MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_016052	GTT	2	6	2442500	2442505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58502	NC_016052	GTA	2	6	2442685	2442690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58503	NC_016052	CCT	2	6	2442702	2442707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58504	NC_016052	CCTA	2	8	2442737	2442744	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58505	NC_016052	TC	3	6	2442857	2442862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58506	NC_016052	GCC	2	6	2442954	2442959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58507	NC_016052	CTC	2	6	2443002	2443007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58508	NC_016052	GCT	2	6	2443111	2443116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58509	NC_016052	AGC	2	6	2443123	2443128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58510	NC_016052	TCGC	2	8	2443181	2443188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58511	NC_016052	CTC	2	6	2443204	2443209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58512	NC_016052	GAC	2	6	2443210	2443215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58513	NC_016052	CTT	2	6	2443245	2443250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58514	NC_016052	TCCC	2	8	2443301	2443308	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58515	NC_016052	CTTT	2	8	2443390	2443397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58516	NC_016052	CCT	2	6	2443400	2443405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58517	NC_016052	ATG	2	6	2443756	2443761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58518	NC_016052	GCT	2	6	2443762	2443767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58519	NC_016052	CCT	2	6	2443803	2443808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58520	NC_016052	ACAT	2	8	2443819	2443826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58521	NC_016052	TGG	2	6	2443841	2443846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58522	NC_016052	CGA	2	6	2443865	2443870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58523	NC_016052	TCAC	2	8	2443880	2443887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58524	NC_016052	CAAT	2	8	2443906	2443913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58525	NC_016052	CAT	2	6	2443981	2443986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58526	NC_016052	GA	3	6	2444020	2444025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58527	NC_016052	ACGT	2	8	2444090	2444097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58528	NC_016052	TCC	2	6	2444106	2444111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58529	NC_016052	GCCA	2	8	2444238	2444245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58530	NC_016052	TCC	2	6	2444424	2444429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58531	NC_016052	CGT	2	6	2444457	2444462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58532	NC_016052	CGG	2	6	2444519	2444524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58533	NC_016052	TCGC	2	8	2444617	2444624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58534	NC_016052	TTTTTC	2	12	2444643	2444654	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58535	NC_016052	CTA	2	6	2444664	2444669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58536	NC_016052	CTTA	2	8	2444779	2444786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58537	NC_016052	CCG	2	6	2444848	2444853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58538	NC_016052	CTTA	2	8	2444864	2444871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58539	NC_016052	TGCT	2	8	2444909	2444916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58540	NC_016052	A	6	6	2444959	2444964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58541	NC_016052	TTG	2	6	2444997	2445002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58542	NC_016052	CAAA	2	8	2445028	2445035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58543	NC_016052	ATCG	2	8	2445045	2445052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58544	NC_016052	CCT	2	6	2445084	2445089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58545	NC_016052	AGG	2	6	2445200	2445205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58546	NC_016052	GGC	2	6	2445274	2445279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58547	NC_016052	GTG	2	6	2445328	2445333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58548	NC_016052	GT	3	6	2445343	2445348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58549	NC_016052	GA	3	6	2445444	2445449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58550	NC_016052	GC	3	6	2445483	2445488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58551	NC_016052	GT	3	6	2445513	2445518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58552	NC_016052	ATG	2	6	2445538	2445543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58553	NC_016052	TCC	2	6	2445564	2445569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58554	NC_016052	CACGA	2	10	2445663	2445672	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58555	NC_016052	GAC	2	6	2445676	2445681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58556	NC_016052	CAC	2	6	2445689	2445694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58557	NC_016052	TTC	2	6	2445764	2445769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58558	NC_016052	GCA	2	6	2445883	2445888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58559	NC_016052	AG	3	6	2446003	2446008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58560	NC_016052	TCC	2	6	2446028	2446033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58561	NC_016052	AT	3	6	2446034	2446039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58562	NC_016052	CTC	2	6	2446074	2446079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58563	NC_016052	GCT	2	6	2446218	2446223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58564	NC_016052	ACA	2	6	2446301	