MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 plasmid pTLIE01

Total Repeats: 624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016149	CTG	2	6	25393	25398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418845
502	NC_016149	CGC	2	6	25430	25435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418845
503	NC_016149	AGC	2	6	25436	25441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418845
504	NC_016149	TGC	2	6	25463	25468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418845
505	NC_016149	CTC	2	6	25490	25495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418845
506	NC_016149	CAAAAA	2	12	25526	25537	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	357418845
507	NC_016149	ATA	2	6	25607	25612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016149	A	6	6	25655	25660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016149	AAT	2	6	25703	25708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016149	TTC	2	6	25711	25716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016149	TTG	2	6	25753	25758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016149	A	7	7	25798	25804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016149	TAT	2	6	25894	25899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418846
514	NC_016149	GAT	2	6	25914	25919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418846
515	NC_016149	AGG	2	6	25959	25964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418846
516	NC_016149	TGA	2	6	25973	25978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418846
517	NC_016149	GTG	2	6	26026	26031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418846
518	NC_016149	CGG	2	6	26048	26053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418846
519	NC_016149	CAC	2	6	26064	26069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418846
520	NC_016149	TCCCT	2	10	26082	26091	0 %	40 %	0 %	60 %	357418846
521	NC_016149	CT	3	6	26162	26167	0 %	50 %	0 %	50 %	357418846
522	NC_016149	AGG	2	6	26185	26190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418846
523	NC_016149	TTG	2	6	26284	26289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418846
524	NC_016149	CCA	2	6	26317	26322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418846
525	NC_016149	AGG	2	6	26428	26433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418846
526	NC_016149	GTT	2	6	26436	26441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418846
527	NC_016149	TCG	2	6	26572	26577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418846
528	NC_016149	ATC	2	6	26616	26621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418846
529	NC_016149	GAT	2	6	26649	26654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418846
530	NC_016149	GGT	3	9	26655	26663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418846
531	NC_016149	GAA	2	6	26792	26797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418846
532	NC_016149	CTT	2	6	26826	26831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418846
533	NC_016149	GAA	2	6	26856	26861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418846
534	NC_016149	GAT	2	6	26910	26915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418846
535	NC_016149	GAT	2	6	27035	27040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418846
536	NC_016149	TCCATT	2	12	27064	27075	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	357418846
537	NC_016149	CTT	2	6	27115	27120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016149	T	6	6	27174	27179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016149	TGT	2	6	27304	27309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016149	TAA	2	6	27344	27349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016149	ATAC	2	8	27424	27431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_016149	T	6	6	27484	27489	0 %	100 %	0 %	0 %	357418847
543	NC_016149	TCG	2	6	27499	27504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418847
544	NC_016149	T	6	6	27561	27566	0 %	100 %	0 %	0 %	357418847
545	NC_016149	CCTTT	2	10	27595	27604	0 %	60 %	0 %	40 %	357418847
546	NC_016149	AAGC	2	8	27629	27636	50 %	0 %	25 %	25 %	357418847
547	NC_016149	ATA	2	6	27639	27644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418847
548	NC_016149	TGG	2	6	27664	27669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418847
549	NC_016149	AAG	2	6	27693	27698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418847
550	NC_016149	CT	3	6	27735	27740	0 %	50 %	0 %	50 %	357418847
551	NC_016149	CTA	2	6	27767	27772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418847
552	NC_016149	CCTTCC	2	12	27782	27793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418847
553	NC_016149	GGA	2	6	27819	27824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418847
554	NC_016149	CT	4	8	27849	27856	0 %	50 %	0 %	50 %	357418847
555	NC_016149	CTT	2	6	27882	27887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418847
556	NC_016149	A	6	6	27966	27971	100 %	0 %	0 %	0 %	357418847
557	NC_016149	TCAAAG	2	12	27985	27996	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	357418847
558	NC_016149	CAG	2	6	28093	28098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418847
559	NC_016149	TTA	2	6	28104	28109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418847
560	NC_016149	CAG	2	6	28218	28223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418847
561	NC_016149	TCC	2	6	28368	28373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418847
