MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_016051	GCT	2	6	1865253	1865258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476909
37002	NC_016051	CGTGGG	2	12	1865435	1865446	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	223476909
37003	NC_016051	CCT	2	6	1865471	1865476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476909
37004	NC_016051	GCC	2	6	1865488	1865493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476909
37005	NC_016051	CCA	2	6	1865588	1865593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37006	NC_016051	CTTA	2	8	1865618	1865625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37007	NC_016051	TA	3	6	1865714	1865719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37008	NC_016051	CGG	2	6	1865725	1865730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37009	NC_016051	ACT	2	6	1865761	1865766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476870
37010	NC_016051	AAG	2	6	1865847	1865852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476870
37011	NC_016051	CGTCAA	2	12	1865876	1865887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223476870
37012	NC_016051	CGA	2	6	1865939	1865944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476870
37013	NC_016051	TAG	2	6	1865995	1866000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476870
37014	NC_016051	TCA	2	6	1866031	1866036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476870
37015	NC_016051	CGGC	2	8	1866040	1866047	0 %	0 %	50 %	50 %	223476870
37016	NC_016051	AAG	2	6	1866072	1866077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476870
37017	NC_016051	GAG	2	6	1866078	1866083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476870
37018	NC_016051	TCG	2	6	1866091	1866096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476870
37019	NC_016051	AAG	2	6	1866195	1866200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476870
37020	NC_016051	AGG	2	6	1866265	1866270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476870
37021	NC_016051	TCA	2	6	1866289	1866294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476870
37022	NC_016051	GAG	2	6	1866354	1866359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476870
37023	NC_016051	GGAA	2	8	1866399	1866406	50 %	0 %	50 %	0 %	223476870
37024	NC_016051	AAG	2	6	1866423	1866428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476870
37025	NC_016051	CCA	2	6	1866430	1866435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476870
37026	NC_016051	GAA	2	6	1866437	1866442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476870
37027	NC_016051	AGAGCG	2	12	1866469	1866480	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223476870
37028	NC_016051	GCA	2	6	1866489	1866494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476870
37029	NC_016051	CGA	2	6	1866581	1866586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476870
37030	NC_016051	CGG	2	6	1866659	1866664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476870
37031	NC_016051	GAG	2	6	1866723	1866728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476870
37032	NC_016051	TCC	2	6	1866754	1866759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476870
37033	NC_016051	GCC	2	6	1866768	1866773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476870
37034	NC_016051	ACT	2	6	1866817	1866822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476870
37035	NC_016051	CTC	2	6	1866840	1866845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476870
37036	NC_016051	CGT	2	6	1866881	1866886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476870
37037	NC_016051	AGG	2	6	1866946	1866951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476870
37038	NC_016051	CAA	2	6	1866953	1866958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476870
37039	NC_016051	CTC	2	6	1867017	1867022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476870
37040	NC_016051	GCC	2	6	1867065	1867070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476870
37041	NC_016051	CAG	2	6	1867089	1867094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476870
37042	NC_016051	GGA	2	6	1867115	1867120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476870
37043	NC_016051	TGAG	2	8	1867121	1867128	25 %	25 %	50 %	0 %	223476870
37044	NC_016051	TCC	2	6	1867173	1867178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476912
37045	NC_016051	ATA	2	6	1867213	1867218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223476912
37046	NC_016051	GAA	2	6	1867228	1867233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476912
37047	NC_016051	GCC	2	6	1867337	1867342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37048	NC_016051	AGA	2	6	1867363	1867368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37049	NC_016051	TGA	2	6	1867425	1867430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478985
37050	NC_016051	AGA	2	6	1867444	1867449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478985
37051	NC_016051	CG	3	6	1867553	1867558	0 %	0 %	50 %	50 %	223478985
37052	NC_016051	GAA	2	6	1867585	1867590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478985
37053	NC_016051	CG	3	6	1867634	1867639	0 %	0 %	50 %	50 %	223478985
37054	NC_016051	GTT	2	6	1867715	1867720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478985
37055	NC_016051	TCC	2	6	1867775	1867780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478627
37056	NC_016051	GC	3	6	1867798	1867803	0 %	0 %	50 %	50 %	223478627
37057	NC_016051	CGATGG	2	12	1867874	1867885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	223478627
37058	NC_016051	AAG	2	6	1867891	1867896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478627
37059	NC_016051	CCA	2	6	1867919	1867924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478627
37060	NC_016051	TCA	2	6	1868063	1868068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478627
37061	NC_016051	CGA	2	6	1868079	1868084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478627
37062	NC_016051	GAC	2	6	1868244	1868249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478627
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37070	NC_016051	CTGGC	2	10	1868527	1868536	0 %	20 %	40 %	40 %	223478627
37071	NC_016051	TCG	2	6	1868636	1868641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478627
37072	NC_016051	GTC	2	6	1868656	1868661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478627
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37074	NC_016051	GAG	2	6	1868754	1868759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478627
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37085	NC_016051	GTATC	2	10	1869435	1869444	20 %	40 %	20 %	20 %	223478627
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37099	NC_016051	CTTCT	2	10	1870288	1870297	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37100	NC_016051	GTAA	2	8	1870375	1870382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37101	NC_016051	AGA	2	6	1870431	1870436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478949
