MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 38427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016148	AATG	2	8	46390	46397	50 %	25 %	25 %	0 %	357418894
1002	NC_016148	AGA	2	6	46443	46448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418895
1003	NC_016148	T	6	6	46534	46539	0 %	100 %	0 %	0 %	357418895
1004	NC_016148	CAA	2	6	46543	46548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418895
1005	NC_016148	GGA	2	6	46631	46636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418895
1006	NC_016148	TGG	2	6	46708	46713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418895
1007	NC_016148	C	6	6	46835	46840	0 %	0 %	0 %	100 %	357418895
1008	NC_016148	A	6	6	46884	46889	100 %	0 %	0 %	0 %	357418895
1009	NC_016148	GA	3	6	46913	46918	50 %	0 %	50 %	0 %	357418895
1010	NC_016148	GAG	2	6	46941	46946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418895
1011	NC_016148	GGT	2	6	47003	47008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418895
1012	NC_016148	GGT	2	6	47061	47066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016148	TTG	3	9	47216	47224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418896
1014	NC_016148	GAT	2	6	47269	47274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1015	NC_016148	GT	3	6	47279	47284	0 %	50 %	50 %	0 %	357418896
1016	NC_016148	ATGTA	2	10	47291	47300	40 %	40 %	20 %	0 %	357418896
1017	NC_016148	AGC	2	6	47380	47385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418896
1018	NC_016148	TTGG	2	8	47405	47412	0 %	50 %	50 %	0 %	357418896
1019	NC_016148	A	7	7	47427	47433	100 %	0 %	0 %	0 %	357418896
1020	NC_016148	AG	3	6	47484	47489	50 %	0 %	50 %	0 %	357418896
1021	NC_016148	AAAG	2	8	47526	47533	75 %	0 %	25 %	0 %	357418896
1022	NC_016148	AGC	2	6	47545	47550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418896
1023	NC_016148	AAGAG	2	10	47571	47580	60 %	0 %	40 %	0 %	357418896
1024	NC_016148	G	7	7	47590	47596	0 %	0 %	100 %	0 %	357418896
1025	NC_016148	CTT	2	6	47665	47670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418896
1026	NC_016148	GAT	2	6	47707	47712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1027	NC_016148	TTA	2	6	47772	47777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418896
1028	NC_016148	CAA	2	6	47799	47804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418896
1029	NC_016148	TTAA	2	8	47869	47876	50 %	50 %	0 %	0 %	357418896
1030	NC_016148	GGT	2	6	47973	47978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418896
1031	NC_016148	TAT	2	6	48100	48105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418896
1032	NC_016148	GAT	2	6	48190	48195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1033	NC_016148	CGG	2	6	48338	48343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418896
1034	NC_016148	T	6	6	48349	48354	0 %	100 %	0 %	0 %	357418896
1035	NC_016148	GTG	2	6	48378	48383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418896
1036	NC_016148	AGA	2	6	48386	48391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418896
1037	NC_016148	ACG	2	6	48464	48469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418896
1038	NC_016148	AGA	2	6	48476	48481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418896
1039	NC_016148	T	6	6	48496	48501	0 %	100 %	0 %	0 %	357418896
1040	NC_016148	GAA	2	6	48503	48508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418896
1041	NC_016148	GAA	2	6	48574	48579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418896
1042	NC_016148	GAT	2	6	48637	48642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1043	NC_016148	TGA	2	6	48648	48653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1044	NC_016148	CAA	2	6	48677	48682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418896
1045	NC_016148	AGC	2	6	48699	48704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418896
1046	NC_016148	CAGA	2	8	48730	48737	50 %	0 %	25 %	25 %	357418896
1047	NC_016148	G	6	6	48747	48752	0 %	0 %	100 %	0 %	357418896
1048	NC_016148	CTC	2	6	48755	48760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418896
1049	NC_016148	G	6	6	48786	48791	0 %	0 %	100 %	0 %	357418896
1050	NC_016148	GCA	2	6	48904	48909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418896
1051	NC_016148	GAG	2	6	48910	48915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418896
1052	NC_016148	AGA	2	6	48930	48935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418896
1053	NC_016148	TAG	2	6	48939	48944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1054	NC_016148	GTA	2	6	48946	48951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1055	NC_016148	C	6	6	49028	49033	0 %	0 %	0 %	100 %	357418896
1056	NC_016148	TGA	2	6	49053	49058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1057	NC_016148	G	6	6	49136	49141	0 %	0 %	100 %	0 %	357418896
1058	NC_016148	TA	3	6	49157	49162	50 %	50 %	0 %	0 %	357418896
1059	NC_016148	TCC	2	6	49209	49214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418896
1060	NC_016148	CTA	2	6	49232	49237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418896
1061	NC_016148	TAT	2	6	49240	49245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418896
1062	NC_016148	GAA	2	6	49336	49341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418896
1063	NC_016148	TTG	2	6	49384	49389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418896
1064	NC_016148	GCT	2	6	49425	49430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418896
1065	NC_016148	TGGA	2	8	49463	49470	25 %	25 %	50 %	0 %	357418896
1066	NC_016148	GGA	2	6	49500	49505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418896
1067	NC_016148	GAATG	2	10	49551	49560	40 %	20 %	40 %	0 %	357418896
1068	NC_016148	CGAA	2	8	49583	49590	50 %	0 %	25 %	25 %	357418896
1069	NC_016148	TC	3	6	49625	49630	0 %	50 %	0 %	50 %	357418896
