MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_016051	CTC	2	6	2071558	2071563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525998
41003	NC_016051	TCC	2	6	2071669	2071674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478891
41004	NC_016051	AAC	2	6	2071677	2071682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478891
41005	NC_016051	TTG	2	6	2071708	2071713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478891
41006	NC_016051	TCC	2	6	2071729	2071734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478891
41007	NC_016051	TCC	2	6	2071738	2071743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478891
41008	NC_016051	GGA	2	6	2071744	2071749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478891
41009	NC_016051	CGA	2	6	2071757	2071762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478891
41010	NC_016051	TCC	2	6	2071795	2071800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478891
41011	NC_016051	CGC	2	6	2071901	2071906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478891
41012	NC_016051	TCG	2	6	2071976	2071981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478891
41013	NC_016051	TTC	2	6	2072006	2072011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478891
41014	NC_016051	GAG	2	6	2072046	2072051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478891
41015	NC_016051	TCT	2	6	2072126	2072131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478891
41016	NC_016051	CGA	2	6	2072156	2072161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478891
41017	NC_016051	CCG	2	6	2072224	2072229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478891
41018	NC_016051	CT	3	6	2072291	2072296	0 %	50 %	0 %	50 %	223478891
41019	NC_016051	CGTTCA	2	12	2072363	2072374	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	223478891
41020	NC_016051	CGA	2	6	2072423	2072428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478891
41021	NC_016051	GTC	2	6	2072452	2072457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478891
41022	NC_016051	AGT	2	6	2072495	2072500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478891
41023	NC_016051	CCTGAA	2	12	2072538	2072549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223478891
41024	NC_016051	TCG	2	6	2072599	2072604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478891
41025	NC_016051	T	7	7	2072680	2072686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41026	NC_016051	A	6	6	2072690	2072695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41027	NC_016051	GTG	2	6	2072746	2072751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41028	NC_016051	AGA	2	6	2072804	2072809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478556
41029	NC_016051	GA	5	10	2072980	2072989	50 %	0 %	50 %	0 %	223478556
41030	NC_016051	GAAG	2	8	2073132	2073139	50 %	0 %	50 %	0 %	223478556
41031	NC_016051	CTACGC	2	12	2073159	2073170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223478556
41032	NC_016051	CA	3	6	2073223	2073228	50 %	0 %	0 %	50 %	223478556
41033	NC_016051	CTC	2	6	2073243	2073248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478556
41034	NC_016051	AAAG	2	8	2073312	2073319	75 %	0 %	25 %	0 %	223478556
41035	NC_016051	GAG	2	6	2073349	2073354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478556
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41037	NC_016051	GGT	2	6	2073417	2073422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478556
41038	NC_016051	CTG	2	6	2073488	2073493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478556
41039	NC_016051	CGG	2	6	2073555	2073560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478556
41040	NC_016051	AGG	2	6	2073898	2073903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478556
41041	NC_016051	CTC	2	6	2073993	2073998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478556
41042	NC_016051	GAGAA	2	10	2074021	2074030	60 %	0 %	40 %	0 %	223478556
41043	NC_016051	ATC	2	6	2074048	2074053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478935
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41045	NC_016051	GTC	2	6	2074200	2074205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478935
41046	NC_016051	ACC	2	6	2074225	2074230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41047	NC_016051	TGG	2	6	2074241	2074246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41048	NC_016051	T	6	6	2074285	2074290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41049	NC_016051	TTA	2	6	2074300	2074305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41050	NC_016051	AAG	2	6	2074446	2074451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525999
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41053	NC_016051	AGG	2	6	2074690	2074695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525999
41054	NC_016051	AGGC	2	8	2074715	2074722	25 %	0 %	50 %	25 %	350525999
41055	NC_016051	GAG	2	6	2074791	2074796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525999
41056	NC_016051	GAG	2	6	2074872	2074877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525999
41057	NC_016051	GAG	2	6	2074935	2074940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525999
41058	NC_016051	CGA	2	6	2074961	2074966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525999
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41062	NC_016051	CCTTGG	2	12	2075330	2075341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478605
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41070	NC_016051	GTC	2	6	2075621	2075626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478605
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41074	NC_016051	GAG	3	9	2075751	2075759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478605
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41085	NC_016051	GAG	2	6	2076042	2076047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478605
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41088	NC_016051	AGG	2	6	2076124	2076129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478605
41089	NC_016051	CAT	2	6	2076144	2076149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478605
41090	NC_016051	GAG	2	6	2076179	2076184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478700
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41100	NC_016051	GAG	2	6	2076713	2076718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478700
41101	NC_016051	GAG	2	6	2076734	2076739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478700
41102	NC_016051	AGG	2	6	2076769	2076774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478700
41103	NC_016051	TGCC	2	8	2076799	2076806	0 %	25 %	25 %	50 %	223478700
41104	NC_016051	ATC	2	6	2076810	2076815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478700
41105	NC_016051	CGCT	2	8	2076849	2076856	0 %	25 %	25 %	50 %	223478700
41106	NC_016051	TC	3	6	2076866	2076871	0 %	50 %	0 %	50 %	223478700
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41112	NC_016051	CTT	3	9	2077235	2077243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478700
41113	NC_016051	TAT	2	6	2077307	2077312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478700
41114	NC_016051	GTC	2	6	2077349	2077354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478700
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41117	NC_016051	GGCC	2	8	2077581	2077588	0 %	0 %	50 %	50 %	350526000
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.