MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016052	AGG	2	6	454597	454602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_016052	AGT	2	6	454693	454698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516621
11003	NC_016052	GCT	2	6	454715	454720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516621
11004	NC_016052	TTG	2	6	454728	454733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516621
11005	NC_016052	TTA	2	6	454760	454765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516621
11006	NC_016052	AAT	2	6	454843	454848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516621
11007	NC_016052	AGC	2	6	454849	454854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516621
11008	NC_016052	ATA	2	6	454896	454901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516621
11009	NC_016052	CTG	2	6	454926	454931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516621
11010	NC_016052	A	6	6	454951	454956	100 %	0 %	0 %	0 %	352516621
11011	NC_016052	ATG	2	6	454986	454991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516621
11012	NC_016052	TAAAG	2	10	455042	455051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_016052	CA	3	6	455184	455189	50 %	0 %	0 %	50 %	352516622
11014	NC_016052	A	6	6	455206	455211	100 %	0 %	0 %	0 %	352516622
11015	NC_016052	GTAT	2	8	455251	455258	25 %	50 %	25 %	0 %	352516622
11016	NC_016052	GCA	2	6	455287	455292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516622
11017	NC_016052	AGA	2	6	455355	455360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516622
11018	NC_016052	GAA	2	6	455461	455466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516622
11019	NC_016052	AAC	2	6	455471	455476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516622
11020	NC_016052	AGA	2	6	455499	455504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516622
11021	NC_016052	AAG	2	6	455519	455524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516622
11022	NC_016052	TGA	2	6	455538	455543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516622
11023	NC_016052	TCT	2	6	455611	455616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516623
11024	NC_016052	ATGG	2	8	455625	455632	25 %	25 %	50 %	0 %	352516623
11025	NC_016052	TTA	2	6	455634	455639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516623
11026	NC_016052	TAT	2	6	455658	455663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516623
11027	NC_016052	A	6	6	455784	455789	100 %	0 %	0 %	0 %	352516623
11028	NC_016052	A	6	6	455797	455802	100 %	0 %	0 %	0 %	352516623
11029	NC_016052	AGCT	2	8	455830	455837	25 %	25 %	25 %	25 %	352516623
11030	NC_016052	A	6	6	455861	455866	100 %	0 %	0 %	0 %	352516623
11031	NC_016052	T	6	6	455879	455884	0 %	100 %	0 %	0 %	352516623
11032	NC_016052	TAC	2	6	455921	455926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516623
11033	NC_016052	TTC	3	9	455927	455935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516623
11034	NC_016052	A	7	7	455936	455942	100 %	0 %	0 %	0 %	352516623
11035	NC_016052	T	7	7	455982	455988	0 %	100 %	0 %	0 %	352516623
11036	NC_016052	GAA	2	6	456006	456011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516623
11037	NC_016052	GTA	2	6	456016	456021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516623
11038	NC_016052	ATTT	2	8	456039	456046	25 %	75 %	0 %	0 %	352516623
11039	NC_016052	CAAG	2	8	456066	456073	50 %	0 %	25 %	25 %	352516623
11040	NC_016052	AGA	2	6	456077	456082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516623
11041	NC_016052	GTA	2	6	456087	456092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516623
11042	NC_016052	GGC	2	6	456119	456124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516623
11043	NC_016052	GAA	2	6	456177	456182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516623
11044	NC_016052	AGA	2	6	456189	456194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516623
11045	NC_016052	AGG	2	6	456253	456258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_016052	ACA	2	6	456356	456361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516624
11047	NC_016052	GCA	2	6	456403	456408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516624
11048	NC_016052	GGC	2	6	456443	456448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516624
11049	NC_016052	TCAG	2	8	456466	456473	25 %	25 %	25 %	25 %	352516624
11050	NC_016052	ATA	2	6	456483	456488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516624
11051	NC_016052	T	6	6	456503	456508	0 %	100 %	0 %	0 %	352516624
11052	NC_016052	AAAC	2	8	456557	456564	75 %	0 %	0 %	25 %	352516624
11053	NC_016052	AAT	2	6	456586	456591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516624
11054	NC_016052	GAA	3	9	456602	456610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516624
11055	NC_016052	T	6	6	456613	456618	0 %	100 %	0 %	0 %	352516624
11056	NC_016052	CTG	2	6	456678	456683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516624
11057	NC_016052	A	6	6	456705	456710	100 %	0 %	0 %	0 %	352516624
11058	NC_016052	TAA	2	6	456724	456729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516624
11059	NC_016052	AAAGC	2	10	456791	456800	60 %	0 %	20 %	20 %	352516624
11060	NC_016052	TTA	2	6	456803	456808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516624
11061	NC_016052	GAA	2	6	456824	456829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516624
11062	NC_016052	GCT	2	6	456833	456838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516624
11063	NC_016052	TTTA	2	8	456898	456905	25 %	75 %	0 %	0 %	352516624
