MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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12623	NC_016842	TTC	2	6	598064	598069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973061
12624	NC_016842	GCT	2	6	598134	598139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973061
12625	NC_016842	CTG	2	6	598145	598150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973061
12626	NC_016842	TGC	3	9	598179	598187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973061
12627	NC_016842	CGTG	2	8	598196	598203	0 %	25 %	50 %	25 %	378973061
12628	NC_016842	GGC	2	6	598289	598294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973061
12629	NC_016842	GTACG	2	10	598333	598342	20 %	20 %	40 %	20 %	378973061
12630	NC_016842	AAT	2	6	598358	598363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973061
12631	NC_016842	CAG	2	6	598409	598414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973061
12632	NC_016842	TAC	2	6	598415	598420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973061
12633	NC_016842	ATCC	2	8	598449	598456	25 %	25 %	0 %	50 %	378973061
12634	NC_016842	GC	3	6	598479	598484	0 %	0 %	50 %	50 %	378973061
12635	NC_016842	A	7	7	598504	598510	100 %	0 %	0 %	0 %	378973061
12636	NC_016842	GCT	2	6	598532	598537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973061
12637	NC_016842	CGA	2	6	598591	598596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973061
12638	NC_016842	TCG	2	6	598602	598607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973061
12639	NC_016842	GC	3	6	598623	598628	0 %	0 %	50 %	50 %	378973061
12640	NC_016842	GCC	2	6	598679	598684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973062
12641	NC_016842	AGC	2	6	598707	598712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973062
12642	NC_016842	CAC	2	6	598715	598720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973062
12643	NC_016842	AGA	2	6	598814	598819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973062
12644	NC_016842	CAC	2	6	598820	598825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973062
12645	NC_016842	AC	4	8	598834	598841	50 %	0 %	0 %	50 %	378973062
12646	NC_016842	CAC	2	6	598856	598861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973062
12647	NC_016842	C	6	6	598877	598882	0 %	0 %	0 %	100 %	378973062
12648	NC_016842	AGC	2	6	598883	598888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973062
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12651	NC_016842	CAC	2	6	599027	599032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973062
12652	NC_016842	CCT	2	6	599071	599076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973062
12653	NC_016842	GC	4	8	599110	599117	0 %	0 %	50 %	50 %	378973062
12654	NC_016842	GC	3	6	599134	599139	0 %	0 %	50 %	50 %	378973062
12655	NC_016842	AACC	2	8	599157	599164	50 %	0 %	0 %	50 %	378973062
12656	NC_016842	AAG	2	6	599165	599170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973062
12657	NC_016842	AC	3	6	599200	599205	50 %	0 %	0 %	50 %	378973062
12658	NC_016842	CGCC	2	8	599236	599243	0 %	0 %	25 %	75 %	378973062
12659	NC_016842	GC	3	6	599261	599266	0 %	0 %	50 %	50 %	378973062
12660	NC_016842	GAC	2	6	599292	599297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973062
12661	NC_016842	CG	3	6	599385	599390	0 %	0 %	50 %	50 %	378973062
12662	NC_016842	ACAA	2	8	599397	599404	75 %	0 %	0 %	25 %	378973062
12663	NC_016842	CAC	2	6	599580	599585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973062
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12666	NC_016842	GT	3	6	599648	599653	0 %	50 %	50 %	0 %	378973062
12667	NC_016842	CTG	2	6	599672	599677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973062
12668	NC_016842	TTC	2	6	599714	599719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973062
12669	NC_016842	CG	3	6	599746	599751	0 %	0 %	50 %	50 %	378973063
12670	NC_016842	GC	3	6	599814	599819	0 %	0 %	50 %	50 %	378973063
12671	NC_016842	TGC	2	6	599853	599858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973063
12672	NC_016842	CA	3	6	599898	599903	50 %	0 %	0 %	50 %	378973063
12673	NC_016842	TCG	2	6	599916	599921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973063
12674	NC_016842	CG	3	6	599920	599925	0 %	0 %	50 %	50 %	378973063
12675	NC_016842	GTA	2	6	599945	599950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973063
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12678	NC_016842	CTG	2	6	599989	599994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973063
12679	NC_016842	CTG	2	6	600010	600015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973063
12680	NC_016842	GC	5	10	600073	600082	0 %	0 %	50 %	50 %	378973063
12681	NC_016842	GTA	2	6	600092	600097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973063
12682	NC_016842	AC	3	6	600106	600111	50 %	0 %	0 %	50 %	378973063
12683	NC_016842	CTG	2	6	600191	600196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973063
12684	NC_016842	AG	3	6	600305	600310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12685	NC_016842	CGAA	2	8	600337	600344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12686	NC_016842	A	7	7	600435	600441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12687	NC_016842	AACC	2	8	600462	600469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12688	NC_016842	CTC	2	6	600554	600559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973064
