MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43120	NC_016052	GAC	2	6	1799053	1799058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352517941
43121	NC_016052	AACCT	2	10	1799082	1799091	40 %	20 %	0 %	40 %	352517941
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43123	NC_016052	TTG	2	6	1799152	1799157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352517941
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43128	NC_016052	CGT	2	6	1799586	1799591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352517941
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43139	NC_016052	TCT	2	6	1800374	1800379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43141	NC_016052	CTT	2	6	1800449	1800454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43142	NC_016052	TC	3	6	1800520	1800525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43143	NC_016052	TCA	2	6	1800609	1800614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43145	NC_016052	CTTC	2	8	1800652	1800659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43147	NC_016052	CTAG	2	8	1800730	1800737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43148	NC_016052	ATGCC	2	10	1800742	1800751	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43149	NC_016052	CA	3	6	1800755	1800760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43150	NC_016052	CAA	2	6	1800880	1800885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352517942
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43153	NC_016052	T	6	6	1800977	1800982	0 %	100 %	0 %	0 %	352517942
43154	NC_016052	CTT	2	6	1801002	1801007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517942
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43157	NC_016052	CCT	2	6	1801252	1801257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43158	NC_016052	TTTCTT	2	12	1801270	1801281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	352517943
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43161	NC_016052	T	7	7	1801341	1801347	0 %	100 %	0 %	0 %	352517943
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43175	NC_016052	TTTCT	2	10	1801804	1801813	0 %	80 %	0 %	20 %	352517943
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43224	NC_016052	AAGC	2	8	1803620	1803627	50 %	0 %	25 %	25 %	352517944
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43226	NC_016052	ATC	2	6	1803754	1803759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517944
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43229	NC_016052	CT	3	6	1803835	1803840	0 %	50 %	0 %	50 %	352517944
43230	NC_016052	T	8	8	1803886	1803893	0 %	100 %	0 %	0 %	352517944
43231	NC_016052	T	6	6	1803896	1803901	0 %	100 %	0 %	0 %	352517944
43232	NC_016052	T	7	7	1803930	1803936	0 %	100 %	0 %	0 %	352517944
43233	NC_016052	CTCC	2	8	1803997	1804004	0 %	25 %	0 %	75 %	352517944
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43243	NC_016052	A	7	7	1804374	1804380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43354	NC_016052	A	6	6	1809547	1809552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43355	NC_016052	TGC	2	6	1809589	1809594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352517950
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43357	NC_016052	TGA	2	6	1809606	1809611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352517950
43358	NC_016052	GCG	2	6	1809624	1809629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352517950
43359	NC_016052	TCC	2	6	1809670	1809675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352517950
43360	NC_016052	AT	3	6	1809687	1809692	50 %	50 %	0 %	0 %	352517950
43361	NC_016052	ACT	2	6	1809746	1809751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517950
43362	NC_016052	A	6	6	1809767	1809772	100 %	0 %	0 %	0 %	352517950
43363	NC_016052	T	6	6	1809797	1809802	0 %	100 %	0 %	0 %	352517950
43364	NC_016052	TCT	2	6	1809821	1809826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517950
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43367	NC_016052	CA	3	6	1809880	1809885	50 %	0 %	0 %	50 %	352517950
43368	NC_016052	ACAA	2	8	1810076	1810083	75 %	0 %	0 %	25 %	352517950
43369	NC_016052	GCG	2	6	1810124	1810129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352517950
43370	NC_016052	CG	3	6	1810128	1810133	0 %	0 %	50 %	50 %	352517950
43371	NC_016052	TTG	2	6	1810137	1810142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352517950
43372	NC_016052	ACC	2	6	1810144	1810149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352517950
43373	NC_016052	AAT	2	6	1810159	1810164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352517950
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43375	NC_016052	T	7	7	1810232	1810238	0 %	100 %	0 %	0 %	352517950
43376	NC_016052	CGC	2	6	1810251	1810256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352517950
43377	NC_016052	GAT	2	6	1810261	1810266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352517950
43378	NC_016052	TTG	2	6	1810309	1810314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352517950
43379	NC_016052	CTT	2	6	1810359	1810364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517950
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43381	NC_016052	CTT	2	6	1810481	1810486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517950
43382	NC_016052	ATA	2	6	1810548	1810553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352517950
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43384	NC_016052	A	8	8	1810656	1810663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43385	NC_016052	ATT	2	6	1810717	1810722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43386	NC_016052	TAA	2	6	1810749	1810754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43387	NC_016052	TCA	2	6	1810792	1810797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43388	NC_016052	TGA	2	6	1810902	1810907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352517951
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43390	NC_016052	TCA	2	6	1810976	1810981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517951
