MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016842	AAG	3	9	660761	660769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973114
14003	NC_016842	GCT	2	6	660771	660776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973114
14004	NC_016842	TCC	2	6	660789	660794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_016842	GCACG	2	10	660838	660847	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14006	NC_016842	CG	3	6	660846	660851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14007	NC_016842	CAC	2	6	660875	660880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14008	NC_016842	AC	3	6	660918	660923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_016842	CG	3	6	660990	660995	0 %	0 %	50 %	50 %	378973115
14010	NC_016842	AGA	2	6	661070	661075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973115
14011	NC_016842	CTC	2	6	661090	661095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973115
14012	NC_016842	AG	3	6	661100	661105	50 %	0 %	50 %	0 %	378973115
14013	NC_016842	ACG	2	6	661125	661130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_016842	GCG	2	6	661164	661169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_016842	GCT	2	6	661212	661217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_016842	GCGT	2	8	661258	661265	0 %	25 %	50 %	25 %	378973116
14017	NC_016842	C	6	6	661302	661307	0 %	0 %	0 %	100 %	378973116
14018	NC_016842	TCC	2	6	661495	661500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973116
14019	NC_016842	CGCT	2	8	661510	661517	0 %	25 %	25 %	50 %	378973116
14020	NC_016842	TAC	2	6	661535	661540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973116
14021	NC_016842	TCCCC	2	10	661573	661582	0 %	20 %	0 %	80 %	378973116
14022	NC_016842	GC	3	6	661607	661612	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14023	NC_016842	CTG	2	6	661642	661647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973116
14024	NC_016842	AGA	2	6	661663	661668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973116
14025	NC_016842	TGCG	2	8	661690	661697	0 %	25 %	50 %	25 %	378973116
14026	NC_016842	GC	5	10	661709	661718	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14027	NC_016842	CA	3	6	661809	661814	50 %	0 %	0 %	50 %	378973116
14028	NC_016842	ACT	2	6	661866	661871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973116
14029	NC_016842	GC	3	6	661890	661895	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14030	NC_016842	GGCA	2	8	661916	661923	25 %	0 %	50 %	25 %	378973116
14031	NC_016842	GAC	2	6	661947	661952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973116
14032	NC_016842	T	6	6	661953	661958	0 %	100 %	0 %	0 %	378973116
14033	NC_016842	GC	3	6	661968	661973	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14034	NC_016842	GCC	2	6	662074	662079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973116
14035	NC_016842	TGG	2	6	662098	662103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973116
14036	NC_016842	ACTG	2	8	662130	662137	25 %	25 %	25 %	25 %	378973116
14037	NC_016842	GCA	2	6	662178	662183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973116
14038	NC_016842	GC	3	6	662194	662199	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14039	NC_016842	CCTT	2	8	662209	662216	0 %	50 %	0 %	50 %	378973116
14040	NC_016842	GC	3	6	662222	662227	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14041	NC_016842	GCA	2	6	662231	662236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973116
14042	NC_016842	GC	3	6	662245	662250	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14043	NC_016842	AC	3	6	662257	662262	50 %	0 %	0 %	50 %	378973116
14044	NC_016842	CG	3	6	662270	662275	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14045	NC_016842	GC	3	6	662283	662288	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14046	NC_016842	CG	3	6	662343	662348	0 %	0 %	50 %	50 %	378973116
14047	NC_016842	ACT	2	6	662384	662389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973116
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14050	NC_016842	TGC	2	6	662752	662757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973116
14051	NC_016842	CGC	2	6	662809	662814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973116
14052	NC_016842	CGG	2	6	662904	662909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973117
14053	NC_016842	ACGC	2	8	662912	662919	25 %	0 %	25 %	50 %	378973117
14054	NC_016842	CGG	2	6	662932	662937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973117
14055	NC_016842	CTC	2	6	662945	662950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973117
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14057	NC_016842	GTCAG	2	10	662988	662997	20 %	20 %	40 %	20 %	378973117
14058	NC_016842	CTC	2	6	663012	663017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973117
14059	NC_016842	GTC	2	6	663023	663028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973117
14060	NC_016842	GCA	2	6	663030	663035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973117
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14062	NC_016842	CGC	2	6	663076	663081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973117
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14064	NC_016842	GCC	2	6	663158	663163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973117
14065	NC_016842	CGA	2	6	663182	663187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973117
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14068	NC_016842	CA	3	6	663302	663307	50 %	0 %	0 %	50 %	378973117
14069	NC_016842	TG	3	6	663310	663315	0 %	50 %	50 %	0 %	378973117
14070	NC_016842	GTT	2	6	663326	663331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973117
14071	NC_016842	GC	3	6	663353	663358	0 %	0 %	50 %	50 %	378973117
14072	NC_016842	AGA	2	6	663461	663466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973117
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14079	NC_016842	CAGC	2	8	663850	663857	25 %	0 %	25 %	50 %	378973117
14080	NC_016842	GC	4	8	663940	663947	0 %	0 %	50 %	50 %	378973117
14081	NC_016842	CTC	2	6	663958	663963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973117
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14088	NC_016842	CA	4	8	664412	664419	50 %	0 %	0 %	50 %	378973117
14089	NC_016842	CGG	3	9	664424	664432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973117
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14091	NC_016842	TAC	2	6	664560	664565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973117
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14093	NC_016842	GT	3	6	664579	664584	0 %	50 %	50 %	0 %	378973117
14094	NC_016842	GC	3	6	664635	664640	0 %	0 %	50 %	50 %	378973117
14095	NC_016842	CAC	2	6	664697	664702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973117
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14097	NC_016842	TTA	2	6	664852	664857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973117
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14099	NC_016842	CTC	2	6	665073	665078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973118
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14103	NC_016842	CGG	2	6	665301	665306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973118
14104	NC_016842	TC	3	6	665315	665320	0 %	50 %	0 %	50 %	378973118
14105	NC_016842	GAG	2	6	665358	665363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973118
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14107	NC_016842	TGCG	2	8	665431	665438	0 %	25 %	50 %	25 %	378973118
14108	NC_016842	CG	3	6	665476	665481	0 %	0 %	50 %	50 %	378973118
14109	NC_016842	GA	3	6	665506	665511	50 %	0 %	50 %	0 %	378973118
14110	NC_016842	A	8	8	665511	665518	100 %	0 %	0 %	0 %	378973118
14111	NC_016842	ATC	2	6	665658	665663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973118
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14114	NC_016842	AGG	2	6	665816	665821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973118
14115	NC_016842	AAGT	2	8	665847	665854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_016842	GC	3	6	665870	665875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14117	NC_016842	CAG	2	6	665887	665892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_016842	ACGT	2	8	665969	665976	25 %	25 %	25 %	25 %	378973119
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