MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016052	AAT	2	6	38638	38643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516209
1003	NC_016052	TAG	2	6	38648	38653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516209
1004	NC_016052	GTT	3	9	38656	38664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516209
1005	NC_016052	A	7	7	38683	38689	100 %	0 %	0 %	0 %	352516209
1006	NC_016052	TGG	2	6	38772	38777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516209
1007	NC_016052	TTAC	2	8	38783	38790	25 %	50 %	0 %	25 %	352516209
1008	NC_016052	ACC	2	6	38797	38802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352516209
1009	NC_016052	A	6	6	38893	38898	100 %	0 %	0 %	0 %	352516209
1010	NC_016052	CTTT	2	8	38920	38927	0 %	75 %	0 %	25 %	352516209
1011	NC_016052	CCGGA	2	10	38939	38948	20 %	0 %	40 %	40 %	352516209
1012	NC_016052	AGA	2	6	38955	38960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516209
1013	NC_016052	GAA	2	6	38998	39003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516209
1014	NC_016052	TTAT	2	8	39015	39022	25 %	75 %	0 %	0 %	352516209
1015	NC_016052	TTA	2	6	39082	39087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516209
1016	NC_016052	A	6	6	39091	39096	100 %	0 %	0 %	0 %	352516209
1017	NC_016052	TAA	2	6	39098	39103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516209
1018	NC_016052	AATA	2	8	39104	39111	75 %	25 %	0 %	0 %	352516209
1019	NC_016052	T	6	6	39127	39132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016052	T	8	8	39138	39145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016052	A	7	7	39147	39153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016052	AGT	2	6	39188	39193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016052	AGG	2	6	39206	39211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016052	AGC	2	6	39239	39244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516210
1025	NC_016052	A	6	6	39260	39265	100 %	0 %	0 %	0 %	352516210
1026	NC_016052	TAT	2	6	39293	39298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516210
1027	NC_016052	TGG	2	6	39377	39382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516210
1028	NC_016052	GCT	2	6	39486	39491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516210
1029	NC_016052	TGA	2	6	39551	39556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516210
1030	NC_016052	GCA	2	6	39657	39662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516210
1031	NC_016052	TATT	2	8	39787	39794	25 %	75 %	0 %	0 %	352516210
1032	NC_016052	CGA	2	6	39894	39899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516210
1033	NC_016052	ATT	2	6	39927	39932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516210
1034	NC_016052	A	6	6	39959	39964	100 %	0 %	0 %	0 %	352516210
1035	NC_016052	ATT	2	6	40037	40042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516210
1036	NC_016052	GTG	2	6	40078	40083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516210
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1038	NC_016052	A	6	6	40134	40139	100 %	0 %	0 %	0 %	352516210
1039	NC_016052	TGA	2	6	40205	40210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516210
1040	NC_016052	CAG	2	6	40219	40224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516210
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1042	NC_016052	AAG	2	6	40234	40239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516210
1043	NC_016052	AATA	2	8	40267	40274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016052	TTTTG	2	10	40316	40325	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016052	ATTA	2	8	40349	40356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016052	ATTAAA	2	12	40397	40408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016052	TG	3	6	40410	40415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016052	AC	3	6	40420	40425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_016052	ATTT	2	8	40449	40456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016052	A	6	6	40472	40477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016052	ATC	2	6	40547	40552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516211
1052	NC_016052	T	6	6	40581	40586	0 %	100 %	0 %	0 %	352516211
1053	NC_016052	TCA	2	6	40600	40605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516211
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1055	NC_016052	A	6	6	40679	40684	100 %	0 %	0 %	0 %	352516211
1056	NC_016052	GTT	2	6	40690	40695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516211
1057	NC_016052	GAA	2	6	40706	40711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516211
1058	NC_016052	GAAA	2	8	40747	40754	75 %	0 %	25 %	0 %	352516211
1059	NC_016052	GAT	2	6	40820	40825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516211
1060	NC_016052	ACA	2	6	40882	40887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516211
1061	NC_016052	CGAG	2	8	40897	40904	25 %	0 %	50 %	25 %	352516211
1062	NC_016052	GAA	2	6	40916	40921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516211
1063	NC_016052	ACA	2	6	40933	40938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516211
1064	NC_016052	CGCTG	2	10	40957	40966	0 %	20 %	40 %	40 %	352516211
1065	NC_016052	GAT	2	6	40973	40978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516211
1066	NC_016052	AGA	3	9	41005	41013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516211
1067	NC_016052	ATCTT	2	10	41093	41102	20 %	60 %	0 %	20 %	352516211
1068	NC_016052	TGC	2	6	41119	41124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516211
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1072	NC_016052	ATT	2	6	41249	41254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516211
1073	NC_016052	GAT	2	6	41255	41260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516211
1074	NC_016052	TAT	2	6	41277	41282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516211
1075	NC_016052	TCG	2	6	41299	41304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516211
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1077	NC_016052	GAA	2	6	41369	41374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516211
1078	NC_016052	GCT	2	6	41567	41572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516211
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1082	NC_016052	TCA	2	6	41731	41736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516211
1083	NC_016052	TGG	2	6	41772	41777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516211
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1085	NC_016052	TCG	2	6	41842	41847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516211
1086	NC_016052	GAA	2	6	41945	41950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516211
1087	NC_016052	TAA	2	6	42042	42047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516211
1088	NC_016052	ATA	2	6	42076	42081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516211
