MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus tenax Kra 1

Total Repeats: 41444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016070	AGA	2	6	132072	132077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681372
3003	NC_016070	GGC	2	6	132112	132117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681372
3004	NC_016070	GCC	2	6	132145	132150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681372
3005	NC_016070	ACT	2	6	132158	132163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681372
3006	NC_016070	TGC	2	6	132167	132172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681372
3007	NC_016070	TGT	2	6	132191	132196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352681372
3008	NC_016070	GCG	2	6	132203	132208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681372
3009	NC_016070	CCTC	2	8	132221	132228	0 %	25 %	0 %	75 %	352681372
3010	NC_016070	AAGG	2	8	132247	132254	50 %	0 %	50 %	0 %	352681372
3011	NC_016070	CGG	2	6	132297	132302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681372
3012	NC_016070	AGG	2	6	132476	132481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681372
3013	NC_016070	AGG	2	6	132485	132490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681372
3014	NC_016070	TTC	2	6	132496	132501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681372
3015	NC_016070	GGA	2	6	132636	132641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681372
3016	NC_016070	AG	3	6	132670	132675	50 %	0 %	50 %	0 %	352681372
3017	NC_016070	CCT	2	6	132839	132844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681373
3018	NC_016070	TC	3	6	132871	132876	0 %	50 %	0 %	50 %	352681373
3019	NC_016070	GGC	2	6	132947	132952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681373
3020	NC_016070	CGT	2	6	132958	132963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681373
3021	NC_016070	TTC	2	6	132972	132977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681373
3022	NC_016070	CCG	2	6	132985	132990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681373
3023	NC_016070	GCT	2	6	133011	133016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681373
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3025	NC_016070	GCC	2	6	133101	133106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681373
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3029	NC_016070	CT	3	6	133301	133306	0 %	50 %	0 %	50 %	352681373
3030	NC_016070	AAT	2	6	133394	133399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681373
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3033	NC_016070	GGA	2	6	133516	133521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681373
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3039	NC_016070	TAC	2	6	133887	133892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681373
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3041	NC_016070	CGCTG	2	10	133934	133943	0 %	20 %	40 %	40 %	352681373
3042	NC_016070	TCA	2	6	133984	133989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681373
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3047	NC_016070	TCTA	2	8	134165	134172	25 %	50 %	0 %	25 %	352681373
3048	NC_016070	AG	3	6	134181	134186	50 %	0 %	50 %	0 %	352681373
3049	NC_016070	AGG	2	6	134243	134248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016070	TCG	2	6	134356	134361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681374
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3052	NC_016070	GGC	2	6	134454	134459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681374
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3054	NC_016070	GA	3	6	134823	134828	50 %	0 %	50 %	0 %	352681374
3055	NC_016070	TA	3	6	134832	134837	50 %	50 %	0 %	0 %	352681374
3056	NC_016070	TA	3	6	134846	134851	50 %	50 %	0 %	0 %	352681374
3057	NC_016070	AG	3	6	134862	134867	50 %	0 %	50 %	0 %	352681374
3058	NC_016070	GAG	3	9	134871	134879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681374
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3070	NC_016070	TA	3	6	135253	135258	50 %	50 %	0 %	0 %	352681374
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3074	NC_016070	AGTG	2	8	135486	135493	25 %	25 %	50 %	0 %	352681375
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3082	NC_016070	CCCTT	2	10	135734	135743	0 %	40 %	0 %	60 %	352681375
3083	NC_016070	CGG	2	6	135861	135866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681375
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3085	NC_016070	ACA	2	6	135881	135886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681375
3086	NC_016070	GTC	2	6	135900	135905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681375
3087	NC_016070	CGG	2	6	136004	136009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681375
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3089	NC_016070	GGCG	2	8	136095	136102	0 %	0 %	75 %	25 %	352681375
3090	NC_016070	CTAT	2	8	136110	136117	25 %	50 %	0 %	25 %	352681375
3091	NC_016070	ACTG	2	8	136302	136309	25 %	25 %	25 %	25 %	352681375
