	NC_016842	CTG	2	6	708296	708301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973152
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15020	NC_016842	TCCT	2	8	708619	708626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15029	NC_016842	TGC	2	6	709108	709113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973154
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15035	NC_016842	GCA	2	6	709387	709392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973154
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15038	NC_016842	TACA	2	8	709518	709525	50 %	25 %	0 %	25 %	378973154
15039	NC_016842	CTG	2	6	709563	709568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973154
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15041	NC_016842	TCCT	2	8	709590	709597	0 %	50 %	0 %	50 %	378973154
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15062	NC_016842	CAAAC	2	10	710857	710866	60 %	0 %	0 %	40 %	378973155
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15071	NC_016842	CTTA	2	8	711410	711417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15094	NC_016842	TCT	2	6	712521	712526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973156
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15096	NC_016842	CGCGC	2	10	712703	712712	0 %	0 %	40 %	60 %	378973156
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15100	NC_016842	ACGT	2	8	712884	712891	25 %	25 %	25 %	25 %	378973156
15101	NC_016842	ACA	2	6	712939	712944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973156
15102	NC_016842	GCT	2	6	712977	712982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973156
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15104	NC_016842	GC	3	6	713069	713074	0 %	0 %	50 %	50 %	378973156
15105	NC_016842	AAG	2	6	713263	713268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973156
15106	NC_016842	T	9	9	713271	713279	0 %	100 %	0 %	0 %	378973156
15107	NC_016842	CTT	2	6	713284	713289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973156
15108	NC_016842	AGC	2	6	713303	713308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973156
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15115	NC_016842	CAA	2	6	713759	713764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973157
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15122	NC_016842	TTA	2	6	713954	713959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973157
15123	NC_016842	CACC	2	8	713978	713985	25 %	0 %	0 %	75 %	378973157
15124	NC_016842	ATC	2	6	714103	714108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973157
15125	NC_016842	TTCA	2	8	714168	714175	25 %	50 %	0 %	25 %	378973157
15126	NC_016842	GAT	2	6	714246	714251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973158
15127	NC_016842	TGC	2	6	714264	714269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973158
15128	NC_016842	TGA	2	6	714430	714435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973158
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15130	NC_016842	GCA	2	6	714569	714574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973158
15131	NC_016842	CA	4	8	714622	714629	50 %	0 %	0 %	50 %	378973158
15132	NC_016842	AGG	2	6	714653	714658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973158
15133	NC_016842	GCT	3	9	714747	714755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973159
15134	NC_016842	GTA	2	6	714796	714801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973159
15135	NC_016842	GAC	2	6	714832	714837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973159
15136	NC_016842	TCT	2	6	714888	714893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973159
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15142	NC_016842	CCT	2	6	715128	715133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973159
15143	NC_016842	ATA	2	6	715288	715293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973159
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15146	NC_016842	AGC	2	6	715397	715402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973159
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15150	NC_016842	AG	3	6	715693	715698	50 %	0 %	50 %	0 %	378973159
15151	NC_016842	GAAA	2	8	715877	715884	75 %	0 %	25 %	0 %	378973159
15152	NC_016842	AGG	2	6	715948	715953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973159
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15154	NC_016842	GACA	2	8	716041	716048	50 %	0 %	25 %	25 %	378973159
15155	NC_016842	GCC	2	6	716252	716257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973159
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15157	NC_016842	TGA	2	6	716319	716324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973159
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15227	NC_016842	ATC	2	6	720052	720057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973162
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15230	NC_016842	ACT	2	6	720147	720152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973162
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15232	NC_016842	TTCT	2	8	720214	720221	0 %	75 %	0 %	25 %	378973163
15233	NC_016842	TC	3	6	720230	720235	0 %	50 %	0 %	50 %	378973163
15234	NC_016842	CCTGTA	2	12	720275	720286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973163
15235	NC_016842	TAC	2	6	720297	720302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973163
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15238	NC_016842	CAT	2	6	720452	720457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973163
15239	NC_016842	A	6	6	720478	720483	100 %	0 %	0 %	0 %	378973163
15240	NC_016842	AG	3	6	720521	720526	50 %	0 %	50 %	0 %	378973163
15241	NC_016842	TAT	2	6	720576	720581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973163
15242	NC_016842	GGCA	2	8	720590	720597	25 %	0 %	50 %	25 %	378973163
15243	NC_016842	A	6	6	720609	720614	100 %	0 %	0 %	0 %	378973163
15244	NC_016842	CG	3	6	720629	720634	0 %	0 %	50 %	50 %	378973163
15245	NC_016842	TCT	2	6	720646	720651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973163
15246	NC_016842	CGTAT	2	10	720667	720676	20 %	40 %	20 %	20 %	378973163
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15250	NC_016842	GCAG	2	8	720767	720774	25 %	0 %	50 %	25 %	378973163
15251	NC_016842	CGGA	2	8	720823	720830	25 %	0 %	50 %	25 %	378973163
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15273	NC_016842	CTG	2	6	722323	722328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973166
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15330	NC_016842	CTC	2	6	725214	725219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15331	NC_016842	AAGAC	2	10	725253	725262	60 %	0 %	20 %	20 %	378973168
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15345	NC_016842	A	6	6	725812	725817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15346	NC_016842	CTG	2	6	725863	725868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15350	NC_016842	TGG	2	6	725982	725987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973169
15351	NC_016842	CGTA	2	8	726137	726144	25 %	25 %	25 %	25 %	378973169
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15354	NC_016842	T	7	7	726339	726345	0 %	100 %	0 %	0 %	378973169
15355	NC_016842	TAGTG	2	10	726372	726381	20 %	40 %	40 %	0 %	378973169
15356	NC_016842	TCG	2	6	726503	726508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973169
15357	NC_016842	ATC	2	6	726530	726535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973169
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15359	NC_016842	GC	3	6	726691	726696	0 %	0 %	50 %	50 %	378973169
15360	NC_016842	GAA	2	6	726701	726706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973169
15361	NC_016842	AC	3	6	726737	726742	50 %	0 %	0 %	50 %	378973169
15362	NC_016842	GTT	2	6	726772	726777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973169
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15364	NC_016842	GCG	2	6	727085	727090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15365	NC_016842	GTG	2	6	727116	727121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15487	NC_016842	CTC	2	6	732635	732640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973176
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15490	NC_016842	TCA	2	6	732840	732845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973176
15491	NC_016842	ATA	2	6	732863	732868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973176
15492	NC_016842	TC	3	6	732896	732901	0 %	50 %	0 %	50 %	378973176
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