MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54239	NC_016052	T	6	6	2259722	2259727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54243	NC_016052	ATTTTT	2	12	2259848	2259859	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	352518414
54244	NC_016052	TG	3	6	2259868	2259873	0 %	50 %	50 %	0 %	352518414
54245	NC_016052	ATAA	2	8	2259878	2259885	75 %	25 %	0 %	0 %	352518414
54246	NC_016052	AT	3	6	2259921	2259926	50 %	50 %	0 %	0 %	352518414
54247	NC_016052	CTTT	2	8	2259950	2259957	0 %	75 %	0 %	25 %	352518414
54248	NC_016052	CAC	2	6	2259963	2259968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352518414
54249	NC_016052	ATA	2	6	2260013	2260018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518414
54250	NC_016052	CAAA	2	8	2260050	2260057	75 %	0 %	0 %	25 %	352518414
54251	NC_016052	TAG	2	6	2260071	2260076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518414
54252	NC_016052	GATT	2	8	2260166	2260173	25 %	50 %	25 %	0 %	352518414
54253	NC_016052	CCT	2	6	2260184	2260189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54254	NC_016052	CTT	2	6	2260237	2260242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54255	NC_016052	ATT	2	6	2260243	2260248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54256	NC_016052	ACA	2	6	2260272	2260277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54257	NC_016052	CTT	2	6	2260391	2260396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518415
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54259	NC_016052	CAA	2	6	2260408	2260413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518415
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54261	NC_016052	ATC	2	6	2260524	2260529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518415
54262	NC_016052	T	6	6	2260591	2260596	0 %	100 %	0 %	0 %	352518415
54263	NC_016052	A	6	6	2260653	2260658	100 %	0 %	0 %	0 %	352518415
54264	NC_016052	AAT	2	6	2260685	2260690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518415
54265	NC_016052	CCT	2	6	2260728	2260733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54266	NC_016052	ACC	2	6	2260737	2260742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54272	NC_016052	TTTG	2	8	2261053	2261060	0 %	75 %	25 %	0 %	352518416
54273	NC_016052	TGGG	2	8	2261064	2261071	0 %	25 %	75 %	0 %	352518416
54274	NC_016052	ATT	2	6	2261110	2261115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518416
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54279	NC_016052	TA	3	6	2261273	2261278	50 %	50 %	0 %	0 %	352518416
54280	NC_016052	ACTTGT	2	12	2261514	2261525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	352518416
54281	NC_016052	TTG	2	6	2261533	2261538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54282	NC_016052	A	6	6	2261565	2261570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54283	NC_016052	TGTT	2	8	2261651	2261658	0 %	75 %	25 %	0 %	352518417
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54310	NC_016052	TTC	2	6	2262817	2262822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54332	NC_016052	CATT	2	8	2263853	2263860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54333	NC_016052	TCA	2	6	2263952	2263957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54334	NC_016052	CTTT	2	8	2263966	2263973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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54353	NC_016052	CTT	2	6	2264916	2264921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54354	NC_016052	TTA	2	6	2264926	2264931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54355	NC_016052	T	6	6	2264956	2264961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54356	NC_016052	T	6	6	2265069	2265074	0 %	100 %	0 %	0 %	352518422
54357	NC_016052	A	7	7	2265077	2265083	100 %	0 %	0 %	0 %	352518422
54358	NC_016052	ATG	2	6	2265094	2265099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518422
54359	NC_016052	T	6	6	2265117	2265122	0 %	100 %	0 %	0 %	352518422
54360	NC_016052	TAT	2	6	2265177	2265182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518422
54361	NC_016052	CAT	2	6	2265275	2265280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518422
54362	NC_016052	CTTT	2	8	2265291	2265298	0 %	75 %	0 %	25 %	352518422
