MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016051	GAG	2	6	205291	205296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525715
4002	NC_016051	CTGAT	2	10	205338	205347	20 %	40 %	20 %	20 %	350525715
4003	NC_016051	CCCA	2	8	205649	205656	25 %	0 %	0 %	75 %	350525715
4004	NC_016051	GT	3	6	205657	205662	0 %	50 %	50 %	0 %	350525715
4005	NC_016051	CAA	2	6	205833	205838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350525715
4006	NC_016051	CCG	2	6	205841	205846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525715
4007	NC_016051	TCC	2	6	205897	205902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525715
4008	NC_016051	CAC	2	6	206041	206046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525715
4009	NC_016051	ATT	2	6	206165	206170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016051	CCA	2	6	206172	206177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_016051	GAGAA	2	10	206248	206257	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016051	ACA	2	6	206267	206272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_016051	TGC	2	6	206273	206278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_016051	TGG	2	6	206288	206293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016051	GCG	2	6	206334	206339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_016051	GCCC	2	8	206362	206369	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4017	NC_016051	GGA	2	6	206377	206382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016051	TCC	2	6	206444	206449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_016051	AG	4	8	206473	206480	50 %	0 %	50 %	0 %	223478709
4020	NC_016051	CTC	2	6	206502	206507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478709
4021	NC_016051	GTTC	2	8	206555	206562	0 %	50 %	25 %	25 %	223478709
4022	NC_016051	GGA	2	6	206576	206581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478709
4023	NC_016051	CTC	2	6	206682	206687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478709
4024	NC_016051	AAT	2	6	206720	206725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478709
4025	NC_016051	GAG	2	6	206736	206741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478709
4026	NC_016051	GAGAA	2	10	206871	206880	60 %	0 %	40 %	0 %	223478709
4027	NC_016051	GA	3	6	206961	206966	50 %	0 %	50 %	0 %	223478709
4028	NC_016051	CTC	2	6	207042	207047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478709
4029	NC_016051	GAG	2	6	207108	207113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478709
4030	NC_016051	CGT	2	6	207140	207145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478709
4031	NC_016051	GAGG	2	8	207236	207243	25 %	0 %	75 %	0 %	223478709
4032	NC_016051	GTT	2	6	207270	207275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478709
4033	NC_016051	ACT	2	6	207277	207282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478709
4034	NC_016051	GGA	3	9	207296	207304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478709
4035	NC_016051	GGA	2	6	207379	207384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478709
4036	NC_016051	TA	4	8	207486	207493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016051	GAG	2	6	207519	207524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478451
4038	NC_016051	GAG	2	6	207620	207625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478451
4039	NC_016051	CGA	2	6	207668	207673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478451
4040	NC_016051	TCG	2	6	207772	207777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478451
4041	NC_016051	CCT	2	6	207857	207862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478451
4042	NC_016051	TC	3	6	207908	207913	0 %	50 %	0 %	50 %	223478451
4043	NC_016051	TTC	2	6	208090	208095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478451
4044	NC_016051	GA	3	6	208109	208114	50 %	0 %	50 %	0 %	223478451
4045	NC_016051	CTC	2	6	208116	208121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478451
4046	NC_016051	ACA	2	6	208177	208182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478451
4047	NC_016051	CTCCA	2	10	208245	208254	20 %	20 %	0 %	60 %	223478451
4048	NC_016051	GAA	2	6	208364	208369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478451
4049	NC_016051	CTC	2	6	208377	208382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478451
4050	NC_016051	CTT	2	6	208413	208418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478451
4051	NC_016051	GGCC	2	8	208484	208491	0 %	0 %	50 %	50 %	223478451
4052	NC_016051	GAG	2	6	208503	208508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478451
4053	NC_016051	TTC	2	6	208512	208517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478451
4054	NC_016051	GAG	2	6	208563	208568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478451
4055	NC_016051	CGT	2	6	208801	208806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478761
4056	NC_016051	CTCG	2	8	208849	208856	0 %	25 %	25 %	50 %	223478761
4057	NC_016051	CCTG	2	8	208857	208864	0 %	25 %	25 %	50 %	223478761
4058	NC_016051	CGA	2	6	208908	208913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478761
4059	NC_016051	GAC	2	6	209068	209073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478761
4060	NC_016051	AGT	2	6	209157	209162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478761
4061	NC_016051	TTC	2	6	209207	209212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478761
4062	NC_016051	TCG	2	6	209214	209219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478761
4063	NC_016051	GTC	2	6	209272	209277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478761
4064	NC_016051	TCGC	2	8	209294	209301	0 %	25 %	25 %	50 %	223478761
4065	NC_016051	TCT	2	6	209304	209309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478761
4066	NC_016051	GTT	2	6	209333	209338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478761
4067	NC_016051	CGC	2	6	209355	209360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478761
4068	NC_016051	GTCGAA	2	12	209527	209538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	223478761