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3093	NC_016070	GGCC	2	8	136361	136368	0 %	0 %	50 %	50 %	352681375
3094	NC_016070	GCC	2	6	136377	136382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681375
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3103	NC_016070	GATA	2	8	136964	136971	50 %	25 %	25 %	0 %	352681376
3104	NC_016070	TATT	2	8	137007	137014	25 %	75 %	0 %	0 %	352681376
3105	NC_016070	GGC	2	6	137024	137029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681376
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3108	NC_016070	ATA	2	6	137243	137248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681376
3109	NC_016070	CGT	2	6	137296	137301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681376
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3122	NC_016070	GGC	2	6	138269	138274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681377
3123	NC_016070	CTC	2	6	138297	138302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681377
3124	NC_016070	CCT	2	6	138346	138351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681377
3125	NC_016070	CGG	2	6	138412	138417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681377
3126	NC_016070	TAC	2	6	138435	138440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681377
3127	NC_016070	TAC	2	6	138465	138470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681377
3128	NC_016070	C	6	6	138541	138546	0 %	0 %	0 %	100 %	352681377
3129	NC_016070	CGGC	2	8	138556	138563	0 %	0 %	50 %	50 %	352681377
3130	NC_016070	ATTCA	2	10	138565	138574	40 %	40 %	0 %	20 %	352681377
3131	NC_016070	CTC	2	6	138657	138662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681377
3132	NC_016070	GCG	2	6	138703	138708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681377
3133	NC_016070	CT	3	6	138722	138727	0 %	50 %	0 %	50 %	352681377
3134	NC_016070	TAT	2	6	138750	138755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352681377
3135	NC_016070	C	6	6	138766	138771	0 %	0 %	0 %	100 %	352681377
3136	NC_016070	CCCT	2	8	138897	138904	0 %	25 %	0 %	75 %	352681377
3137	NC_016070	CGG	2	6	138953	138958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681377
3138	NC_016070	CGC	2	6	139036	139041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681377
3139	NC_016070	GCC	2	6	139086	139091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681377
3140	NC_016070	G	6	6	139102	139107	0 %	0 %	100 %	0 %	352681377
3141	NC_016070	AGTC	2	8	139217	139224	25 %	25 %	25 %	25 %	352681377
3142	NC_016070	GCC	2	6	139243	139248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681377
3143	NC_016070	CG	3	6	139261	139266	0 %	0 %	50 %	50 %	352681377
3144	NC_016070	CGA	2	6	139291	139296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681377
3145	NC_016070	G	6	6	139304	139309	0 %	0 %	100 %	0 %	352681377
3146	NC_016070	CTCGG	2	10	139413	139422	0 %	20 %	40 %	40 %	352681377
3147	NC_016070	CT	3	6	139504	139509	0 %	50 %	0 %	50 %	352681377
3148	NC_016070	GGC	2	6	139521	139526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681377
3149	NC_016070	CGT	2	6	139562	139567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681377
3150	NC_016070	AGGG	2	8	139586	139593	25 %	0 %	75 %	0 %	352681377
3151	NC_016070	CGA	2	6	139595	139600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681377
3152	NC_016070	TTG	2	6	139602	139607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352681377
3153	NC_016070	CGT	2	6	139709	139714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681377
3154	NC_016070	GC	3	6	139726	139731	0 %	0 %	50 %	50 %	352681377
3155	NC_016070	TC	3	6	139752	139757	0 %	50 %	0 %	50 %	352681377
3156	NC_016070	TATC	2	8	139758	139765	25 %	50 %	0 %	25 %	352681377
3157	NC_016070	CTC	2	6	139779	139784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681377
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3160	NC_016070	TTA	2	6	139817	139822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352681377
3161	NC_016070	GGA	2	6	139884	139889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681378
3162	NC_016070	TGT	3	9	139949	139957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352681378
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3164	NC_016070	GAG	2	6	140023	140028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681378
3165	NC_016070	AAG	2	6	140032	140037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681378
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3167	NC_016070	ATA	2	6	140299	140304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681378
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3170	NC_016070	AAG	2	6	140470	140475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681378
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3172	NC_016070	TC	4	8	140500	140507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3173	NC_016070	AGTT	2	8	140550	140557	25 %	50 %	25 %	0 %	352681379
3174	NC_016070	GAAA	2	8	140647	140654	75 %	0 %	25 %	0 %	352681379
3175	NC_016070	CT	3	6	140745	140750	0 %	50 %	0 %	50 %	352681379
