MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016051	TC	3	6	179287	179292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_016051	TCT	2	6	179321	179326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_016051	CAG	2	6	179411	179416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_016051	TCA	2	6	179435	179440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_016051	AGGGAG	2	12	179460	179471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_016051	CAGCC	2	10	179584	179593	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3507	NC_016051	TCACT	2	10	179679	179688	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3508	NC_016051	CTG	2	6	179783	179788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_016051	CAA	2	6	179829	179834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_016051	AT	3	6	179896	179901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016051	TGT	2	6	179959	179964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_016051	GGAAAG	2	12	180119	180130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016051	CTG	2	6	180138	180143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_016051	CACC	2	8	180228	180235	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3515	NC_016051	TTG	2	6	180242	180247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016051	T	6	6	180289	180294	0 %	100 %	0 %	0 %	350525712
3517	NC_016051	CTG	2	6	180333	180338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525712
3518	NC_016051	CTC	2	6	180354	180359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525712
3519	NC_016051	TGT	2	6	180374	180379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525712
3520	NC_016051	CTT	2	6	180389	180394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525712
3521	NC_016051	CTT	2	6	180401	180406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525712
3522	NC_016051	TCC	2	6	180457	180462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_016051	AAG	2	6	180534	180539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_016051	TAA	2	6	180547	180552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_016051	AAG	2	6	180608	180613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_016051	CTA	2	6	180676	180681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_016051	CTCG	2	8	180689	180696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_016051	TAA	2	6	180708	180713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_016051	TCA	2	6	180718	180723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_016051	AACC	2	8	180884	180891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_016051	T	6	6	181001	181006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016051	TCC	2	6	181062	181067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_016051	CAT	2	6	181076	181081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_016051	TAT	2	6	181091	181096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016051	CAGT	2	8	181203	181210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_016051	TGT	2	6	181225	181230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016051	AAT	2	6	181231	181236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016051	AG	3	6	181311	181316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_016051	TCT	2	6	181317	181322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_016051	CAAG	2	8	181411	181418	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_016051	ACA	2	6	181494	181499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_016051	TAACA	2	10	181514	181523	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3543	NC_016051	CTC	2	6	181540	181545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_016051	TAT	2	6	181609	181614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_016051	AATGA	2	10	181635	181644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_016051	TAC	2	6	181658	181663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478703
3547	NC_016051	TTG	2	6	181698	181703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478703
3548	NC_016051	GTA	2	6	181730	181735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478703
3549	NC_016051	GGA	2	6	181739	181744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478703
3550	NC_016051	CTT	2	6	181774	181779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478703
3551	NC_016051	CCA	2	6	181839	181844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478703
3552	NC_016051	ACTT	2	8	181849	181856	25 %	50 %	0 %	25 %	223478703
3553	NC_016051	CAC	2	6	181886	181891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478703
3554	NC_016051	CCA	2	6	181906	181911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478703
3555	NC_016051	CTC	3	9	181913	181921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478703
3556	NC_016051	CTT	2	6	182003	182008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478703
3557	NC_016051	CGA	2	6	182089	182094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478703
3558	NC_016051	TCA	2	6	182109	182114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478703
3559	NC_016051	GCT	2	6	182231	182236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478703
3560	NC_016051	CGA	2	6	182305	182310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478703
3561	NC_016051	GTC	2	6	182312	182317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478703
3562	NC_016051	ACG	2	6	182370	182375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478703
3563	NC_016051	TCC	2	6	182388	182393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478703
3564	NC_016051	AAG	2	6	182408	182413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478703
3565	NC_016051	GTT	2	6	182465	182470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478703
3566	NC_016051	GGA	2	6	182481	182486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478703
3567	NC_016051	GAG	2	6	182498	182503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478703
3568	NC_016051	TCT	2	6	182512	182517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478703