12689	NC_016842	CCTA	2	8	600597	600604	25 %	25 %	0 %	50 %	378973064
12690	NC_016842	TG	3	6	600663	600668	0 %	50 %	50 %	0 %	378973064
12691	NC_016842	ATGC	2	8	600680	600687	25 %	25 %	25 %	25 %	378973064
12692	NC_016842	GGAT	2	8	600730	600737	25 %	25 %	50 %	0 %	378973064
12693	NC_016842	A	7	7	600771	600777	100 %	0 %	0 %	0 %	378973064
12694	NC_016842	T	8	8	600830	600837	0 %	100 %	0 %	0 %	378973064
12695	NC_016842	GTTT	2	8	600849	600856	0 %	75 %	25 %	0 %	378973064
12696	NC_016842	CTT	2	6	600892	600897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973064
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12699	NC_016842	TCGC	2	8	601074	601081	0 %	25 %	25 %	50 %	378973064
12700	NC_016842	GTT	2	6	601096	601101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973064
12701	NC_016842	TTTC	2	8	601123	601130	0 %	75 %	0 %	25 %	378973064
12702	NC_016842	GC	3	6	601183	601188	0 %	0 %	50 %	50 %	378973064
12703	NC_016842	GTT	2	6	601198	601203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973064
12704	NC_016842	CTT	2	6	601336	601341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973064
12705	NC_016842	TTGT	2	8	601439	601446	0 %	75 %	25 %	0 %	378973064
12706	NC_016842	ATC	2	6	601466	601471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973064
12707	NC_016842	GTT	2	6	601489	601494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973064
12708	NC_016842	AAAAT	2	10	601500	601509	80 %	20 %	0 %	0 %	378973064
12709	NC_016842	CATC	2	8	601513	601520	25 %	25 %	0 %	50 %	378973064
12710	NC_016842	T	7	7	601530	601536	0 %	100 %	0 %	0 %	378973064
12711	NC_016842	CTG	2	6	601604	601609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973064
12712	NC_016842	ACG	2	6	601632	601637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973064
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12714	NC_016842	TGC	2	6	601675	601680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973064
12715	NC_016842	A	7	7	601714	601720	100 %	0 %	0 %	0 %	378973064
12716	NC_016842	TGC	2	6	601732	601737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973065
12717	NC_016842	TTA	2	6	601750	601755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973065
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12719	NC_016842	CG	3	6	601912	601917	0 %	0 %	50 %	50 %	378973065
12720	NC_016842	TGCT	2	8	601933	601940	0 %	50 %	25 %	25 %	378973065
12721	NC_016842	CTGTA	2	10	602027	602036	20 %	40 %	20 %	20 %	378973065
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12723	NC_016842	TC	3	6	602096	602101	0 %	50 %	0 %	50 %	378973065
12724	NC_016842	CAA	2	6	602102	602107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973065
12725	NC_016842	T	7	7	602141	602147	0 %	100 %	0 %	0 %	378973065
12726	NC_016842	GTG	2	6	602166	602171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973065
12727	NC_016842	CTG	2	6	602209	602214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973065
12728	NC_016842	CGG	2	6	602251	602256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973065
12729	NC_016842	TCG	2	6	602266	602271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973065
12730	NC_016842	CCG	2	6	602278	602283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973065
12731	NC_016842	CGAGA	2	10	602343	602352	40 %	0 %	40 %	20 %	378973065
12732	NC_016842	CGCC	2	8	602392	602399	0 %	0 %	25 %	75 %	378973065
12733	NC_016842	CTTT	2	8	602415	602422	0 %	75 %	0 %	25 %	378973065
12734	NC_016842	ACG	2	6	602456	602461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12735	NC_016842	GCA	2	6	602544	602549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973066
12736	NC_016842	GCAAA	2	10	602604	602613	60 %	0 %	20 %	20 %	378973066
12737	NC_016842	AACA	2	8	602732	602739	75 %	0 %	0 %	25 %	378973066
12738	NC_016842	AG	3	6	602762	602767	50 %	0 %	50 %	0 %	378973066
12739	NC_016842	ACA	2	6	602781	602786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973066
12740	NC_016842	A	7	7	602805	602811	100 %	0 %	0 %	0 %	378973066
12741	NC_016842	TG	3	6	602840	602845	0 %	50 %	50 %	0 %	378973066
12742	NC_016842	GCAG	2	8	602882	602889	25 %	0 %	50 %	25 %	378973066
12743	NC_016842	TGC	2	6	602932	602937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973066
12744	NC_016842	CGC	2	6	602968	602973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973066
12745	NC_016842	CCACC	2	10	603019	603028	20 %	0 %	0 %	80 %	378973066
12746	NC_016842	ACA	2	6	603033	603038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973066
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12991	NC_016842	T	6	6	613890	613895	0 %	100 %	0 %	0 %	378973075
12992	NC_016842	CT	3	6	613933	613938	0 %	50 %	0 %	50 %	378973075
12993	NC_016842	T	6	6	613938	613943	0 %	100 %	0 %	0 %	378973075
12994	NC_016842	ACTG	2	8	614012	614019	25 %	25 %	25 %	25 %	378973075
12995	NC_016842	GCAC	2	8	614163	614170	25 %	0 %	25 %	50 %	378973075
12996	NC_016842	AC	3	6	614169	614174	50 %	0 %	0 %	50 %	378973075
12997	NC_016842	CGG	2	6	614188	614193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973075
12998	NC_016842	GC	4	8	614288	614295	0 %	0 %	50 %	50 %	378973075
12999	NC_016842	CTG	2	6	614332	614337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973075
13000	NC_016842	GC	3	6	614403	614408	0 %	0 %	50 %	50 %	378973075

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