562	NC_016149	ACT	2	6	28449	28454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418847
563	NC_016149	T	6	6	28543	28548	0 %	100 %	0 %	0 %	357418848
564	NC_016149	CAC	2	6	28590	28595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418848
565	NC_016149	CAG	2	6	28613	28618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418848
566	NC_016149	ATG	2	6	28674	28679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418848
567	NC_016149	TAAACC	2	12	28701	28712	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	357418848
568	NC_016149	CTG	2	6	28724	28729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418848
569	NC_016149	AT	3	6	28734	28739	50 %	50 %	0 %	0 %	357418848
570	NC_016149	CTT	2	6	28786	28791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418848
571	NC_016149	T	6	6	28790	28795	0 %	100 %	0 %	0 %	357418848
572	NC_016149	TCG	2	6	28811	28816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418848
573	NC_016149	TTA	2	6	28863	28868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418848
574	NC_016149	CCG	2	6	28869	28874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418848
575	NC_016149	CCG	2	6	28897	28902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418848
576	NC_016149	GTTT	2	8	28965	28972	0 %	75 %	25 %	0 %	357418848
577	NC_016149	AGA	2	6	29039	29044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418848
578	NC_016149	AAT	2	6	29050	29055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418848
579	NC_016149	T	6	6	29171	29176	0 %	100 %	0 %	0 %	357418848
580	NC_016149	TTA	2	6	29193	29198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418848
581	NC_016149	GAG	2	6	29216	29221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418848
582	NC_016149	CCA	2	6	29292	29297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418848
583	NC_016149	ATC	2	6	29306	29311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418848
584	NC_016149	TCG	2	6	29312	29317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418848
585	NC_016149	CCA	2	6	29420	29425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418848
586	NC_016149	TCC	2	6	29462	29467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418848
587	NC_016149	T	6	6	29521	29526	0 %	100 %	0 %	0 %	357418848
588	NC_016149	GCC	2	6	29649	29654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418849
589	NC_016149	CAT	2	6	29681	29686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418849
590	NC_016149	TCCC	2	8	29728	29735	0 %	25 %	0 %	75 %	357418849
591	NC_016149	TACCTC	2	12	29902	29913	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	357418850
592	NC_016149	CTT	2	6	29931	29936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418850
593	NC_016149	GTA	2	6	29979	29984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418850
594	NC_016149	CAT	2	6	29991	29996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418850
595	NC_016149	ATC	2	6	30052	30057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418850
596	NC_016149	TCC	3	9	30073	30081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418850
597	NC_016149	AG	3	6	30159	30164	50 %	0 %	50 %	0 %	357418850
598	NC_016149	CCAA	2	8	30168	30175	50 %	0 %	0 %	50 %	357418850
599	NC_016149	GTC	2	6	30201	30206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418850
600	NC_016149	CCA	2	6	30251	30256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418850
601	NC_016149	TCC	2	6	30378	30383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418850
602	NC_016149	CTT	2	6	30453	30458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418850
603	NC_016149	CT	4	8	30537	30544	0 %	50 %	0 %	50 %	357418850
604	NC_016149	GTA	2	6	30561	30566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418850
605	NC_016149	GGGC	2	8	30597	30604	0 %	0 %	75 %	25 %	357418850
606	NC_016149	GCC	3	9	30655	30663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418850
607	NC_016149	TCG	2	6	30700	30705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418850
608	NC_016149	GGT	2	6	30710	30715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418850
609	NC_016149	CTTC	2	8	30800	30807	0 %	50 %	0 %	50 %	357418850
610	NC_016149	GGCA	2	8	30845	30852	25 %	0 %	50 %	25 %	357418850
611	NC_016149	CCGTA	2	10	30989	30998	20 %	20 %	20 %	40 %	357418850
612	NC_016149	GCC	2	6	31008	31013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418850
613	NC_016149	TGC	2	6	31136	31141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418850
614	NC_016149	CAG	2	6	31196	31201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418850
615	NC_016149	GCCG	2	8	31221	31228	0 %	0 %	50 %	50 %	357418850
616	NC_016149	GTC	2	6	31341	31346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418850
617	NC_016149	AT	3	6	31357	31362	50 %	50 %	0 %	0 %	357418850
618	NC_016149	TCC	2	6	31620	31625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418850
619	NC_016149	TCT	2	6	31673	31678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418850
620	NC_016149	AAC	2	6	31696	31701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418850
621	NC_016149	TCC	2	6	31728	31733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_016149	TCAA	2	8	31736	31743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_016149	TTC	2	6	31751	31756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_016149	TAA	2	6	31825	31830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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