MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016052	A	7	7	203703	203709	100 %	0 %	0 %	0 %	352516356
5003	NC_016052	T	6	6	203851	203856	0 %	100 %	0 %	0 %	352516356
5004	NC_016052	TA	3	6	203859	203864	50 %	50 %	0 %	0 %	352516356
5005	NC_016052	TTA	2	6	203876	203881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516356
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5007	NC_016052	TCA	2	6	203925	203930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516356
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5009	NC_016052	ACTT	2	8	203962	203969	25 %	50 %	0 %	25 %	352516356
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5011	NC_016052	TGA	2	6	204086	204091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516356
5012	NC_016052	ATC	2	6	204115	204120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516356
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5014	NC_016052	TCT	2	6	204239	204244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_016052	ATAA	2	8	204262	204269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016052	TAAT	2	8	204283	204290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016052	TTG	2	6	204291	204296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016052	TTG	2	6	204377	204382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016052	A	7	7	204487	204493	100 %	0 %	0 %	0 %	352516357
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5021	NC_016052	A	7	7	204605	204611	100 %	0 %	0 %	0 %	352516358
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5028	NC_016052	GAA	2	6	204954	204959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5031	NC_016052	A	6	6	205026	205031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5041	NC_016052	TAG	2	6	205429	205434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516359
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5047	NC_016052	GATCG	2	10	205566	205575	20 %	20 %	40 %	20 %	352516359
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5057	NC_016052	TGA	2	6	205969	205974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516360
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5083	NC_016052	TATT	2	8	207330	207337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_016052	ATC	2	6	207793	207798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516364
5099	NC_016052	TTG	2	6	207804	207809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516364
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5105	NC_016052	AT	3	6	208163	208168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016052	AGG	2	6	208171	208176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_016052	TA	3	6	208179	208184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_016052	TA	3	6	208242	208247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016052	GTA	2	6	208287	208292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016052	TTTAT	2	10	208343	208352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016052	AG	3	6	208359	208364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_016052	CAA	2	6	208383	208388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_016052	AG	3	6	208418	208423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016052	TTAT	2	8	208477	208484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016052	ATA	2	6	208516	208521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_016052	A	6	6	208567	208572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016052	TA	3	6	208582	208587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5124	NC_016052	AGAGA	2	10	208727	208736	60 %	0 %	40 %	0 %	352516365
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5127	NC_016052	A	7	7	208838	208844	100 %	0 %	0 %	0 %	352516365
5128	NC_016052	A	6	6	208846	208851	100 %	0 %	0 %	0 %	352516365
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5130	NC_016052	GGA	2	6	208998	209003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352516365
5131	NC_016052	CGTTT	2	10	209101	209110	0 %	60 %	20 %	20 %	352516365
5132	NC_016052	TA	3	6	209147	209152	50 %	50 %	0 %	0 %	352516365
5133	NC_016052	TGAA	2	8	209174	209181	50 %	25 %	25 %	0 %	352516365
5134	NC_016052	GAT	2	6	209196	209201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516365
5135	NC_016052	TA	3	6	209209	209214	50 %	50 %	0 %	0 %	352516365
5136	NC_016052	AAATGA	2	12	209352	209363	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	352516365
5137	NC_016052	CTT	2	6	209498	209503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516365
5138	NC_016052	A	6	6	209548	209553	100 %	0 %	0 %	0 %	352516365
5139	NC_016052	CGT	2	6	209701	209706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516365
5140	NC_016052	AGC	2	6	209871	209876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516365
5141	NC_016052	T	6	6	209893	209898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_016052	T	6	6	209948	209953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_016052	TAAATC	2	12	209995	210006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	352516366
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5145	NC_016052	CTA	2	6	210127	210132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516366
5146	NC_016052	CTA	2	6	210235	210240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516366
5147	NC_016052	TGC	2	6	210309	210314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516366
5148	NC_016052	GCTG	2	8	210323	210330	0 %	25 %	50 %	25 %	352516366
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5151	NC_016052	ATT	2	6	210413	210418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516366
5152	NC_016052	CTG	2	6	210442	210447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516366
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5154	NC_016052	T	7	7	210653	210659	0 %	100 %	0 %	0 %	352516366