1070	NC_016148	TGC	2	6	49646	49651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418896
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1072	NC_016148	CCA	2	6	49725	49730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418896
1073	NC_016148	A	6	6	49762	49767	100 %	0 %	0 %	0 %	357418896
1074	NC_016148	CTC	2	6	49787	49792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418896
1075	NC_016148	A	6	6	49951	49956	100 %	0 %	0 %	0 %	357418896
1076	NC_016148	GTT	2	6	50029	50034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418896
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1078	NC_016148	GCA	2	6	50047	50052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418896
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1081	NC_016148	GAT	2	6	50281	50286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418896
1082	NC_016148	AG	3	6	50385	50390	50 %	0 %	50 %	0 %	357418896
1083	NC_016148	AT	4	8	50482	50489	50 %	50 %	0 %	0 %	357418896
1084	NC_016148	AAC	2	6	50524	50529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418896
1085	NC_016148	GGA	2	6	50619	50624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418896
1086	NC_016148	TCT	2	6	50670	50675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418896
1087	NC_016148	CT	3	6	50674	50679	0 %	50 %	0 %	50 %	357418896
1088	NC_016148	AGA	2	6	50712	50717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418896
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1090	NC_016148	CTTCT	2	10	50740	50749	0 %	60 %	0 %	40 %	357418896
1091	NC_016148	AGGTAA	2	12	50761	50772	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	357418896
1092	NC_016148	TGA	2	6	50775	50780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418897
1093	NC_016148	AAAT	3	12	50781	50792	75 %	25 %	0 %	0 %	357418897
1094	NC_016148	AGT	2	6	50812	50817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418897
1095	NC_016148	GTT	2	6	50819	50824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418897
1096	NC_016148	TTA	2	6	50841	50846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418897
1097	NC_016148	AGT	2	6	50911	50916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418897
1098	NC_016148	ATA	2	6	50957	50962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418897
1099	NC_016148	CCG	2	6	50984	50989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418897
1100	NC_016148	GAAA	2	8	51006	51013	75 %	0 %	25 %	0 %	357418897
1101	NC_016148	AAG	2	6	51059	51064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418897
1102	NC_016148	CAG	2	6	51153	51158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418897
1103	NC_016148	GAC	2	6	51174	51179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_016148	TAT	2	6	51196	51201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016148	TAA	2	6	51217	51222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016148	TTTA	2	8	51246	51253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016148	AG	3	6	51270	51275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016148	A	6	6	51301	51306	100 %	0 %	0 %	0 %	357418898
1109	NC_016148	AAG	2	6	51310	51315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418898
1110	NC_016148	AACA	2	8	51321	51328	75 %	0 %	0 %	25 %	357418898
1111	NC_016148	GAG	2	6	51336	51341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418898
1112	NC_016148	TATC	2	8	51360	51367	25 %	50 %	0 %	25 %	357418898
1113	NC_016148	GAT	2	6	51416	51421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418898
1114	NC_016148	CAG	2	6	51510	51515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418898
1115	NC_016148	CCG	2	6	51516	51521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418898
1116	NC_016148	GAG	2	6	51615	51620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418898
1117	NC_016148	TCC	2	6	51646	51651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418898
1118	NC_016148	GGA	2	6	51674	51679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418898
1119	NC_016148	ATA	2	6	51699	51704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418898
1120	NC_016148	AGT	2	6	51818	51823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016148	AGG	2	6	51845	51850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016148	TGG	2	6	51920	51925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418899
1123	NC_016148	TGT	2	6	51942	51947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418899
1124	NC_016148	GA	3	6	52051	52056	50 %	0 %	50 %	0 %	357418899
1125	NC_016148	GGA	2	6	52073	52078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418899
1126	NC_016148	AAG	2	6	52128	52133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418899
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1128	NC_016148	AGG	2	6	52247	52252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1133	NC_016148	AAG	2	6	52456	52461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1241	NC_016148	TGTA	2	8	58238	58245	25 %	50 %	25 %	0 %	357418906
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1257	NC_016148	TCC	2	6	59315	59320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418907
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1262	NC_016148	AAGGC	2	10	59807	59816	40 %	0 %	40 %	20 %	357418907
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1266	NC_016148	GTA	2	6	59947	59952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418907
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1272	NC_016148	TGTCTA	2	12	60183	60194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	357418907
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1373	NC_016148	TC	3	6	65252	65257	0 %	50 %	0 %	50 %	357418912
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