MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 38427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016148	GT	3	6	123061	123066	0 %	50 %	50 %	0 %	357418964
2502	NC_016148	GAA	2	6	123068	123073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418964
2503	NC_016148	CCA	2	6	123079	123084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418964
2504	NC_016148	AGG	2	6	123098	123103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418964
2505	NC_016148	ACC	2	6	123183	123188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418964
2506	NC_016148	TGCC	2	8	123274	123281	0 %	25 %	25 %	50 %	357418964
2507	NC_016148	AGG	2	6	123392	123397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418964
2508	NC_016148	CAGC	2	8	123470	123477	25 %	0 %	25 %	50 %	357418964
2509	NC_016148	GGT	2	6	123503	123508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418964
2510	NC_016148	GGC	2	6	123527	123532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418964
2511	NC_016148	GAT	2	6	123582	123587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418964
2512	NC_016148	ATA	2	6	123630	123635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418964
2513	NC_016148	AGG	2	6	123694	123699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418964
2514	NC_016148	GAGCGC	2	12	123732	123743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357418965
2515	NC_016148	AAG	2	6	123799	123804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418965
2516	NC_016148	TCT	2	6	123940	123945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418965
2517	NC_016148	GGA	2	6	123993	123998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418965
2518	NC_016148	AGG	2	6	124087	124092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418966
2519	NC_016148	CAA	2	6	124112	124117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418966
2520	NC_016148	TCT	2	6	124136	124141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418966
2521	NC_016148	GCTG	2	8	124175	124182	0 %	25 %	50 %	25 %	357418966
2522	NC_016148	AT	3	6	124249	124254	50 %	50 %	0 %	0 %	357418966
2523	NC_016148	CTG	2	6	124300	124305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418966
2524	NC_016148	GGA	2	6	124364	124369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418966
2525	NC_016148	TTC	2	6	124619	124624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418967
2526	NC_016148	TC	3	6	124623	124628	0 %	50 %	0 %	50 %	357418967
2527	NC_016148	GCA	2	6	124809	124814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418967
2528	NC_016148	AGCCC	2	10	124875	124884	20 %	0 %	20 %	60 %	357418967
2529	NC_016148	TGG	2	6	124899	124904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418967
2530	NC_016148	CTT	2	6	124968	124973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418967
2531	NC_016148	AG	4	8	125099	125106	50 %	0 %	50 %	0 %	357418968
2532	NC_016148	TGGA	2	8	125207	125214	25 %	25 %	50 %	0 %	357418968
2533	NC_016148	CCA	2	6	125293	125298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418968
2534	NC_016148	GATG	2	8	125395	125402	25 %	25 %	50 %	0 %	357418968
2535	NC_016148	CA	3	6	125434	125439	50 %	0 %	0 %	50 %	357418968
2536	NC_016148	CTC	2	6	125474	125479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418968
2537	NC_016148	CT	3	6	125518	125523	0 %	50 %	0 %	50 %	357418968
2538	NC_016148	CCA	2	6	125527	125532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418968
2539	NC_016148	GA	3	6	125536	125541	50 %	0 %	50 %	0 %	357418968
2540	NC_016148	TTTC	2	8	125578	125585	0 %	75 %	0 %	25 %	357418968
2541	NC_016148	T	6	6	125603	125608	0 %	100 %	0 %	0 %	357418968
2542	NC_016148	ACT	2	6	125629	125634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418969
2543	NC_016148	AT	3	6	125680	125685	50 %	50 %	0 %	0 %	357418969
2544	NC_016148	CGG	2	6	125704	125709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418969
2545	NC_016148	CCG	2	6	125731	125736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418969
2546	NC_016148	T	7	7	125766	125772	0 %	100 %	0 %	0 %	357418969
2547	NC_016148	CTT	2	6	125773	125778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418969
2548	NC_016148	TCC	2	6	125935	125940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418969
2549	NC_016148	TAT	2	6	125954	125959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418969
2550	NC_016148	TGT	2	6	125964	125969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418969
2551	NC_016148	ATCTA	2	10	126050	126059	40 %	40 %	0 %	20 %	357418969
2552	NC_016148	GAA	2	6	126139	126144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418969
2553	NC_016148	TCA	2	6	126148	126153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418969
2554	NC_016148	GCC	2	6	126164	126169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418969
2555	NC_016148	T	6	6	126230	126235	0 %	100 %	0 %	0 %	357418969
2556	NC_016148	CTT	2	6	126291	126296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418969
2557	NC_016148	TGG	2	6	126397	126402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418969
2558	NC_016148	CTC	2	6	126409	126414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418969
2559	NC_016148	CCAT	2	8	126489	126496	25 %	25 %	0 %	50 %	357418969
2560	NC_016148	CAC	2	6	126521	126526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418969
2561	NC_016148	T	6	6	126539	126544	0 %	100 %	0 %	0 %	357418969
2562	NC_016148	CTA	2	6	126583	126588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418969
2563	NC_016148	GGA	2	6	126605	126610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418969