1089	NC_016052	A	6	6	42087	42092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_016052	TTTA	2	8	42295	42302	25 %	75 %	0 %	0 %	352516212
1095	NC_016052	AAG	2	6	42421	42426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516212
1096	NC_016052	ACT	2	6	42446	42451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516212
1097	NC_016052	ATTT	2	8	42457	42464	25 %	75 %	0 %	0 %	352516212
1098	NC_016052	CTT	2	6	42489	42494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516212
1099	NC_016052	GCCA	2	8	42504	42511	25 %	0 %	25 %	50 %	352516212
1100	NC_016052	CCA	2	6	42555	42560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352516212
1101	NC_016052	TGT	2	6	42562	42567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516212
1102	NC_016052	T	6	6	42673	42678	0 %	100 %	0 %	0 %	352516212
1103	NC_016052	GTGGG	2	10	42781	42790	0 %	20 %	80 %	0 %	352516212
1104	NC_016052	TTC	2	6	42793	42798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516212
1105	NC_016052	ATA	2	6	42801	42806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516212
1106	NC_016052	T	6	6	42807	42812	0 %	100 %	0 %	0 %	352516212
1107	NC_016052	ATTC	2	8	42844	42851	25 %	50 %	0 %	25 %	352516212
1108	NC_016052	CCT	2	6	42861	42866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_016052	T	6	6	42866	42871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016052	TAT	2	6	42875	42880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016052	AT	3	6	42879	42884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016052	A	6	6	42893	42898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016052	TAA	2	6	42922	42927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516213
1114	NC_016052	GTT	2	6	42951	42956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516213
1115	NC_016052	TGT	2	6	42988	42993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516213
1116	NC_016052	CTT	2	6	43068	43073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516213
1117	NC_016052	GCA	2	6	43097	43102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516213
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1119	NC_016052	CAA	2	6	43152	43157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516213
1120	NC_016052	T	7	7	43186	43192	0 %	100 %	0 %	0 %	352516213
1121	NC_016052	AAAT	2	8	43194	43201	75 %	25 %	0 %	0 %	352516213
1122	NC_016052	TAA	2	6	43282	43287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516213
1123	NC_016052	GTA	2	6	43308	43313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516213
1124	NC_016052	T	7	7	43331	43337	0 %	100 %	0 %	0 %	352516213
1125	NC_016052	ATC	2	6	43372	43377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516213
1126	NC_016052	T	7	7	43378	43384	0 %	100 %	0 %	0 %	352516213
1127	NC_016052	CCG	2	6	43385	43390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352516213
1128	NC_016052	GCA	2	6	43475	43480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516213
1129	NC_016052	TGA	2	6	43524	43529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516213
1130	NC_016052	ATT	2	6	43562	43567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516213
1131	NC_016052	CT	3	6	43568	43573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_016052	TAA	2	6	43581	43586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516214
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1134	NC_016052	CAA	2	6	43639	43644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516214
1135	NC_016052	AGT	2	6	43646	43651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516214
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1137	NC_016052	TAGT	2	8	43804	43811	25 %	50 %	25 %	0 %	352516214
1138	NC_016052	TA	3	6	43814	43819	50 %	50 %	0 %	0 %	352516214
1139	NC_016052	TGC	2	6	43826	43831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516214
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1142	NC_016052	CTT	2	6	43900	43905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516214
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1145	NC_016052	ATA	2	6	44003	44008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516214
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1152	NC_016052	TCT	2	6	44341	44346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516214
1153	NC_016052	TAG	2	6	44350	44355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516214
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1164	NC_016052	AT	3	6	44635	44640	50 %	50 %	0 %	0 %	352516214
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1168	NC_016052	ATT	2	6	44850	44855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516214
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1206	NC_016052	TAT	2	6	46392	46397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1208	NC_016052	TA	3	6	46467	46472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1225	NC_016052	TGGT	2	8	47340	47347	0 %	50 %	50 %	0 %	352516215
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1240	NC_016052	TGG	3	9	47823	47831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516215
1241	NC_016052	TAA	2	6	47916	47921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516215
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1246	NC_016052	TGA	2	6	48092	48097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_016052	A	6	6	48112	48117	100 %	0 %	0 %	0 %	352516216
1248	NC_016052	AGA	2	6	48149	48154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516216
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1250	NC_016052	GCAA	2	8	48376	48383	50 %	0 %	25 %	25 %	352516216
1251	NC_016052	AAG	2	6	48463	48468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516216
1252	NC_016052	TAAA	2	8	48492	48499	75 %	25 %	0 %	0 %	352516216
1253	NC_016052	TTG	2	6	48544	48549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_016052	T	7	7	48559	48565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_016052	T	7	7	48623	48629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_016052	T	6	6	48642	48647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_016052	ACA	2	6	48694	48699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_016052	AAT	2	6	48730	48735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516217
1259	NC_016052	AATT	2	8	48754	48761	50 %	50 %	0 %	0 %	352516217
1260	NC_016052	TGT	2	6	48774	48779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516217
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1280	NC_016052	T	7	7	49502	49508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_016052	TAA	2	6	49583	49588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_016052	ATAAA	2	10	49632	49641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1283	NC_016052	A	6	6	49639	49644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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