11064	NC_016052	TTG	2	6	456921	456926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516624
11065	NC_016052	CAA	2	6	457064	457069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516624
11066	NC_016052	TGA	2	6	457072	457077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516624
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11068	NC_016052	ATT	2	6	457155	457160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516624
11069	NC_016052	TAA	2	6	457167	457172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516624
11070	NC_016052	AAG	2	6	457188	457193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516624
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11072	NC_016052	ATG	2	6	457215	457220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516625
11073	NC_016052	AT	3	6	457232	457237	50 %	50 %	0 %	0 %	352516625
11074	NC_016052	GAA	2	6	457238	457243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516625
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11076	NC_016052	A	8	8	457301	457308	100 %	0 %	0 %	0 %	352516625
11077	NC_016052	ATAA	2	8	457311	457318	75 %	25 %	0 %	0 %	352516625
11078	NC_016052	ACT	2	6	457338	457343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516625
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11081	NC_016052	GTT	2	6	457466	457471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516625
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11084	NC_016052	TTG	2	6	457639	457644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516625
11085	NC_016052	T	6	6	457682	457687	0 %	100 %	0 %	0 %	352516625
11086	NC_016052	AGTT	2	8	457693	457700	25 %	50 %	25 %	0 %	352516625
11087	NC_016052	ATG	2	6	457705	457710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516625
11088	NC_016052	ATA	2	6	457723	457728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516625
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11090	NC_016052	A	6	6	457863	457868	100 %	0 %	0 %	0 %	352516625
11091	NC_016052	AC	3	6	457879	457884	50 %	0 %	0 %	50 %	352516625
11092	NC_016052	GAA	2	6	457908	457913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516625
11093	NC_016052	ACT	2	6	457926	457931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516625
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11095	NC_016052	A	6	6	457998	458003	100 %	0 %	0 %	0 %	352516625
11096	NC_016052	TAT	2	6	458026	458031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516625
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11098	NC_016052	A	8	8	458118	458125	100 %	0 %	0 %	0 %	352516625
11099	NC_016052	GAA	2	6	458130	458135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516625
11100	NC_016052	CAG	2	6	458158	458163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516625
11101	NC_016052	TGAA	2	8	458207	458214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_016052	ATG	2	6	458251	458256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_016052	T	6	6	458259	458264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_016052	TAG	2	6	458285	458290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_016052	ATC	2	6	458308	458313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_016052	ATT	2	6	458316	458321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_016052	AT	3	6	458323	458328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_016052	GTG	2	6	458372	458377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_016052	TCAT	2	8	458420	458427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11110	NC_016052	A	7	7	458428	458434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_016052	TAA	2	6	458518	458523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516626
11112	NC_016052	A	6	6	458546	458551	100 %	0 %	0 %	0 %	352516626
11113	NC_016052	A	6	6	458600	458605	100 %	0 %	0 %	0 %	352516626
11114	NC_016052	ACA	2	6	458704	458709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516626
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11116	NC_016052	TTC	2	6	458863	458868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516626
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11118	NC_016052	TCAA	2	8	459039	459046	50 %	25 %	0 %	25 %	352516626
11119	NC_016052	T	6	6	459121	459126	0 %	100 %	0 %	0 %	352516626
11120	NC_016052	GAA	2	6	459139	459144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516626
11121	NC_016052	TGG	2	6	459213	459218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516626
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11253	NC_016052	GA	3	6	464092	464097	50 %	0 %	50 %	0 %	352516633
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11365	NC_016052	T	7	7	468562	468568	0 %	100 %	0 %	0 %	352516637
11366	NC_016052	ATC	2	6	468579	468584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516637
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11370	NC_016052	TTCT	2	8	468705	468712	0 %	75 %	0 %	25 %	352516637
11371	NC_016052	T	6	6	468717	468722	0 %	100 %	0 %	0 %	352516637
11372	NC_016052	ATC	2	6	468745	468750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516638
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11498	NC_016052	GAT	2	6	474164	474169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516641
11499	NC_016052	AAG	2	6	474190	474195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516641
11500	NC_016052	TAC	2	6	474200	474205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516641

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