2564	NC_016148	TCC	2	6	126618	126623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418969
2565	NC_016148	GTC	2	6	126647	126652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418969
2566	NC_016148	TCC	2	6	126690	126695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_016148	CAA	2	6	126800	126805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418970
2568	NC_016148	AGG	2	6	126919	126924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418970
2569	NC_016148	TCT	2	6	126930	126935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418970
2570	NC_016148	T	6	6	126954	126959	0 %	100 %	0 %	0 %	357418970
2571	NC_016148	A	6	6	126960	126965	100 %	0 %	0 %	0 %	357418970
2572	NC_016148	TCT	2	6	126987	126992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418970
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2574	NC_016148	TCT	2	6	127029	127034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418970
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2577	NC_016148	AGG	2	6	127111	127116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418970
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2579	NC_016148	TCT	3	9	127128	127136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418970
2580	NC_016148	CTT	2	6	127174	127179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418970
2581	NC_016148	GAA	2	6	127202	127207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418970
2582	NC_016148	TTC	2	6	127250	127255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418970
2583	NC_016148	GAGC	2	8	127286	127293	25 %	0 %	50 %	25 %	357418970
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2586	NC_016148	CCTT	2	8	127409	127416	0 %	50 %	0 %	50 %	357418970
2587	NC_016148	TTG	2	6	127427	127432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418970
2588	NC_016148	ATG	2	6	127458	127463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418970
2589	NC_016148	C	6	6	127564	127569	0 %	0 %	0 %	100 %	357418970
2590	NC_016148	CAA	2	6	127588	127593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418970
2591	NC_016148	A	6	6	127608	127613	100 %	0 %	0 %	0 %	357418970
2592	NC_016148	GA	3	6	127710	127715	50 %	0 %	50 %	0 %	357418971
2593	NC_016148	CTC	2	6	127736	127741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418971
2594	NC_016148	TTC	2	6	127757	127762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418971
2595	NC_016148	GA	3	6	127773	127778	50 %	0 %	50 %	0 %	357418971
2596	NC_016148	TTC	2	6	127790	127795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418971
2597	NC_016148	CCT	2	6	127831	127836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418971
2598	NC_016148	CTC	2	6	127862	127867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418971
2599	NC_016148	CTT	3	9	127891	127899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418971
2600	NC_016148	CTT	2	6	127917	127922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418971
2601	NC_016148	CTG	2	6	128051	128056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418971
2602	NC_016148	GGA	2	6	128066	128071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418971
2603	NC_016148	GCGG	2	8	128135	128142	0 %	0 %	75 %	25 %	357418971
2604	NC_016148	AAG	2	6	128165	128170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418971
2605	NC_016148	TGGTC	2	10	128173	128182	0 %	40 %	40 %	20 %	357418971
2606	NC_016148	GGA	2	6	128189	128194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418971
2607	NC_016148	TAT	2	6	128213	128218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418971
2608	NC_016148	CT	3	6	128229	128234	0 %	50 %	0 %	50 %	357418971
2609	NC_016148	GCT	2	6	128341	128346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418971
2610	NC_016148	TTG	2	6	128417	128422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418971
2611	NC_016148	CTG	2	6	128524	128529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418971
2612	NC_016148	CTC	2	6	128555	128560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418971
2613	NC_016148	ATC	2	6	128583	128588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418971
2614	NC_016148	TTC	2	6	128598	128603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418971
2615	NC_016148	AGG	2	6	128628	128633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418971
2616	NC_016148	TTG	2	6	128655	128660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418971
2617	NC_016148	TGC	2	6	128762	128767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418971
2618	NC_016148	AGG	2	6	128781	128786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418971
2619	NC_016148	AGG	2	6	128808	128813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418971
2620	NC_016148	TAA	2	6	128830	128835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418971
2621	NC_016148	AGGA	2	8	128934	128941	50 %	0 %	50 %	0 %	357418971
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2993	NC_016148	CTC	3	9	146929	146937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418990
2994	NC_016148	CT	4	8	146945	146952	0 %	50 %	0 %	50 %	357418990
2995	NC_016148	GAA	2	6	146991	146996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418990
2996	NC_016148	GGGA	2	8	147007	147014	25 %	0 %	75 %	0 %	357418990
2997	NC_016148	TCG	2	6	147077	147082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418990
2998	NC_016148	GAA	2	6	147151	147156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418990
2999	NC_016148	CA	3	6	147181	147186	50 %	0 %	0 %	50 %	357418990
3000	NC_016148	CTA	2	6	147258	147263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418990

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