MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36501	NC_016051	CCAA	2	8	1838952	1838959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36502	NC_016051	TCC	2	6	1839017	1839022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36503	NC_016051	AG	3	6	1839031	1839036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36504	NC_016051	TAC	2	6	1839051	1839056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36505	NC_016051	AT	3	6	1839089	1839094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36506	NC_016051	ACT	2	6	1839253	1839258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36507	NC_016051	AAT	2	6	1839281	1839286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36508	NC_016051	CGT	2	6	1839434	1839439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36509	NC_016051	GAA	2	6	1839615	1839620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36510	NC_016051	GTG	2	6	1839634	1839639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36511	NC_016051	CTC	2	6	1839702	1839707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476915
36512	NC_016051	AGTG	2	8	1839756	1839763	25 %	25 %	50 %	0 %	223476915
36513	NC_016051	AAGT	2	8	1839805	1839812	50 %	25 %	25 %	0 %	223476915
36514	NC_016051	AGC	2	6	1839882	1839887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36515	NC_016051	AAC	2	6	1839888	1839893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36516	NC_016051	CAA	2	6	1839953	1839958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36517	NC_016051	CGT	2	6	1840013	1840018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36518	NC_016051	ATC	2	6	1840023	1840028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36519	NC_016051	TAT	2	6	1840038	1840043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223476915
36520	NC_016051	ACA	2	6	1840186	1840191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36521	NC_016051	AACG	2	8	1840211	1840218	50 %	0 %	25 %	25 %	223476915
36522	NC_016051	ACGAC	2	10	1840354	1840363	40 %	0 %	20 %	40 %	223476915
36523	NC_016051	CAG	2	6	1840367	1840372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36524	NC_016051	GTG	2	6	1840540	1840545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476915
36525	NC_016051	ACA	2	6	1840678	1840683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36526	NC_016051	ACGTCA	2	12	1840831	1840842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223476915
36527	NC_016051	TTG	2	6	1840888	1840893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476915
36528	NC_016051	CTA	2	6	1840919	1840924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36529	NC_016051	AGGC	2	8	1841036	1841043	25 %	0 %	50 %	25 %	223476915
36530	NC_016051	CGG	2	6	1841086	1841091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476915
36531	NC_016051	ACTT	2	8	1841133	1841140	25 %	50 %	0 %	25 %	223476915
36532	NC_016051	GTGAT	2	10	1841167	1841176	20 %	40 %	40 %	0 %	223476915
36533	NC_016051	AAG	2	6	1841184	1841189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476915
36534	NC_016051	ACA	2	6	1841197	1841202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36535	NC_016051	TAC	2	6	1841526	1841531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36536	NC_016051	TTG	2	6	1841542	1841547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476915
36537	NC_016051	GAG	2	6	1841558	1841563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476915
36538	NC_016051	AAC	2	6	1841742	1841747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36539	NC_016051	ACTA	2	8	1841748	1841755	50 %	25 %	0 %	25 %	223476915
36540	NC_016051	CTA	2	6	1841768	1841773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36541	NC_016051	TCA	2	6	1841785	1841790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36542	NC_016051	AG	3	6	1841942	1841947	50 %	0 %	50 %	0 %	223476915
36543	NC_016051	ACT	2	6	1841964	1841969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36544	NC_016051	GAA	2	6	1842015	1842020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476915
36545	NC_016051	ACT	2	6	1842058	1842063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36546	NC_016051	CAG	2	6	1842474	1842479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36547	NC_016051	ATG	2	6	1842499	1842504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476915
36548	NC_016051	TAC	3	9	1842693	1842701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36549	NC_016051	CAT	2	6	1842755	1842760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
36550	NC_016051	CAA	2	6	1842788	1842793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36551	NC_016051	CAG	2	6	1842890	1842895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36552	NC_016051	ACA	2	6	1842982	1842987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36553	NC_016051	CGT	2	6	1843124	1843129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36554	NC_016051	CGT	2	6	1843166	1843171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36555	NC_016051	GAC	2	6	1843395	1843400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36556	NC_016051	CGT	2	6	1843583	1843588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36557	NC_016051	CTACAC	2	12	1843661	1843672	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	223476915
36558	NC_016051	GGC	2	6	1843739	1843744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476915
36559	NC_016051	GCA	2	6	1843844	1843849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36560	NC_016051	TCA	2	6	1843858	1843863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
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36562	NC_016051	GTC	2	6	1843965	1843970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36563	NC_016051	CGTCAC	2	12	1844009	1844020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223476915
36564	NC_016051	GTC	2	6	1844058	1844063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36565	NC_016051	CCA	2	6	1844218	1844223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476915
36566	NC_016051	CGT	2	6	1844258	1844263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36567	NC_016051	GGA	2	6	1844297	1844302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476915
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36570	NC_016051	ACCT	2	8	1844391	1844398	25 %	25 %	0 %	50 %	223476915
36571	NC_016051	CGA	2	6	1844432	1844437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36572	NC_016051	TCGAC	2	10	1844461	1844470	20 %	20 %	20 %	40 %	223476915
36573	NC_016051	GGC	2	6	1844529	1844534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476915
36574	NC_016051	CGC	2	6	1844603	1844608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476915
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36586	NC_016051	GAG	2	6	1845243	1845248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476915
36587	NC_016051	CGA	3	9	1845272	1845280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
36588	NC_016051	ACC	2	6	1845288	1845293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476915
36589	NC_016051	ATC	2	6	1845489	1845494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
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36593	NC_016051	CCAA	2	8	1845696	1845703	50 %	0 %	0 %	50 %	223476915
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36598	NC_016051	TTCGAG	2	12	1846110	1846121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	223476915
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36600	NC_016051	CGA	2	6	1846229	1846234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
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36603	NC_016051	CGA	2	6	1846400	1846405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
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36605	NC_016051	CTAC	2	8	1846501	1846508	25 %	25 %	0 %	50 %	223476915
36606	NC_016051	ACA	2	6	1846510	1846515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
36607	NC_016051	CGG	2	6	1846544	1846549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476915
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36612	NC_016051	ACGGCC	2	12	1846690	1846701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	223476915
36613	NC_016051	ACT	2	6	1846702	1846707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
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36615	NC_016051	CTA	2	6	1846757	1846762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
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36971	NC_016051	GAC	2	6	1863295	1863300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476936
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36994	NC_016051	TC	3	6	1864784	1864789	0 %	50 %	0 %	50 %	223476910
36995	NC_016051	GAG	2	6	1864878	1864883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36996	NC_016051	CTT	2	6	1864974	1864979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476909
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