MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016052	ATT	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516174
2	NC_016052	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	352516174
3	NC_016052	CTTT	2	8	194	201	0 %	75 %	0 %	25 %	352516174
4	NC_016052	ATG	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516174
5	NC_016052	GAA	2	6	214	219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516174
6	NC_016052	TTC	2	6	221	226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516174
7	NC_016052	AAG	2	6	269	274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516174
8	NC_016052	GAA	3	9	283	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516174
9	NC_016052	TGC	3	9	381	389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516174
10	NC_016052	GTT	2	6	394	399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516174
11	NC_016052	GAA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516174
12	NC_016052	TCTA	2	8	415	422	25 %	50 %	0 %	25 %	352516174
13	NC_016052	CT	3	6	428	433	0 %	50 %	0 %	50 %	352516174
14	NC_016052	CGG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516174
15	NC_016052	TCA	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516174
16	NC_016052	TTA	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516174
17	NC_016052	ATA	2	6	575	580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516174
18	NC_016052	GAA	2	6	586	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516174
19	NC_016052	GAAT	2	8	597	604	50 %	25 %	25 %	0 %	352516174
20	NC_016052	TTA	2	6	619	624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516174
21	NC_016052	GAT	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516174
22	NC_016052	TAA	2	6	651	656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516174
23	NC_016052	AAG	2	6	668	673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516174
24	NC_016052	T	6	6	676	681	0 %	100 %	0 %	0 %	352516174
25	NC_016052	ATA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516174
26	NC_016052	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	352516174
27	NC_016052	TGC	2	6	966	971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516174
28	NC_016052	AGC	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516174
29	NC_016052	AAG	3	9	1070	1078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516174
30	NC_016052	TAC	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516174
31	NC_016052	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	352516174
32	NC_016052	TTG	2	6	1139	1144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516174
33	NC_016052	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516174
34	NC_016052	GAA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516174
35	NC_016052	A	6	6	1314	1319	100 %	0 %	0 %	0 %	352516174
36	NC_016052	ATG	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516174
37	NC_016052	T	6	6	1410	1415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016052	CTA	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016052	T	7	7	1456	1462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016052	TAATA	2	10	1465	1474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016052	TA	3	6	1473	1478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016052	CAA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516175
43	NC_016052	AAC	2	6	1565	1570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516175
44	NC_016052	TAA	2	6	1607	1612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516175
45	NC_016052	T	6	6	1658	1663	0 %	100 %	0 %	0 %	352516175
46	NC_016052	TGA	3	9	1670	1678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516175
47	NC_016052	T	7	7	1730	1736	0 %	100 %	0 %	0 %	352516175
48	NC_016052	ATA	2	6	1789	1794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516175
49	NC_016052	CTT	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516175
50	NC_016052	CAG	2	6	1870	1875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516175
51	NC_016052	CTG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516175
52	NC_016052	TAAA	2	8	1915	1922	75 %	25 %	0 %	0 %	352516175
53	NC_016052	T	6	6	1939	1944	0 %	100 %	0 %	0 %	352516175
54	NC_016052	GTC	2	6	1963	1968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516175
55	NC_016052	AAT	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516175
56	NC_016052	TGA	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516175
57	NC_016052	AGA	2	6	2141	2146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516175
58	NC_016052	TCT	2	6	2259	2264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516175
59	NC_016052	CTT	2	6	2320	2325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516175
60	NC_016052	TAA	2	6	2345	2350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516175
61	NC_016052	GTT	2	6	2382	2387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516175
62	NC_016052	AGA	3	9	2420	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516175
