MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 61384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_016052	ATT	2	6	2230390	2230395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518386
53502	NC_016052	CA	3	6	2230520	2230525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53503	NC_016052	TGA	2	6	2230541	2230546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53504	NC_016052	ATC	2	6	2230563	2230568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53505	NC_016052	ATTA	2	8	2230580	2230587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53506	NC_016052	AAC	2	6	2230612	2230617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53507	NC_016052	TAT	2	6	2230633	2230638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53508	NC_016052	TGA	2	6	2230676	2230681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53509	NC_016052	CAA	2	6	2230743	2230748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53510	NC_016052	AT	3	6	2230778	2230783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53511	NC_016052	TAA	2	6	2230898	2230903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518387
53512	NC_016052	GT	3	6	2230909	2230914	0 %	50 %	50 %	0 %	352518387
53513	NC_016052	T	7	7	2230914	2230920	0 %	100 %	0 %	0 %	352518387
53514	NC_016052	TAACAG	2	12	2231047	2231058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	352518387
53515	NC_016052	CAC	2	6	2231063	2231068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352518387
53516	NC_016052	GTT	2	6	2231091	2231096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352518387
53517	NC_016052	T	6	6	2231116	2231121	0 %	100 %	0 %	0 %	352518387
53518	NC_016052	TACT	2	8	2231169	2231176	25 %	50 %	0 %	25 %	352518387
53519	NC_016052	CTA	2	6	2231240	2231245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518387
53520	NC_016052	TAT	2	6	2231314	2231319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518387
53521	NC_016052	ACA	2	6	2231345	2231350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518387
53522	NC_016052	T	6	6	2231408	2231413	0 %	100 %	0 %	0 %	352518387
53523	NC_016052	TGA	2	6	2231464	2231469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518387
53524	NC_016052	CTT	2	6	2231494	2231499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518387
53525	NC_016052	ATT	2	6	2231609	2231614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518387
53526	NC_016052	CAA	2	6	2231622	2231627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518387
53527	NC_016052	ATG	2	6	2231649	2231654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518387
53528	NC_016052	A	6	6	2231694	2231699	100 %	0 %	0 %	0 %	352518387
53529	NC_016052	A	6	6	2231703	2231708	100 %	0 %	0 %	0 %	352518387
53530	NC_016052	ATT	2	6	2231717	2231722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518387
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53532	NC_016052	AAAG	2	8	2231738	2231745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53533	NC_016052	TCGT	2	8	2231815	2231822	0 %	50 %	25 %	25 %	352518388
53534	NC_016052	AAAC	2	8	2231914	2231921	75 %	0 %	0 %	25 %	352518388
53535	NC_016052	TTA	2	6	2231929	2231934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518388
53536	NC_016052	TAT	2	6	2231951	2231956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518388
53537	NC_016052	CTTT	2	8	2232108	2232115	0 %	75 %	0 %	25 %	352518388
53538	NC_016052	AGG	2	6	2232223	2232228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352518388
53539	NC_016052	A	7	7	2232239	2232245	100 %	0 %	0 %	0 %	352518389
53540	NC_016052	T	7	7	2232284	2232290	0 %	100 %	0 %	0 %	352518389
53541	NC_016052	CTA	2	6	2232327	2232332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518389
53542	NC_016052	GA	3	6	2232333	2232338	50 %	0 %	50 %	0 %	352518389
53543	NC_016052	T	6	6	2232412	2232417	0 %	100 %	0 %	0 %	352518389
53544	NC_016052	TGA	2	6	2232490	2232495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518389
53545	NC_016052	CATG	2	8	2232499	2232506	25 %	25 %	25 %	25 %	352518389
53546	NC_016052	TAT	3	9	2232529	2232537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518389
53547	NC_016052	AATC	2	8	2232592	2232599	50 %	25 %	0 %	25 %	352518389
53548	NC_016052	A	7	7	2232611	2232617	100 %	0 %	0 %	0 %	352518389
53549	NC_016052	A	6	6	2232622	2232627	100 %	0 %	0 %	0 %	352518389
53550	NC_016052	AT	3	6	2232642	2232647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53551	NC_016052	ATA	2	6	2232665	2232670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53552	NC_016052	TCT	2	6	2232678	2232683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53553	NC_016052	TTTA	2	8	2232707	2232714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53554	NC_016052	TAAC	2	8	2232746	2232753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53555	NC_016052	A	7	7	2232757	2232763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53556	NC_016052	CAG	2	6	2232806	2232811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518390
53557	NC_016052	GCT	2	6	2232818	2232823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518390
53558	NC_016052	TAT	2	6	2232835	2232840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518390
53559	NC_016052	T	6	6	2232846	2232851	0 %	100 %	0 %	0 %	352518390
53560	NC_016052	ATT	2	6	2232857	2232862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518390
53561	NC_016052	CGT	2	6	2232874	2232879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518390
53562	NC_016052	TAT	2	6	2232901	2232906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518390
53563	NC_016052	TTA	2	6	2232923	2232928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518390
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53570	NC_016052	GCT	2	6	2233208	2233213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518390
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53580	NC_016052	T	6	6	2233651	2233656	0 %	100 %	0 %	0 %	352518391
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53585	NC_016052	T	6	6	2233893	2233898	0 %	100 %	0 %	0 %	352518391
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53602	NC_016052	T	6	6	2234702	2234707	0 %	100 %	0 %	0 %	352518392
53603	NC_016052	A	7	7	2234712	2234718	100 %	0 %	0 %	0 %	352518392
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53858	NC_016052	GTA	2	6	2244137	2244142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518401
53859	NC_016052	TCA	2	6	2244151	2244156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518401
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53959	NC_016052	A	6	6	2248353	2248358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53961	NC_016052	A	7	7	2248378	2248384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53962	NC_016052	GATC	2	8	2248400	2248407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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53969	NC_016052	T	6	6	2248736	2248741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53970	NC_016052	CATTA	2	10	2248768	2248777	40 %	40 %	0 %	20 %	352518404
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53993	NC_016052	T	6	6	2249648	2249653	0 %	100 %	0 %	0 %	352518404
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53997	NC_016052	A	6	6	2249842	2249847	100 %	0 %	0 %	0 %	352518405
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53999	NC_016052	AAGC	3	12	2249877	2249888	50 %	0 %	25 %	25 %	352518405
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