2446306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58565	NC_016052	CTT	2	6	2446327	2446332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58566	NC_016052	CTG	2	6	2446386	2446391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58567	NC_016052	GCCA	2	8	2446511	2446518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58568	NC_016052	CTTT	2	8	2446546	2446553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58569	NC_016052	A	7	7	2446560	2446566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58570	NC_016052	A	6	6	2446662	2446667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58571	NC_016052	TCT	2	6	2446676	2446681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58572	NC_016052	AGC	2	6	2446684	2446689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58573	NC_016052	CGC	2	6	2446713	2446718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58574	NC_016052	GATC	2	8	2446762	2446769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58575	NC_016052	CTTA	2	8	2446782	2446789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58576	NC_016052	GTT	2	6	2446813	2446818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58577	NC_016052	CTT	3	9	2446838	2446846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58578	NC_016052	AAG	2	6	2446850	2446855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58579	NC_016052	TGCT	2	8	2446877	2446884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58580	NC_016052	TTG	2	6	2446911	2446916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58581	NC_016052	AAC	2	6	2446921	2446926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58582	NC_016052	TTTTA	2	10	2446985	2446994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58583	NC_016052	TTA	2	6	2447005	2447010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58584	NC_016052	T	6	6	2447022	2447027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58585	NC_016052	A	6	6	2447040	2447045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58586	NC_016052	ACG	2	6	2447057	2447062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58587	NC_016052	A	7	7	2447110	2447116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58589	NC_016052	T	6	6	2447230	2447235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58590	NC_016052	CAT	2	6	2447252	2447257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58591	NC_016052	A	7	7	2447258	2447264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58592	NC_016052	T	6	6	2447284	2447289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58593	NC_016052	AAC	2	6	2447343	2447348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518621
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58596	NC_016052	CTT	2	6	2447591	2447596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518621
58597	NC_016052	GA	3	6	2447605	2447610	50 %	0 %	50 %	0 %	352518621
58598	NC_016052	GTT	2	6	2447641	2447646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352518621
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58603	NC_016052	CTTG	2	8	2447745	2447752	0 %	50 %	25 %	25 %	352518621
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58606	NC_016052	GT	3	6	2448119	2448124	0 %	50 %	50 %	0 %	352518621
58607	NC_016052	TGC	2	6	2448137	2448142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518621
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58614	NC_016052	ATT	2	6	2448411	2448416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518621
58615	NC_016052	T	6	6	2448452	2448457	0 %	100 %	0 %	0 %	352518621
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58622	NC_016052	A	8	8	2448837	2448844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58623	NC_016052	T	6	6	2448872	2448877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58624	NC_016052	AAT	2	6	2448922	2448927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58625	NC_016052	TTC	2	6	2448937	2448942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518622
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58627	NC_016052	T	6	6	2448952	2448957	0 %	100 %	0 %	0 %	352518622
58628	NC_016052	TTA	2	6	2448992	2448997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518622
58629	NC_016052	AACA	2	8	2449008	2449015	75 %	0 %	0 %	25 %	352518622
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58648	NC_016052	TTTA	2	8	2449865	2449872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58739	NC_016052	TTTG	2	8	2453526	2453533	0 %	75 %	25 %	0 %	352518625
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58979	NC_016052	AACA	2	8	2462644	2462651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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58981	NC_016052	T	6	6	2462692	2462697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58982	NC_016052	AGT	2	6	2462738	2462743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58983	NC_016052	TGA	2	6	2462744	2462749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58984	NC_016052	GTA	2	6	2462778	2462783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58985	NC_016052	ATT	3	9	2462803	2462811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58986	NC_016052	TAA	2	6	2462817	2462822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58987	NC_016052	ATTT	2	8	2462869	2462876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58988	NC_016052	GTA	2	6	2462966	2462971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518633
58989	NC_016052	G	6	6	2462987	2462992	0 %	0 %	100 %	0 %	352518633
58990	NC_016052	GTA	2	6	2463003	2463008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518633
58991	NC_016052	ATT	2	6	2463012	2463017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518633
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58993	NC_016052	ATG	2	6	2463087	2463092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518633
58994	NC_016052	ATG	2	6	2463108	2463113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518633
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