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43392	NC_016052	TCT	2	6	1811020	1811025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517951
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43394	NC_016052	CAT	2	6	1811057	1811062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517951
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43409	NC_016052	T	6	6	1811609	1811614	0 %	100 %	0 %	0 %	352517951
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43422	NC_016052	TCT	2	6	1812085	1812090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517951
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43424	NC_016052	CTG	2	6	1812117	1812122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352517951
43425	NC_016052	GTTT	2	8	1812157	1812164	0 %	75 %	25 %	0 %	352517951
43426	NC_016052	TTG	2	6	1812174	1812179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352517951
43427	NC_016052	TTA	2	6	1812194	1812199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43428	NC_016052	T	8	8	1812207	1812214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43429	NC_016052	TAGTG	2	10	1812255	1812264	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43430	NC_016052	CA	3	6	1812270	1812275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43431	NC_016052	ACA	2	6	1812349	1812354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43432	NC_016052	ATGA	2	8	1812377	1812384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43433	NC_016052	A	7	7	1812396	1812402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43434	NC_016052	GGCA	2	8	1812454	1812461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43435	NC_016052	AGGT	2	8	1812487	1812494	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43436	NC_016052	T	7	7	1812498	1812504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43437	NC_016052	GCTTT	2	10	1812516	1812525	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43438	NC_016052	TAAAG	2	10	1812546	1812555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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43448	NC_016052	CT	3	6	1812939	1812944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43449	NC_016052	T	6	6	1812946	1812951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43450	NC_016052	CTTT	2	8	1813051	1813058	0 %	75 %	0 %	25 %	352517953
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43463	NC_016052	GAT	2	6	1813582	1813587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352517953
43464	NC_016052	A	7	7	1813665	1813671	100 %	0 %	0 %	0 %	352517953
43465	NC_016052	A	7	7	1813728	1813734	100 %	0 %	0 %	0 %	352517953
43466	NC_016052	AGA	2	6	1813794	1813799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352517953
43467	NC_016052	A	6	6	1813814	1813819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43468	NC_016052	CAAT	2	8	1813825	1813832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43469	NC_016052	TAG	2	6	1813848	1813853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43470	NC_016052	A	7	7	1813856	1813862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43471	NC_016052	T	7	7	1813871	1813877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43472	NC_016052	ATA	2	6	1813902	1813907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43473	NC_016052	TAGT	2	8	1813930	1813937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43474	NC_016052	TA	3	6	1813939	1813944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43475	NC_016052	T	6	6	1813992	1813997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43476	NC_016052	A	6	6	1814004	1814009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43477	NC_016052	TTC	2	6	1814087	1814092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517954
43478	NC_016052	TCA	2	6	1814097	1814102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517954
43479	NC_016052	TCG	2	6	1814115	1814120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352517954
43480	NC_016052	TCA	3	9	1814121	1814129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517954
43481	NC_016052	TTC	3	9	1814165	1814173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517954
43482	NC_016052	ATC	2	6	1814177	1814182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517954
43483	NC_016052	TCA	4	12	1814235	1814246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517954
43484	NC_016052	TCA	3	9	1814250	1814258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517954
43485	NC_016052	ATC	2	6	1814264	1814269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352517954
43486	NC_016052	GTC	2	6	1814270	1814275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352517954
43487	NC_016052	GCT	2	6	1814277	1814282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352517954
43488	NC_016052	CCA	2	6	1814337	1814342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352517954
43489	NC_016052	TTA	2	6	1814358	1814363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352517954
43490	NC_016052	ACG	2	6	1814369	1814374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352517954
43491	NC_016052	TCATCT	2	12	1814382	1814393	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	352517954
43492	NC_016052	CTT	2	6	1814410	1814415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517954
43493	NC_016052	AAG	2	6	1814518	1814523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352517954
43494	NC_016052	CTT	2	6	1814599	1814604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352517954
43495	NC_016052	TTTA	2	8	1814648	1814655	25 %	75 %	0 %	0 %	352517954
43496	NC_016052	A	7	7	1814729	1814735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43497	NC_016052	T	6	6	1814740	1814745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43498	NC_016052	A	7	7	1814749	1814755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43499	NC_016052	ATAA	2	8	1814817	1814824	75 %	25 %	0 %	0 %	352517955
43500	NC_016052	GAT	2	6	1814857	1814862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352517955

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