63	NC_016052	TTTC	2	8	2467	2474	0 %	75 %	0 %	25 %	352516175
64	NC_016052	ACA	2	6	2517	2522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516175
65	NC_016052	TAA	2	6	2622	2627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516175
66	NC_016052	AAG	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016052	CTT	2	6	2674	2679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016052	ATTT	2	8	2740	2747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016052	A	6	6	2760	2765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016052	TATAA	2	10	2769	2778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016052	GAAAA	2	10	2788	2797	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016052	GAAA	2	8	2812	2819	75 %	0 %	25 %	0 %	352516176
73	NC_016052	A	6	6	2817	2822	100 %	0 %	0 %	0 %	352516176
74	NC_016052	AT	3	6	2839	2844	50 %	50 %	0 %	0 %	352516176
75	NC_016052	GAA	2	6	2958	2963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516176
76	NC_016052	T	7	7	3007	3013	0 %	100 %	0 %	0 %	352516176
77	NC_016052	AAT	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516176
78	NC_016052	ATG	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516177
79	NC_016052	ATT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516177
80	NC_016052	TGT	2	6	3107	3112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516177
81	NC_016052	T	7	7	3115	3121	0 %	100 %	0 %	0 %	352516177
82	NC_016052	TTA	2	6	3241	3246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516177
83	NC_016052	A	8	8	3259	3266	100 %	0 %	0 %	0 %	352516177
84	NC_016052	GTT	2	6	3287	3292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516177
85	NC_016052	A	6	6	3300	3305	100 %	0 %	0 %	0 %	352516177
86	NC_016052	A	7	7	3337	3343	100 %	0 %	0 %	0 %	352516177
87	NC_016052	TCTT	2	8	3395	3402	0 %	75 %	0 %	25 %	352516177
88	NC_016052	GAA	3	9	3424	3432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516177
89	NC_016052	GATT	2	8	3458	3465	25 %	50 %	25 %	0 %	352516177
90	NC_016052	A	6	6	3496	3501	100 %	0 %	0 %	0 %	352516177
91	NC_016052	AAC	2	6	3508	3513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516177
92	NC_016052	AAC	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516177
93	NC_016052	AAAC	2	8	3546	3553	75 %	0 %	0 %	25 %	352516177
94	NC_016052	ATTG	2	8	3587	3594	25 %	50 %	25 %	0 %	352516177
95	NC_016052	A	6	6	3670	3675	100 %	0 %	0 %	0 %	352516177
96	NC_016052	TCAA	2	8	3680	3687	50 %	25 %	0 %	25 %	352516177
97	NC_016052	GAA	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516177
98	NC_016052	ATG	2	6	3739	3744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516177
99	NC_016052	A	6	6	3756	3761	100 %	0 %	0 %	0 %	352516177
100	NC_016052	A	6	6	3781	3786	100 %	0 %	0 %	0 %	352516177
101	NC_016052	T	6	6	3848	3853	0 %	100 %	0 %	0 %	352516177
102	NC_016052	TAA	2	6	3857	3862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516177
103	NC_016052	A	6	6	3861	3866	100 %	0 %	0 %	0 %	352516177
104	NC_016052	CTG	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516177
105	NC_016052	TTGAT	2	10	3934	3943	20 %	60 %	20 %	0 %	352516177
106	NC_016052	AGA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516177
107	NC_016052	GAT	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516177
108	NC_016052	TGA	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516177
109	NC_016052	TTA	2	6	4023	4028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516177
110	NC_016052	AAC	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516177
111	NC_016052	ACA	2	6	4068	4073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516177
112	NC_016052	T	6	6	4114	4119	0 %	100 %	0 %	0 %	352516177
113	NC_016052	AGA	3	9	4163	4171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516178
114	NC_016052	CTA	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516178
115	NC_016052	CCA	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352516178
116	NC_016052	TTG	2	6	4369	4374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516178
117	NC_016052	ATA	2	6	4381	4386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516178
118	NC_016052	TAACAG	2	12	4390	4401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	352516178
119	NC_016052	CGG	2	6	4496	4501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516178
120	NC_016052	TGG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516178
121	NC_016052	GGA	2	6	4521	4526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352516178
122	NC_016052	TTC	2	6	4541	4546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516178
123	NC_016052	AGT	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516178
124	NC_016052	A	6	6	4566	4571	100 %	0 %	0 %	0 %	352516178
125	NC_016052	TAT	2	6	4605	4610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516178
126	NC_016052	TCG	2	6	4805	4810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516178
127	NC_016052	AGA	2	6	4814	4819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516178