3569	NC_016051	GAG	2	6	182588	182593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478703
3570	NC_016051	TCG	3	9	182604	182612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478703
3571	NC_016051	TCC	2	6	182685	182690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478703
3572	NC_016051	CGT	2	6	182725	182730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478703
3573	NC_016051	GCC	2	6	182747	182752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478703
3574	NC_016051	ACG	2	6	182796	182801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478703
3575	NC_016051	AAC	2	6	182819	182824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_016051	ATC	2	6	182872	182877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_016051	AAAG	2	8	183026	183033	75 %	0 %	25 %	0 %	223478466
3578	NC_016051	C	6	6	183070	183075	0 %	0 %	0 %	100 %	223478466
3579	NC_016051	GAG	2	6	183171	183176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478466
3580	NC_016051	GGCC	2	8	183266	183273	0 %	0 %	50 %	50 %	223478466
3581	NC_016051	ACG	2	6	183385	183390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478466
3582	NC_016051	ACG	2	6	183393	183398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478466
3583	NC_016051	AGG	2	6	183493	183498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478466
3584	NC_016051	GAA	2	6	183515	183520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478466
3585	NC_016051	TGG	2	6	183676	183681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478466
3586	NC_016051	TGCC	2	8	183701	183708	0 %	25 %	25 %	50 %	223478466
3587	NC_016051	CGG	2	6	183719	183724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478466
3588	NC_016051	TAC	2	6	183807	183812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478466
3589	NC_016051	GGA	2	6	183836	183841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478466
3590	NC_016051	GAG	2	6	183892	183897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3591	NC_016051	TCA	2	6	183903	183908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478862
3592	NC_016051	AGAGG	2	10	183940	183949	40 %	0 %	60 %	0 %	223478862
3593	NC_016051	AGG	2	6	183963	183968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3594	NC_016051	AGG	2	6	184002	184007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3595	NC_016051	CGA	2	6	184111	184116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478862
3596	NC_016051	CTCC	2	8	184165	184172	0 %	25 %	0 %	75 %	223478862
3597	NC_016051	AGG	2	6	184200	184205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3598	NC_016051	GAG	2	6	184310	184315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3599	NC_016051	CTC	2	6	184316	184321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478862
3600	NC_016051	AGA	2	6	184344	184349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478862
3601	NC_016051	ATC	2	6	184367	184372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478862
3602	NC_016051	CCGG	2	8	184382	184389	0 %	0 %	50 %	50 %	223478862
3603	NC_016051	ACG	2	6	184425	184430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478862
3604	NC_016051	GGA	2	6	184460	184465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3605	NC_016051	A	6	6	184535	184540	100 %	0 %	0 %	0 %	223478862
3606	NC_016051	TCG	2	6	184569	184574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478862
3607	NC_016051	ACG	2	6	184611	184616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478862
3608	NC_016051	TCA	2	6	184848	184853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478862
3609	NC_016051	GAG	2	6	184871	184876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3610	NC_016051	GGA	2	6	184891	184896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3611	NC_016051	AGG	3	9	184914	184922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478862
3612	NC_016051	TCA	2	6	184941	184946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478862
3613	NC_016051	CGA	2	6	184966	184971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478862
3614	NC_016051	CGA	2	6	185017	185022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478862
3615	NC_016051	CAG	2	6	185029	185034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478862
3616	NC_016051	ATA	2	6	185093	185098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478862
3617	NC_016051	ATC	2	6	185126	185131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478862
3618	NC_016051	GAA	2	6	185160	185165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478862
3619	NC_016051	TCG	2	6	185166	185171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478862
3620	NC_016051	GAA	2	6	185265	185270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478862
3621	NC_016051	GAA	2	6	185302	185307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478862
3622	NC_016051	CT	3	6	185346	185351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_016051	AG	3	6	185457	185462	50 %	0 %	50 %	0 %	223478615
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3625	NC_016051	AG	3	6	185570	185575	50 %	0 %	50 %	0 %	223478615
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3989	NC_016051	TCC	2	6	204640	204645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525715
3990	NC_016051	GAG	2	6	204748	204753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525715
3991	NC_016051	TC	3	6	204758	204763	0 %	50 %	0 %	50 %	350525715
3992	NC_016051	C	6	6	204781	204786	0 %	0 %	0 %	100 %	350525715
3993	NC_016051	CCCT	2	8	204811	204818	0 %	25 %	0 %	75 %	350525715
3994	NC_016051	TTCC	2	8	204834	204841	0 %	50 %	0 %	50 %	350525715
3995	NC_016051	CAG	2	6	204877	204882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525715
3996	NC_016051	ACG	2	6	204920	204925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525715
3997	NC_016051	GGA	2	6	204967	204972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525715
3998	NC_016051	TTG	2	6	205031	205036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525715
3999	NC_016051	TCCCG	2	10	205122	205131	0 %	20 %	20 %	60 %	350525715
4000	NC_016051	CT	3	6	205221	205226	0 %	50 %	0 %	50 %	350525715

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