MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus tenax Kra 1

Total Repeats: 41444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016070	TCCTC	2	10	244804	244813	0 %	40 %	0 %	60 %	352681492
5502	NC_016070	CGA	2	6	244817	244822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681492
5503	NC_016070	CTT	2	6	244832	244837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681492
5504	NC_016070	CAA	2	6	244880	244885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681492
5505	NC_016070	TGC	2	6	244899	244904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681492
5506	NC_016070	G	6	6	244905	244910	0 %	0 %	100 %	0 %	352681492
5507	NC_016070	GAG	2	6	244929	244934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681492
5508	NC_016070	GAG	2	6	245030	245035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681492
5509	NC_016070	CGC	3	9	245060	245068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681492
5510	NC_016070	AGG	2	6	245082	245087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681492
5511	NC_016070	CCG	2	6	245167	245172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681492
5512	NC_016070	GAGG	2	8	245327	245334	25 %	0 %	75 %	0 %	352681492
5513	NC_016070	GAG	2	6	245349	245354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681492
5514	NC_016070	AG	3	6	245394	245399	50 %	0 %	50 %	0 %	352681492
5515	NC_016070	CCGG	2	8	245471	245478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_016070	GCC	2	6	245544	245549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681493
5517	NC_016070	CGGGC	2	10	245556	245565	0 %	0 %	60 %	40 %	352681493
5518	NC_016070	GGA	2	6	245617	245622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681494
5519	NC_016070	CT	3	6	245652	245657	0 %	50 %	0 %	50 %	352681494
5520	NC_016070	GAG	2	6	245711	245716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681494
5521	NC_016070	CG	3	6	245768	245773	0 %	0 %	50 %	50 %	352681494
5522	NC_016070	GGGA	2	8	245777	245784	25 %	0 %	75 %	0 %	352681494
5523	NC_016070	GGA	2	6	245808	245813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681494
5524	NC_016070	CTC	2	6	245828	245833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681494
5525	NC_016070	CAA	2	6	245845	245850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681494
5526	NC_016070	CGA	2	6	245863	245868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681494
5527	NC_016070	GGA	2	6	245878	245883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681494
5528	NC_016070	GC	3	6	245890	245895	0 %	0 %	50 %	50 %	352681494
5529	NC_016070	CTGA	2	8	245907	245914	25 %	25 %	25 %	25 %	352681494
5530	NC_016070	CCT	2	6	245960	245965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681495
5531	NC_016070	CT	3	6	245969	245974	0 %	50 %	0 %	50 %	352681495
5532	NC_016070	GAG	2	6	246128	246133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681495
5533	NC_016070	TCCC	2	8	246166	246173	0 %	25 %	0 %	75 %	352681495
5534	NC_016070	CTC	2	6	246276	246281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681495
5535	NC_016070	CGTCGG	2	12	246316	246327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	352681495
5536	NC_016070	CGG	2	6	246346	246351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681495
5537	NC_016070	GAG	2	6	246366	246371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681495
5538	NC_016070	CGT	2	6	246406	246411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681495
5539	NC_016070	CCT	2	6	246464	246469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681495
5540	NC_016070	CGC	2	6	246511	246516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681495
5541	NC_016070	GAG	2	6	246578	246583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681495
5542	NC_016070	TCC	2	6	246585	246590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681495
5543	NC_016070	AGGCGA	2	12	246592	246603	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	352681495
5544	NC_016070	ACG	2	6	246636	246641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681495
5545	NC_016070	TCCCTC	2	12	246648	246659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681495
5546	NC_016070	AGC	2	6	246662	246667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681495
5547	NC_016070	TCG	2	6	246714	246719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681495
5548	NC_016070	CA	3	6	246786	246791	50 %	0 %	0 %	50 %	352681495
5549	NC_016070	TAT	2	6	246801	246806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_016070	CCG	2	6	246860	246865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681496
5551	NC_016070	TC	3	6	246871	246876	0 %	50 %	0 %	50 %	352681496
5552	NC_016070	AGG	2	6	246877	246882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681496
5553	NC_016070	TCG	2	6	246886	246891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681496
5554	NC_016070	GA	3	6	246909	246914	50 %	0 %	50 %	0 %	352681496
5555	NC_016070	GGA	2	6	246932	246937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681496
5556	NC_016070	GGA	2	6	246995	247000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681496
5557	NC_016070	GAG	2	6	247059	247064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681496
5558	NC_016070	ACG	2	6	247105	247110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681496
5559	NC_016070	CTC	2	6	247131	247136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681496
5560	NC_016070	GC	3	6	247170	247175	0 %	0 %	50 %	50 %	352681496
5561	NC_016070	GCG	2	6	247183	247188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681496
5562	NC_016070	TAC	2	6	247293	247298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681496
5563	NC_016070	G	6	6	247358	247363	0 %	0 %	100 %	0 %	352681496
5564	NC_016070	CT	4	8	247503	247510	0 %	50 %	0 %	50 %	352681496
5565	NC_016070	AG	3	6	247548	247553	50 %	0 %	50 %	0 %	352681496
5566	NC_016070	GGC	2	6	247593	247598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681496
5567	NC_016070	CGA	2	6	247778	247783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681496
