MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_016842	GCAG	2	8	638308	638315	25 %	0 %	50 %	25 %	378973095
13503	NC_016842	TGCA	2	8	638361	638368	25 %	25 %	25 %	25 %	378973095
13504	NC_016842	GCG	2	6	638383	638388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973095
13505	NC_016842	AAG	2	6	638451	638456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973095
13506	NC_016842	A	6	6	638598	638603	100 %	0 %	0 %	0 %	378973096
13507	NC_016842	TG	3	6	638637	638642	0 %	50 %	50 %	0 %	378973096
13508	NC_016842	GCG	2	6	638669	638674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973096
13509	NC_016842	GGT	2	6	638781	638786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973096
13510	NC_016842	CG	3	6	638866	638871	0 %	0 %	50 %	50 %	378973096
13511	NC_016842	CAGA	2	8	638903	638910	50 %	0 %	25 %	25 %	378973096
13512	NC_016842	GAA	2	6	639081	639086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973096
13513	NC_016842	TGC	2	6	639099	639104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973096
13514	NC_016842	GTG	2	6	639133	639138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973096
13515	NC_016842	ATTGG	2	10	639238	639247	20 %	40 %	40 %	0 %	378973096
13516	NC_016842	GCG	2	6	639256	639261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973096
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13520	NC_016842	CAATC	2	10	639533	639542	40 %	20 %	0 %	40 %	378973096
13521	NC_016842	GTG	2	6	639678	639683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973096
13522	NC_016842	GTC	2	6	639768	639773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973096
13523	NC_016842	CG	3	6	639809	639814	0 %	0 %	50 %	50 %	378973096
13524	NC_016842	TTG	2	6	639823	639828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973096
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13528	NC_016842	CTG	2	6	640130	640135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973096
13529	NC_016842	GGT	2	6	640227	640232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973096
13530	NC_016842	CGT	2	6	640351	640356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973096
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13554	NC_016842	GTCT	2	8	641334	641341	0 %	50 %	25 %	25 %	378973097
13555	NC_016842	GC	3	6	641395	641400	0 %	0 %	50 %	50 %	378973097
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13560	NC_016842	GCG	2	6	641679	641684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973097
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13604	NC_016842	A	6	6	643437	643442	100 %	0 %	0 %	0 %	378973099
13605	NC_016842	CT	3	6	643653	643658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13606	NC_016842	AG	3	6	643662	643667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_016842	TACA	2	8	643698	643705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13609	NC_016842	GA	3	6	643761	643766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_016842	GCC	2	6	643770	643775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13611	NC_016842	GTC	2	6	643802	643807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_016842	GC	3	6	643876	643881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13613	NC_016842	ACC	2	6	643894	643899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13614	NC_016842	CA	3	6	643917	643922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13615	NC_016842	CGCAC	2	10	643933	643942	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13616	NC_016842	GC	3	6	644034	644039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13618	NC_016842	GCC	2	6	644163	644168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13619	NC_016842	A	6	6	644169	644174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_016842	CAC	2	6	644187	644192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13621	NC_016842	T	8	8	644207	644214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_016842	TGC	2	6	644277	644282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13624	NC_016842	TCG	2	6	644336	644341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973100
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13990	NC_016842	GA	3	6	660217	660222	50 %	0 %	50 %	0 %	378973114
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13992	NC_016842	CAC	2	6	660331	660336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973114
13993	NC_016842	CA	3	6	660354	660359	50 %	0 %	0 %	50 %	378973114
13994	NC_016842	CAG	2	6	660486	660491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973114
13995	NC_016842	CCT	2	6	660510	660515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973114
13996	NC_016842	TCA	2	6	660521	660526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973114
13997	NC_016842	CCT	2	6	660549	660554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973114
13998	NC_016842	CAC	2	6	660616	660621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973114
13999	NC_016842	TCA	2	6	660657	660662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973114
14000	NC_016842	CTG	2	6	660712	660717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973114

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