3176	NC_016070	TCC	2	6	140780	140785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681379
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3179	NC_016070	GAG	2	6	140908	140913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681379
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3181	NC_016070	ATA	2	6	141016	141021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681379
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3183	NC_016070	AAT	2	6	141069	141074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681379
3184	NC_016070	CGT	2	6	141081	141086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681379
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3194	NC_016070	TAA	2	6	141446	141451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681379
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3198	NC_016070	GATA	2	8	141501	141508	50 %	25 %	25 %	0 %	352681380
3199	NC_016070	TCG	2	6	141539	141544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681380
3200	NC_016070	GAC	2	6	141568	141573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681380
3201	NC_016070	G	6	6	141639	141644	0 %	0 %	100 %	0 %	352681380
3202	NC_016070	CGT	2	6	141705	141710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681380
3203	NC_016070	CCGA	2	8	141713	141720	25 %	0 %	25 %	50 %	352681380
3204	NC_016070	GAT	2	6	141832	141837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681380
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3209	NC_016070	TCG	2	6	142104	142109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3210	NC_016070	TCG	2	6	142179	142184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681381
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3217	NC_016070	TAG	2	6	142531	142536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681382
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3219	NC_016070	G	6	6	142578	142583	0 %	0 %	100 %	0 %	352681382
3220	NC_016070	GGCC	2	8	142639	142646	0 %	0 %	50 %	50 %	352681382
3221	NC_016070	GCC	3	9	142680	142688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681382
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3223	NC_016070	AT	3	6	142816	142821	50 %	50 %	0 %	0 %	352681382
3224	NC_016070	ACAA	2	8	142836	142843	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3225	NC_016070	GCCCC	2	10	142847	142856	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3226	NC_016070	GGTG	2	8	142860	142867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3227	NC_016070	AGG	2	6	142914	142919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681383
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3230	NC_016070	CGG	2	6	143031	143036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681383
3231	NC_016070	GAG	2	6	143086	143091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681383
3232	NC_016070	GAG	2	6	143135	143140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_016070	GGA	2	6	143196	143201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_016070	CGT	2	6	143210	143215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3235	NC_016070	GAG	2	6	143271	143276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_016070	GCG	2	6	143299	143304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3237	NC_016070	GCC	2	6	143305	143310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3238	NC_016070	TC	3	6	143354	143359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3239	NC_016070	GAG	3	9	143450	143458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681384
3240	NC_016070	AGG	2	6	143478	143483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681384
3241	NC_016070	CCG	2	6	143503	143508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681384
3242	NC_016070	GGC	3	9	143510	143518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681384
3243	NC_016070	GTT	2	6	143554	143559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352681385
3244	NC_016070	AG	3	6	143570	143575	50 %	0 %	50 %	0 %	352681385
3245	NC_016070	AGTC	2	8	143580	143587	25 %	25 %	25 %	25 %	352681385
3246	NC_016070	CAC	2	6	143606	143611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681385
3247	NC_016070	GA	3	6	143663	143668	50 %	0 %	50 %	0 %	352681385
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3254	NC_016070	GCG	2	6	143834	143839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_016070	GCG	2	6	143936	143941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3372	NC_016070	CGG	2	6	149378	149383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681389
3373	NC_016070	CAT	2	6	149403	149408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681389
3374	NC_016070	ATC	2	6	149425	149430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681389
3375	NC_016070	ATA	2	6	149443	149448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681389
3376	NC_016070	TGG	2	6	149467	149472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681389
3377	NC_016070	AG	4	8	149645	149652	50 %	0 %	50 %	0 %	352681390