5568	NC_016070	GAG	2	6	247811	247816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681496
5569	NC_016070	GAG	2	6	247830	247835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681496
5570	NC_016070	GCC	2	6	247857	247862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681496
5571	NC_016070	CAT	2	6	247868	247873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681496
5572	NC_016070	GAG	2	6	247913	247918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681496
5573	NC_016070	GCC	2	6	247938	247943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681496
5574	NC_016070	CGC	2	6	248000	248005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681496
5575	NC_016070	GAA	2	6	248033	248038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_016070	GA	3	6	248077	248082	50 %	0 %	50 %	0 %	352681497
5577	NC_016070	GGGCT	2	10	248100	248109	0 %	20 %	60 %	20 %	352681497
5578	NC_016070	GCC	2	6	248123	248128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681497
5579	NC_016070	CCG	2	6	248163	248168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681497
5580	NC_016070	CGT	2	6	248189	248194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681497
5581	NC_016070	TAC	2	6	248214	248219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681497
5582	NC_016070	CTC	2	6	248267	248272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681497
5583	NC_016070	AGG	3	9	248289	248297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681497
5584	NC_016070	TCC	2	6	248299	248304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681497
5585	NC_016070	GCGG	2	8	248315	248322	0 %	0 %	75 %	25 %	352681497
5586	NC_016070	CG	3	6	248420	248425	0 %	0 %	50 %	50 %	352681497
5587	NC_016070	GGA	2	6	248435	248440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681497
5588	NC_016070	TAC	2	6	248442	248447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681497
5589	NC_016070	GGC	2	6	248538	248543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_016070	CTG	2	6	248560	248565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681498
5591	NC_016070	ATC	2	6	248638	248643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681498
5592	NC_016070	CCG	2	6	248707	248712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681498
5593	NC_016070	G	6	6	248747	248752	0 %	0 %	100 %	0 %	352681498
5594	NC_016070	TAG	2	6	248801	248806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681498
5595	NC_016070	CCG	2	6	248825	248830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681498
5596	NC_016070	ACG	2	6	248944	248949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681498
5597	NC_016070	GC	3	6	249031	249036	0 %	0 %	50 %	50 %	352681498
5598	NC_016070	ACG	2	6	249074	249079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681498
5599	NC_016070	GCC	2	6	249082	249087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681498
5600	NC_016070	GGCC	2	8	249092	249099	0 %	0 %	50 %	50 %	352681498
5601	NC_016070	TCC	2	6	249196	249201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681498
5602	NC_016070	CAACTA	2	12	249423	249434	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	352681498
5603	NC_016070	GTC	2	6	249439	249444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681498
5604	NC_016070	CG	3	6	249485	249490	0 %	0 %	50 %	50 %	352681498
5605	NC_016070	CCG	2	6	249553	249558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681498
5606	NC_016070	ACT	2	6	249574	249579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681498
5607	NC_016070	GAC	2	6	249588	249593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681498
5608	NC_016070	CCT	2	6	249601	249606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681498
5609	NC_016070	ACC	2	6	249610	249615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681498
5610	NC_016070	GCC	2	6	249627	249632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681498
5611	NC_016070	CTC	2	6	249633	249638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681498
5612	NC_016070	GC	3	6	249662	249667	0 %	0 %	50 %	50 %	352681498
5613	NC_016070	TCCATC	2	12	249709	249720	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	352681498
5614	NC_016070	TCC	2	6	249737	249742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681498
5615	NC_016070	GAG	2	6	249759	249764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681498
5616	NC_016070	TCCACC	2	12	249901	249912	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	352681499
5617	NC_016070	C	6	6	249977	249982	0 %	0 %	0 %	100 %	352681499
5618	NC_016070	ACG	2	6	250013	250018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681499
5619	NC_016070	GAC	2	6	250110	250115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681499
5620	NC_016070	CGG	3	9	250143	250151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681499
5621	NC_016070	CTC	2	6	250152	250157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681499
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5623	NC_016070	CCT	2	6	250250	250255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681499
5624	NC_016070	ACG	2	6	250324	250329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681499
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5664	NC_016070	GTG	2	6	252216	252221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5665	NC_016070	GATA	2	8	252224	252231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5666	NC_016070	TCT	2	6	252292	252297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5995	NC_016070	GAC	3	9	265985	265993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681513
5996	NC_016070	AT	3	6	266002	266007	50 %	50 %	0 %	0 %	352681513
5997	NC_016070	GCC	2	6	266045	266050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681513
5998	NC_016070	TGA	2	6	266079	266084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681513
5999	NC_016070	CGC	2	6	266101	266106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681513
6000	NC_016070	GGAGG	2	10	266110	266119	20 %	0 %	80 %	0 %	352681513

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