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37106	NC_016051	CGCT	2	8	1870594	1870601	0 %	25 %	25 %	50 %	223478949
37107	NC_016051	CTC	2	6	1870648	1870653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478949
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37116	NC_016051	ACC	2	6	1871675	1871680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478472
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37118	NC_016051	GCTC	2	8	1871740	1871747	0 %	25 %	25 %	50 %	223478472
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37128	NC_016051	GTT	2	6	1872107	1872112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478472
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37154	NC_016051	TTC	2	6	1873876	1873881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37227	NC_016051	GGT	2	6	1877734	1877739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37228	NC_016051	ACCTTC	2	12	1877759	1877770	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	223478456
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37230	NC_016051	CTC	2	6	1877896	1877901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478456
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37350	NC_016051	AAGCC	2	10	1884133	1884142	40 %	0 %	20 %	40 %	223478927
37351	NC_016051	CCTACA	2	12	1884225	1884236	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	223478927
37352	NC_016051	GAA	2	6	1884286	1884291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478927
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37354	NC_016051	CCT	2	6	1884307	1884312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478927
37355	NC_016051	GAG	2	6	1884335	1884340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478927
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37357	NC_016051	CGA	2	6	1884400	1884405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478927
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37362	NC_016051	CGA	2	6	1884580	1884585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478927
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37365	NC_016051	GA	3	6	1884842	1884847	50 %	0 %	50 %	0 %	223478927
37366	NC_016051	TGG	2	6	1884893	1884898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478927
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37373	NC_016051	GAA	2	6	1885215	1885220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525975
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37375	NC_016051	GCG	2	6	1885424	1885429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525975
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37378	NC_016051	TCG	2	6	1885547	1885552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525975
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37382	NC_016051	CTC	2	6	1885802	1885807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478820
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37396	NC_016051	GAG	2	6	1886413	1886418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478820
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37399	NC_016051	GTG	3	9	1886519	1886527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478820
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37407	NC_016051	GTC	2	6	1886867	1886872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478820
37408	NC_016051	TCG	3	9	1887207	1887215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478820
37409	NC_016051	TCGG	2	8	1887272	1887279	0 %	25 %	50 %	25 %	223478820
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37412	NC_016051	CCT	2	6	1887538	1887543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478820
37413	NC_016051	AGC	2	6	1887598	1887603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478820
37414	NC_016051	TGG	3	9	1887653	1887661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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37444	NC_016051	CGA	3	9	1889351	1889359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478461
37445	NC_016051	TGA	2	6	1889390	1889395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478461
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37450	NC_016051	TGA	2	6	1889600	1889605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478461
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37454	NC_016051	CGT	2	6	1889897	1889902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478461
37455	NC_016051	TCG	2	6	1889995	1890000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478461
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37457	NC_016051	CGC	2	6	1890126	1890131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478461
37458	NC_016051	CCCTT	2	10	1890149	1890158	0 %	40 %	0 %	60 %	223478461
37459	NC_016051	TCGG	2	8	1890160	1890167	0 %	25 %	50 %	25 %	223478461
37460	NC_016051	TGT	2	6	1890212	1890217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478461
37461	NC_016051	ACG	2	6	1890316	1890321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478461
37462	NC_016051	GGGT	2	8	1890322	1890329	0 %	25 %	75 %	0 %	223478461
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37464	NC_016051	TC	3	6	1890393	1890398	0 %	50 %	0 %	50 %	223478461
37465	NC_016051	GAG	2	6	1890444	1890449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478461
37466	NC_016051	TCG	2	6	1890496	1890501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478461
37467	NC_016051	GAG	2	6	1890525	1890530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478461
37468	NC_016051	CTTC	2	8	1890531	1890538	0 %	50 %	0 %	50 %	223478461
37469	NC_016051	CTC	2	6	1890618	1890623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478461
37470	NC_016051	TCT	2	6	1890659	1890664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478461
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37472	NC_016051	TCA	2	6	1890709	1890714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37474	NC_016051	A	6	6	1890794	1890799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37475	NC_016051	CGTC	2	8	1890917	1890924	0 %	25 %	25 %	50 %	223478570
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37493	NC_016051	GCTTT	2	10	1891706	1891715	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37494	NC_016051	CCG	2	6	1891876	1891881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478854
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37497	NC_016051	CACC	2	8	1892005	1892012	25 %	0 %	0 %	75 %	223478854
37498	NC_016051	GAG	2	6	1892053	1892058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478854
37499	NC_016051	C	6	6	1892103	1892108	0 %	0 %	0 %	100 %	223478854
37500	NC_016051	GAA	2	6	1892125	1892130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478854

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