5155	NC_016052	TCG	2	6	210708	210713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516366
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5160	NC_016052	TAT	2	6	210933	210938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516367
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5162	NC_016052	T	8	8	211060	211067	0 %	100 %	0 %	0 %	352516367
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5167	NC_016052	T	8	8	211303	211310	0 %	100 %	0 %	0 %	352516367
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5175	NC_016052	T	6	6	211577	211582	0 %	100 %	0 %	0 %	352516367
5176	NC_016052	T	6	6	211592	211597	0 %	100 %	0 %	0 %	352516367
5177	NC_016052	TCC	2	6	211619	211624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5178	NC_016052	ATC	2	6	211678	211683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516368
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5200	NC_016052	TAG	3	9	212644	212652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516368
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5202	NC_016052	TAA	2	6	212699	212704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5203	NC_016052	GT	4	8	212716	212723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5204	NC_016052	CTA	2	6	212759	212764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516369
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5210	NC_016052	TAATT	2	10	212978	212987	40 %	60 %	0 %	0 %	352516369
5211	NC_016052	TA	3	6	212994	212999	50 %	50 %	0 %	0 %	352516369
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5219	NC_016052	GTAA	2	8	213246	213253	50 %	25 %	25 %	0 %	352516369
5220	NC_016052	TGC	2	6	213258	213263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516369
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5225	NC_016052	A	6	6	213412	213417	100 %	0 %	0 %	0 %	352516369
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5228	NC_016052	T	6	6	213485	213490	0 %	100 %	0 %	0 %	352516369
5229	NC_016052	AAT	2	6	213534	213539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516369
5230	NC_016052	ATT	2	6	213578	213583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_016052	ATCTG	2	10	213848	213857	20 %	40 %	20 %	20 %	352516370
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5240	NC_016052	CTT	2	6	214449	214454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516370
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5243	NC_016052	T	6	6	214510	214515	0 %	100 %	0 %	0 %	352516370
5244	NC_016052	GAA	3	9	214755	214763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516370
5245	NC_016052	TCA	2	6	214791	214796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516370
5246	NC_016052	T	6	6	214813	214818	0 %	100 %	0 %	0 %	352516370
5247	NC_016052	TGA	2	6	214853	214858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516370
5248	NC_016052	A	6	6	214884	214889	100 %	0 %	0 %	0 %	352516370
5249	NC_016052	AAGG	2	8	214952	214959	50 %	0 %	50 %	0 %	352516370
5250	NC_016052	A	6	6	215110	215115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_016052	AAG	2	6	215119	215124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_016052	T	7	7	215171	215177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_016052	AGT	2	6	215192	215197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_016052	AATT	2	8	215214	215221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_016052	T	8	8	215220	215227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_016052	AAAC	2	8	215228	215235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5257	NC_016052	ATT	2	6	215283	215288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_016052	T	6	6	215287	215292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_016052	A	6	6	215360	215365	100 %	0 %	0 %	0 %	352516371
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5271	NC_016052	TTC	2	6	215980	215985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5272	NC_016052	T	6	6	216039	216044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_016052	T	6	6	216074	216079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5274	NC_016052	T	7	7	216121	216127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5281	NC_016052	GAAA	2	8	216439	216446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_016052	T	6	6	216478	216483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5284	NC_016052	TTC	2	6	216576	216581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5478	NC_016052	CTT	2	6	225207	225212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516384
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5483	NC_016052	TTTA	2	8	225466	225473	25 %	75 %	0 %	0 %	352516384
5484	NC_016052	GCT	2	6	225560	225565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516384
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5490	NC_016052	TGT	2	6	225886	225891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516384
5491	NC_016052	TCCACT	2	12	225895	225906	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	352516384
5492	NC_016052	TCG	2	6	225956	225961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516384
5493	NC_016052	T	6	6	225967	225972	0 %	100 %	0 %	0 %	352516384
5494	NC_016052	TCAA	2	8	226007	226014	50 %	25 %	0 %	25 %	352516384
5495	NC_016052	T	7	7	226032	226038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_016052	TATAT	2	10	226050	226059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_016052	A	6	6	226077	226082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_016052	ACA	2	6	226084	226089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5499	NC_016052	A	6	6	226099	226104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_016052	TGAT	2	8	226136	226143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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