54363	NC_016052	TTA	2	6	2265309	2265314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518422
54364	NC_016052	AGG	2	6	2265318	2265323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352518422
54365	NC_016052	T	6	6	2265346	2265351	0 %	100 %	0 %	0 %	352518422
54366	NC_016052	T	6	6	2265381	2265386	0 %	100 %	0 %	0 %	352518422
54367	NC_016052	TTAA	2	8	2265391	2265398	50 %	50 %	0 %	0 %	352518422
54368	NC_016052	TTA	2	6	2265524	2265529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518422
54369	NC_016052	TA	4	8	2265544	2265551	50 %	50 %	0 %	0 %	352518422
54370	NC_016052	ATT	2	6	2265562	2265567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518422
54371	NC_016052	TTAT	2	8	2265610	2265617	25 %	75 %	0 %	0 %	352518422
54372	NC_016052	T	6	6	2265671	2265676	0 %	100 %	0 %	0 %	352518422
54373	NC_016052	A	7	7	2265724	2265730	100 %	0 %	0 %	0 %	352518422
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54377	NC_016052	GAA	2	6	2265823	2265828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352518422
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54379	NC_016052	TTTA	2	8	2265934	2265941	25 %	75 %	0 %	0 %	352518422
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54383	NC_016052	GAAA	2	8	2266002	2266009	75 %	0 %	25 %	0 %	352518422
54384	NC_016052	A	6	6	2266007	2266012	100 %	0 %	0 %	0 %	352518422
54385	NC_016052	ATGC	2	8	2266087	2266094	25 %	25 %	25 %	25 %	352518422
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54389	NC_016052	A	7	7	2266347	2266353	100 %	0 %	0 %	0 %	352518422
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54400	NC_016052	CAA	2	6	2267108	2267113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518422
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54403	NC_016052	TTTC	2	8	2267270	2267277	0 %	75 %	0 %	25 %	352518422
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54415	NC_016052	TTAA	2	8	2267652	2267659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54416	NC_016052	T	7	7	2267697	2267703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54417	NC_016052	T	7	7	2267706	2267712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54418	NC_016052	TAT	2	6	2267723	2267728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54420	NC_016052	A	6	6	2267811	2267816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54421	NC_016052	T	7	7	2267819	2267825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54422	NC_016052	GAT	2	6	2267882	2267887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518423
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54446	NC_016052	TAAAC	2	10	2269196	2269205	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54447	NC_016052	TAAA	2	8	2269269	2269276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54452	NC_016052	A	6	6	2269456	2269461	100 %	0 %	0 %	0 %	352518424
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54465	NC_016052	T	6	6	2269910	2269915	0 %	100 %	0 %	0 %	352518424
54466	NC_016052	T	6	6	2269937	2269942	0 %	100 %	0 %	0 %	352518424
54467	NC_016052	CAT	2	6	2270003	2270008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518424
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54470	NC_016052	CCT	2	6	2270042	2270047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54471	NC_016052	A	7	7	2270052	2270058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54472	NC_016052	TGT	2	6	2270086	2270091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54473	NC_016052	T	6	6	2270176	2270181	0 %	100 %	0 %	0 %	352518425
54474	NC_016052	TAAA	2	8	2270189	2270196	75 %	25 %	0 %	0 %	352518425
54475	NC_016052	A	6	6	2270211	2270216	100 %	0 %	0 %	0 %	352518425
54476	NC_016052	TCTT	2	8	2270241	2270248	0 %	75 %	0 %	25 %	352518425
54477	NC_016052	GTCC	2	8	2270274	2270281	0 %	25 %	25 %	50 %	352518425
54478	NC_016052	CTC	2	6	2270284	2270289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352518425
54479	NC_016052	ATC	2	6	2270324	2270329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518425
54480	NC_016052	AGC	2	6	2270364	2270369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518425
54481	NC_016052	T	6	6	2270386	2270391	0 %	100 %	0 %	0 %	352518425
54482	NC_016052	GTT	2	6	2270586	2270591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352518425
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