MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_016052	AAG	2	6	2293934	2293939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55002	NC_016052	ACG	2	6	2294131	2294136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518462
55003	NC_016052	CCT	2	6	2294174	2294179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352518462
55004	NC_016052	ACG	2	6	2294182	2294187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518462
55005	NC_016052	TA	4	8	2294364	2294371	50 %	50 %	0 %	0 %	352518462
55006	NC_016052	TCC	2	6	2294426	2294431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55007	NC_016052	TATT	2	8	2294451	2294458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55008	NC_016052	ATT	3	9	2294456	2294464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518463
55009	NC_016052	CTT	2	6	2294472	2294477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518463
55010	NC_016052	CAC	2	6	2294534	2294539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352518463
55011	NC_016052	ACC	2	6	2294580	2294585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352518463
55012	NC_016052	T	6	6	2294703	2294708	0 %	100 %	0 %	0 %	352518463
55013	NC_016052	GTC	2	6	2294764	2294769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518463
55014	NC_016052	TTTC	2	8	2294772	2294779	0 %	75 %	0 %	25 %	352518463
55015	NC_016052	CCT	2	6	2294885	2294890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55016	NC_016052	CA	3	6	2294910	2294915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55017	NC_016052	GGT	2	6	2294920	2294925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55018	NC_016052	T	7	7	2294928	2294934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55019	NC_016052	A	6	6	2294940	2294945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55020	NC_016052	T	6	6	2295078	2295083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55021	NC_016052	A	6	6	2295154	2295159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55022	NC_016052	AGC	2	6	2295205	2295210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518464
55023	NC_016052	GAT	2	6	2295229	2295234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518464
55024	NC_016052	TTA	2	6	2295262	2295267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518464
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55027	NC_016052	A	7	7	2295343	2295349	100 %	0 %	0 %	0 %	352518464
55028	NC_016052	AGA	2	6	2295355	2295360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352518464
55029	NC_016052	ATCAA	2	10	2295374	2295383	60 %	20 %	0 %	20 %	352518464
55030	NC_016052	ATC	2	6	2295410	2295415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518464
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55032	NC_016052	TCG	2	6	2295489	2295494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518464
55033	NC_016052	TGA	2	6	2295526	2295531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518464
55034	NC_016052	CAG	2	6	2295593	2295598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518464
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55036	NC_016052	ATC	2	6	2295689	2295694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518464
55037	NC_016052	A	8	8	2295706	2295713	100 %	0 %	0 %	0 %	352518464
55038	NC_016052	GAT	2	6	2295716	2295721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518464
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55040	NC_016052	TATT	2	8	2295870	2295877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55041	NC_016052	A	6	6	2295909	2295914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55042	NC_016052	T	7	7	2295978	2295984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55043	NC_016052	AATT	2	8	2295992	2295999	50 %	50 %	0 %	0 %	352518465
55044	NC_016052	AGA	2	6	2296083	2296088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352518465
55045	NC_016052	AAG	2	6	2296115	2296120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352518465
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55048	NC_016052	AAAC	2	8	2296272	2296279	75 %	0 %	0 %	25 %	352518465
55049	NC_016052	CGT	2	6	2296324	2296329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518465
55050	NC_016052	TCG	2	6	2296371	2296376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518465
55051	NC_016052	TGG	2	6	2296407	2296412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352518465
55052	NC_016052	GCA	2	6	2296504	2296509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518465
55053	NC_016052	TGA	3	9	2296557	2296565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518465
55054	NC_016052	ACG	2	6	2296616	2296621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518465
55055	NC_016052	ATT	2	6	2296643	2296648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518465
55056	NC_016052	TAA	2	6	2296651	2296656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518465
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55058	NC_016052	T	6	6	2296698	2296703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55059	NC_016052	ATG	2	6	2296715	2296720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518466
55060	NC_016052	CGT	2	6	2296754	2296759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518466
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55085	NC_016052	AGCT	2	8	2298101	2298108	25 %	25 %	25 %	25 %	352518467
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55091	NC_016052	TCA	2	6	2298306	2298311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55101	NC_016052	ATT	2	6	2298494	2298499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55120	NC_016052	CTT	2	6	2299333	2299338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518469
55121	NC_016052	T	6	6	2299351	2299356	0 %	100 %	0 %	0 %	352518469
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55126	NC_016052	CTCA	2	8	2299604	2299611	25 %	25 %	0 %	50 %	352518469
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55213	NC_016052	AAAC	2	8	2303845	2303852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55214	NC_016052	T	6	6	2303885	2303890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55215	NC_016052	TTTATT	2	12	2303933	2303944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55217	NC_016052	A	6	6	2303950	2303955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55218	NC_016052	CGA	2	6	2303983	2303988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55221	NC_016052	CTT	2	6	2304057	2304062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518473
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55224	NC_016052	TCT	3	9	2304236	2304244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518473
55225	NC_016052	CAT	2	6	2304246	2304251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518473
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55232	NC_016052	ATC	2	6	2304673	2304678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518473
55233	NC_016052	ATT	2	6	2304703	2304708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518473
55234	NC_016052	CGT	2	6	2304840	2304845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518473
55235	NC_016052	ATT	2	6	2304859	2304864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518473
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55338	NC_016052	T	7	7	2309400	2309406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55339	NC_016052	TATTT	2	10	2309424	2309433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55352	NC_016052	ATC	2	6	2310043	2310048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518479
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55476	NC_016052	AT	3	6	2315458	2315463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55477	NC_016052	TTC	2	6	2315468	2315473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55478	NC_016052	AATC	2	8	2315504	2315511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55479	NC_016052	T	6	6	2315563	2315568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55480	NC_016052	CAA	2	6	2315595	2315600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55481	NC_016052	GAC	2	6	2315612	2315617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55482	NC_016052	TTG	2	6	2315676	2315681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55483	NC_016052	GATAA	2	10	2315793	2315802	60 %	20 %	20 %	0 %	352518486
55484	NC_016052	T	7	7	2315831	2315837	0 %	100 %	0 %	0 %	352518486
55485	NC_016052	ATA	2	6	2315839	2315844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518486
55486	NC_016052	CAT	2	6	2315888	2315893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518486
55487	NC_016052	AT	3	6	2315915	2315920	50 %	50 %	0 %	0 %	352518486
55488	NC_016052	TA	3	6	2315975	2315980	50 %	50 %	0 %	0 %	352518486
55489	NC_016052	TTCAAT	2	12	2315988	2315999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	352518486
55490	NC_016052	TTA	2	6	2316082	2316087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55491	NC_016052	TA	3	6	2316113	2316118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55492	NC_016052	T	6	6	2316146	2316151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55493	NC_016052	TTG	2	6	2316182	2316187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55494	NC_016052	CTA	2	6	2316205	2316210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55495	NC_016052	AAT	2	6	2316222	2316227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55496	NC_016052	T	6	6	2316274	2316279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55497	NC_016052	CCT	2	6	2316310	2316315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55498	NC_016052	TAT	2	6	2316327	2316332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55499	NC_016052	TCT	2	6	2316388	2316393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518487
55500	NC_016052	GCA	2	6	2316412	2316417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518487

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