128	NC_016052	TGTTT	2	10	4892	4901	0 %	80 %	20 %	0 %	352516178
129	NC_016052	AT	3	6	4911	4916	50 %	50 %	0 %	0 %	352516178
130	NC_016052	CAA	3	9	4926	4934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516178
131	NC_016052	TGA	2	6	4987	4992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516178
132	NC_016052	TAA	2	6	5000	5005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516178
133	NC_016052	GGT	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516178
134	NC_016052	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516178
135	NC_016052	GAAA	2	8	5099	5106	75 %	0 %	25 %	0 %	352516178
136	NC_016052	ATG	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516178
137	NC_016052	CTG	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516178
138	NC_016052	ACAA	2	8	5192	5199	75 %	0 %	0 %	25 %	352516178
139	NC_016052	GTAC	2	8	5223	5230	25 %	25 %	25 %	25 %	352516178
140	NC_016052	GTC	2	6	5293	5298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516178
141	NC_016052	GCT	2	6	5340	5345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516178
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144	NC_016052	TATT	2	8	5449	5456	25 %	75 %	0 %	0 %	352516178
145	NC_016052	CTG	2	6	5470	5475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516178
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147	NC_016052	TTCG	2	8	5590	5597	0 %	50 %	25 %	25 %	352516178
148	NC_016052	GAA	2	6	5628	5633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516178
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150	NC_016052	GTT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516178
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152	NC_016052	GGA	2	6	5843	5848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352516178
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156	NC_016052	AGG	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016052	GA	3	6	6130	6135	50 %	0 %	50 %	0 %	352516179
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165	NC_016052	TTGA	2	8	6716	6723	25 %	50 %	25 %	0 %	352516179
166	NC_016052	ATTG	2	8	6940	6947	25 %	50 %	25 %	0 %	352516179
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215	NC_016052	TAG	2	6	8622	8627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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217	NC_016052	A	7	7	8653	8659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_016052	AGT	2	6	8766	8771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
222	NC_016052	CT	4	8	8784	8791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
223	NC_016052	A	6	6	8800	8805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_016052	CAAACA	2	12	9575	9586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516181
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247	NC_016052	ATC	2	6	9643	9648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516181
248	NC_016052	GAT	3	9	9662	9670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516181
249	NC_016052	TAA	2	6	9680	9685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516181
250	NC_016052	AGG	2	6	9692	9697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_016052	CAA	2	6	9712	9717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516182
252	NC_016052	AGA	2	6	9718	9723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516182
253	NC_016052	CGT	2	6	9736	9741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516182
254	NC_016052	GCA	2	6	9757	9762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516182
255	NC_016052	ATT	2	6	9798	9803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516182
256	NC_016052	ATTT	2	8	9810	9817	25 %	75 %	0 %	0 %	352516182
257	NC_016052	TCG	2	6	9840	9845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516182
258	NC_016052	A	6	6	9864	9869	100 %	0 %	0 %	0 %	352516182
259	NC_016052	TAT	2	6	9906	9911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516182
260	NC_016052	ATG	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516182
261	NC_016052	T	7	7	9979	9985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_016052	ATC	2	6	9986	9991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_016052	ATA	2	6	10013	10018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_016052	T	7	7	10069	10075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_016052	ATT	2	6	10090	10095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_016052	ATT	2	6	10154	10159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516183
267	NC_016052	GAT	2	6	10196	10201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516183
268	NC_016052	ACA	2	6	10232	10237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516183
269	NC_016052	GAAT	2	8	10255	10262	50 %	25 %	25 %	0 %	352516183
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271	NC_016052	T	7	7	10300	10306	0 %	100 %	0 %	0 %	352516183
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