4069	NC_016051	GAA	3	9	209584	209592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478761
4070	NC_016051	CGC	2	6	209593	209598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478761
4071	NC_016051	GCC	2	6	209599	209604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478761
4072	NC_016051	CTC	2	6	209647	209652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478761
4073	NC_016051	CGC	2	6	209661	209666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478761
4074	NC_016051	CCG	2	6	209672	209677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478761
4075	NC_016051	CTG	2	6	209834	209839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478761
4076	NC_016051	CCT	2	6	209874	209879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478761
4077	NC_016051	TCG	2	6	209894	209899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478761
4078	NC_016051	CTC	2	6	209963	209968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478761
4079	NC_016051	TCG	2	6	210044	210049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478761
4080	NC_016051	GCGTA	2	10	210062	210071	20 %	20 %	40 %	20 %	223478761
4081	NC_016051	CAC	2	6	210088	210093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_016051	GCC	2	6	210134	210139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478829
4083	NC_016051	TCT	2	6	210214	210219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478829
4084	NC_016051	TCGGC	2	10	210262	210271	0 %	20 %	40 %	40 %	223478829
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4089	NC_016051	CGA	2	6	210355	210360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478829
4090	NC_016051	GTA	2	6	210362	210367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478829
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4093	NC_016051	GAT	2	6	210551	210556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478829
4094	NC_016051	TCG	3	9	210582	210590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478829
4095	NC_016051	GCC	2	6	210608	210613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478829
4096	NC_016051	GCTC	2	8	210625	210632	0 %	25 %	25 %	50 %	223478829
4097	NC_016051	GAT	2	6	210734	210739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478829
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4100	NC_016051	GCTG	2	8	210802	210809	0 %	25 %	50 %	25 %	223478829
4101	NC_016051	GAG	2	6	210821	210826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478829
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4103	NC_016051	GAG	2	6	210998	211003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478829
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4106	NC_016051	GAG	2	6	211067	211072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478829
4107	NC_016051	TC	3	6	211073	211078	0 %	50 %	0 %	50 %	223478829
4108	NC_016051	CTT	2	6	211193	211198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478829
4109	NC_016051	TCT	3	9	211240	211248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478829
4110	NC_016051	GCTC	2	8	211261	211268	0 %	25 %	25 %	50 %	223478829
4111	NC_016051	CGTAG	2	10	211390	211399	20 %	20 %	40 %	20 %	223478829
4112	NC_016051	CAC	2	6	211466	211471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_016051	ATG	2	6	211609	211614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478433
4114	NC_016051	A	6	6	211615	211620	100 %	0 %	0 %	0 %	223478433
4115	NC_016051	TGC	2	6	211662	211667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478433
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4117	NC_016051	GAG	2	6	211684	211689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478433
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4119	NC_016051	CT	3	6	211761	211766	0 %	50 %	0 %	50 %	223478433
4120	NC_016051	GAA	2	6	211812	211817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478433
4121	NC_016051	CGA	2	6	211877	211882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478433
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4123	NC_016051	GAG	2	6	212005	212010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478433
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4246	NC_016051	TAT	2	6	219014	219019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478918
4247	NC_016051	ACG	2	6	219066	219071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478918
4248	NC_016051	GACGGA	2	12	219149	219160	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223478918
4249	NC_016051	CGT	2	6	219214	219219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478918
4250	NC_016051	AAC	2	6	219227	219232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478918
4251	NC_016051	CGG	2	6	219244	219249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478918
4252	NC_016051	TGA	2	6	219420	219425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478918
4253	NC_016051	AAC	2	6	219451	219456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478918
4254	NC_016051	GGA	2	6	219506	219511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478918
4255	NC_016051	TCC	2	6	219555	219560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478918
4256	NC_016051	GCC	2	6	219617	219622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478918
4257	NC_016051	GCG	2	6	219702	219707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478918
4258	NC_016051	CAG	2	6	219721	219726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478918
4259	NC_016051	CAG	2	6	219774	219779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478918
4260	NC_016051	TCG	2	6	219789	219794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478918
4261	NC_016051	CTTCT	2	10	219811	219820	0 %	60 %	0 %	40 %	223478918
4262	NC_016051	GTG	2	6	220124	220129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478918
4263	NC_016051	ACGGG	2	10	220177	220186	20 %	0 %	60 %	20 %	223478918
4264	NC_016051	AGA	2	6	220218	220223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478918
4265	NC_016051	GCACG	2	10	220228	220237	20 %	0 %	40 %	40 %	223478918
