MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_016842	GC	3	6	569717	569722	0 %	0 %	50 %	50 %	378973032
12005	NC_016842	TTG	2	6	569741	569746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973032
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12010	NC_016842	CTC	2	6	570013	570018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973032
12011	NC_016842	CAT	3	9	570030	570038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973032
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12013	NC_016842	TCA	2	6	570191	570196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973032
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12067	NC_016842	TGG	2	6	572324	572329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973033
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12091	NC_016842	GATAG	2	10	573535	573544	40 %	20 %	40 %	0 %	378973034
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12093	NC_016842	AGGC	2	8	573674	573681	25 %	0 %	50 %	25 %	378973034
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12099	NC_016842	CG	3	6	573910	573915	0 %	0 %	50 %	50 %	378973035
12100	NC_016842	GCA	2	6	573916	573921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973035
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12102	NC_016842	CGTA	2	8	573995	574002	25 %	25 %	25 %	25 %	378973035
12103	NC_016842	TACG	2	8	574010	574017	25 %	25 %	25 %	25 %	378973035
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12106	NC_016842	CA	3	6	574199	574204	50 %	0 %	0 %	50 %	378973035
12107	NC_016842	TCT	2	6	574222	574227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973035
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12110	NC_016842	TACT	2	8	574333	574340	25 %	50 %	0 %	25 %	378973035
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12113	NC_016842	CG	3	6	574408	574413	0 %	0 %	50 %	50 %	378973035
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12117	NC_016842	CA	3	6	574542	574547	50 %	0 %	0 %	50 %	378973035
12118	NC_016842	GC	3	6	574564	574569	0 %	0 %	50 %	50 %	378973035
12119	NC_016842	CTC	2	6	574614	574619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973035
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12123	NC_016842	AG	3	6	574816	574821	50 %	0 %	50 %	0 %	378973035
12124	NC_016842	AG	3	6	574857	574862	50 %	0 %	50 %	0 %	378973035
12125	NC_016842	ATA	2	6	574909	574914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973035
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12153	NC_016842	GC	3	6	576476	576481	0 %	0 %	50 %	50 %	378973037
12154	NC_016842	G	6	6	576520	576525	0 %	0 %	100 %	0 %	378973037
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12156	NC_016842	CCT	2	6	576555	576560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973037
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12229	NC_016842	A	6	6	579679	579684	100 %	0 %	0 %	0 %	378973040
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12233	NC_016842	GCC	2	6	579863	579868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973040
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12235	NC_016842	GGA	2	6	580036	580041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973041
12236	NC_016842	AGCACC	2	12	580104	580115	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378973041
12237	NC_016842	CCA	2	6	580134	580139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973041
12238	NC_016842	GCTT	2	8	580156	580163	0 %	50 %	25 %	25 %	378973041
12239	NC_016842	CTG	2	6	580164	580169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973041
12240	NC_016842	CGC	2	6	580170	580175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973041
12241	NC_016842	GTC	2	6	580191	580196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973041
12242	NC_016842	CAA	2	6	580209	580214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973041
12243	NC_016842	GAAA	2	8	580220	580227	75 %	0 %	25 %	0 %	378973041
12244	NC_016842	A	6	6	580236	580241	100 %	0 %	0 %	0 %	378973041
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12246	NC_016842	ACC	2	6	580372	580377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973041
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12374	NC_016842	GCA	2	6	586686	586691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973052
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12494	NC_016842	CGC	2	6	592678	592683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973056
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