3378	NC_016070	TTC	2	6	149731	149736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681390
3379	NC_016070	TGG	2	6	149744	149749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681390
3380	NC_016070	C	6	6	149779	149784	0 %	0 %	0 %	100 %	352681390
3381	NC_016070	CAA	2	6	149868	149873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681390
3382	NC_016070	ACTTCA	2	12	149903	149914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681390
3383	NC_016070	CGGG	2	8	149915	149922	0 %	0 %	75 %	25 %	352681390
3384	NC_016070	ATT	2	6	149947	149952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352681390
3385	NC_016070	ACT	2	6	149972	149977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681390
3386	NC_016070	CAG	2	6	150166	150171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681390
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3389	NC_016070	CTT	2	6	150222	150227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681390
3390	NC_016070	ATA	2	6	150242	150247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681390
3391	NC_016070	AT	4	8	150287	150294	50 %	50 %	0 %	0 %	352681390
3392	NC_016070	TAA	2	6	150314	150319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681390
3393	NC_016070	AT	3	6	150329	150334	50 %	50 %	0 %	0 %	352681390
3394	NC_016070	CCT	2	6	150405	150410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681390
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3396	NC_016070	CCT	2	6	150441	150446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681390
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3401	NC_016070	GTG	2	6	150619	150624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681390
3402	NC_016070	CGC	2	6	150630	150635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681390
3403	NC_016070	GGC	2	6	150646	150651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681390
3404	NC_016070	GGC	2	6	150717	150722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681390
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3421	NC_016070	TCTGGC	2	12	151673	151684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681391
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3424	NC_016070	GATC	2	8	151862	151869	25 %	25 %	25 %	25 %	352681391
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3443	NC_016070	TGG	2	6	152789	152794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681392
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3452	NC_016070	GCG	2	6	153143	153148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681393
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3462	NC_016070	CGC	2	6	153711	153716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3464	NC_016070	GA	3	6	153765	153770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3465	NC_016070	TCT	2	6	153811	153816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3473	NC_016070	ACGCA	2	10	154202	154211	40 %	0 %	20 %	40 %	352681395
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3475	NC_016070	TGG	2	6	154247	154252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681395
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3477	NC_016070	ACG	2	6	154573	154578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681395
3478	NC_016070	AGA	2	6	154592	154597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681395
3479	NC_016070	ATT	2	6	154759	154764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3480	NC_016070	CCA	2	6	154983	154988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681396
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3482	NC_016070	TCT	2	6	155069	155074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681396
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3484	NC_016070	CA	3	6	155170	155175	50 %	0 %	0 %	50 %	352681396
3485	NC_016070	AG	3	6	155254	155259	50 %	0 %	50 %	0 %	352681396
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3487	NC_016070	AG	3	6	155310	155315	50 %	0 %	50 %	0 %	352681396
3488	NC_016070	AT	3	6	155338	155343	50 %	50 %	0 %	0 %	352681396
3489	NC_016070	AAG	2	6	155344	155349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681396
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3491	NC_016070	GGA	2	6	155456	155461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681396
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3493	NC_016070	CGA	2	6	155688	155693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681396
3494	NC_016070	GAGG	2	8	155772	155779	25 %	0 %	75 %	0 %	352681396
3495	NC_016070	CTA	2	6	155802	155807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681396
3496	NC_016070	AG	3	6	155849	155854	50 %	0 %	50 %	0 %	352681396
3497	NC_016070	GGT	2	6	155871	155876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681396
3498	NC_016070	AGG	2	6	155884	155889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681396
3499	NC_016070	AC	3	6	155891	155896	50 %	0 %	0 %	50 %	352681396
3500	NC_016070	GAG	2	6	155929	155934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681396

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