4266	NC_016051	GTT	2	6	220337	220342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478918
4267	NC_016051	CCGT	2	8	220363	220370	0 %	25 %	25 %	50 %	223478918
4268	NC_016051	A	6	6	220403	220408	100 %	0 %	0 %	0 %	223478918
4269	NC_016051	CT	3	6	220412	220417	0 %	50 %	0 %	50 %	223478918
4270	NC_016051	ACC	2	6	220454	220459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478918
4271	NC_016051	ACGAGC	2	12	220484	220495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478918
4272	NC_016051	GAC	2	6	220498	220503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478918
4273	NC_016051	CGA	2	6	220551	220556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478918
4274	NC_016051	G	6	6	220567	220572	0 %	0 %	100 %	0 %	223478918
4275	NC_016051	GAG	2	6	220624	220629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478918
4276	NC_016051	GGAG	2	8	220638	220645	25 %	0 %	75 %	0 %	223478918
4277	NC_016051	ATC	2	6	220724	220729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478488
4278	NC_016051	CGT	2	6	220813	220818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478488
4279	NC_016051	GCG	2	6	220827	220832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478488
4280	NC_016051	GTC	3	9	221000	221008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478488
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4283	NC_016051	AGG	2	6	221156	221161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478488
4284	NC_016051	CGT	2	6	221230	221235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478488
4285	NC_016051	GGT	2	6	221326	221331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478488
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4287	NC_016051	AAG	2	6	221363	221368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478488
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4300	NC_016051	CAAGG	2	10	222310	222319	40 %	0 %	40 %	20 %	223478488
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4304	NC_016051	CTC	2	6	222440	222445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478488
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4322	NC_016051	GAA	2	6	223169	223174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478675
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4330	NC_016051	ACT	2	6	223495	223500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478675
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4354	NC_016051	ATA	2	6	224514	224519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478675
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4357	NC_016051	CCT	2	6	224774	224779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478675
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4359	NC_016051	GGAAC	2	10	224932	224941	40 %	0 %	40 %	20 %	223478675
4360	NC_016051	ACC	2	6	224983	224988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478675
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4363	NC_016051	GGC	2	6	225164	225169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478675
4364	NC_016051	CTA	2	6	225218	225223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478675
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4368	NC_016051	T	6	6	225536	225541	0 %	100 %	0 %	0 %	223478925
4369	NC_016051	T	6	6	225548	225553	0 %	100 %	0 %	0 %	223478925
4370	NC_016051	GAA	2	6	225596	225601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478925
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4374	NC_016051	CTCG	2	8	225947	225954	0 %	25 %	25 %	50 %	223478925
4375	NC_016051	TATC	2	8	226125	226132	25 %	50 %	0 %	25 %	223478925
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4383	NC_016051	GTC	2	6	226636	226641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478930
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4465	NC_016051	CTG	2	6	231417	231422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478808
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4467	NC_016051	TCT	2	6	231691	231696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478808
4468	NC_016051	AGCCCG	2	12	231709	231720	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	223478808
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4470	NC_016051	TTG	2	6	231831	231836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4471	NC_016051	GAG	2	6	231949	231954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478632
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4483	NC_016051	CTGG	2	8	232528	232535	0 %	25 %	50 %	25 %	223478555
4484	NC_016051	TCGTTC	2	12	232591	232602	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	223478633
4485	NC_016051	ACGG	2	8	232630	232637	25 %	0 %	50 %	25 %	223478633
4486	NC_016051	AAT	2	6	232748	232753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478633
4487	NC_016051	GAA	2	6	232767	232772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478633
4488	NC_016051	CGG	2	6	232808	232813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478633
4489	NC_016051	TCG	2	6	232872	232877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478633
4490	NC_016051	TGG	2	6	232915	232920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478633
4491	NC_016051	TC	3	6	232988	232993	0 %	50 %	0 %	50 %	223478633
4492	NC_016051	GCTC	2	8	233090	233097	0 %	25 %	25 %	50 %	223478633
4493	NC_016051	A	6	6	233321	233326	100 %	0 %	0 %	0 %	223478633
4494	NC_016051	CTC	2	6	233499	233504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478646
4495	NC_016051	GGGC	2	8	233509	233516	0 %	0 %	75 %	25 %	223478646
4496	NC_016051	G	6	6	233575	233580	0 %	0 %	100 %	0 %	223478646
4497	NC_016051	GGA	2	6	233657	233662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478646
4498	NC_016051	TAA	2	6	233674	233679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478646
4499	NC_016051	CCTG	2	8	233813	233820	0 %	25 %	25 %	50 %	223478646
4500	NC_016051	CGT	2	6	233822	233827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478646

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