MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_016051	TCC	2	6	1764656	1764661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35002	NC_016051	TTTC	2	8	1764672	1764679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35003	NC_016051	AGTA	2	8	1764839	1764846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35004	NC_016051	TC	3	6	1764865	1764870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35005	NC_016051	GCT	2	6	1764887	1764892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35006	NC_016051	AGG	2	6	1764908	1764913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35007	NC_016051	ATC	2	6	1764943	1764948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35008	NC_016051	CTT	2	6	1764964	1764969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35009	NC_016051	TACA	2	8	1764987	1764994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35010	NC_016051	AAG	2	6	1765069	1765074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35011	NC_016051	TAA	3	9	1765130	1765138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35012	NC_016051	CAA	2	6	1765154	1765159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35013	NC_016051	TAC	2	6	1765201	1765206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35014	NC_016051	G	6	6	1765296	1765301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35015	NC_016051	GAA	2	6	1765359	1765364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35016	NC_016051	ATCC	2	8	1765571	1765578	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35017	NC_016051	TTG	3	9	1765584	1765592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35018	NC_016051	ACA	2	6	1765632	1765637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35019	NC_016051	TGA	2	6	1765639	1765644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35020	NC_016051	TGA	2	6	1765666	1765671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35021	NC_016051	GTT	2	6	1765757	1765762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525965
35022	NC_016051	TGA	2	6	1765768	1765773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525965
35023	NC_016051	GAA	2	6	1765837	1765842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525965
35024	NC_016051	TGG	2	6	1765905	1765910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525965
35025	NC_016051	GGT	2	6	1766056	1766061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525965
35026	NC_016051	GGA	2	6	1766077	1766082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525965
35027	NC_016051	AAT	2	6	1766086	1766091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525965
35028	NC_016051	GAA	3	9	1766101	1766109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525965
35029	NC_016051	GTCCT	2	10	1766150	1766159	0 %	40 %	20 %	40 %	223477472
35030	NC_016051	TCT	2	6	1766188	1766193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477472
35031	NC_016051	CGA	2	6	1766343	1766348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477472
35032	NC_016051	TCT	2	6	1766391	1766396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477472
35033	NC_016051	CGA	2	6	1766397	1766402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477472
35034	NC_016051	CTT	2	6	1766433	1766438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477472
35035	NC_016051	TAT	2	6	1766455	1766460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477472
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35037	NC_016051	TC	3	6	1766598	1766603	0 %	50 %	0 %	50 %	223477472
35038	NC_016051	CGA	2	6	1766607	1766612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477472
35039	NC_016051	CGT	2	6	1766614	1766619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477472
35040	NC_016051	CTC	2	6	1766638	1766643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477472
35041	NC_016051	GAA	2	6	1766692	1766697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477472
35042	NC_016051	CTC	2	6	1766722	1766727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477472
35043	NC_016051	TGA	2	6	1766742	1766747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477472
35044	NC_016051	TCG	2	6	1766762	1766767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477472
35045	NC_016051	TTC	3	9	1766771	1766779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477472
35046	NC_016051	AGGC	2	8	1766789	1766796	25 %	0 %	50 %	25 %	223477472
35047	NC_016051	GAGTC	2	10	1766801	1766810	20 %	20 %	40 %	20 %	223477472
35048	NC_016051	CAC	2	6	1766824	1766829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477472
35049	NC_016051	CG	3	6	1766830	1766835	0 %	0 %	50 %	50 %	223477472
35050	NC_016051	GTC	2	6	1767015	1767020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525966
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35052	NC_016051	TC	3	6	1767183	1767188	0 %	50 %	0 %	50 %	350525966
35053	NC_016051	CCT	2	6	1767256	1767261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477325
35054	NC_016051	TAG	2	6	1767472	1767477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477325
35055	NC_016051	GTA	2	6	1767484	1767489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35056	NC_016051	TAG	2	6	1767490	1767495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35057	NC_016051	CTCA	2	8	1767555	1767562	25 %	25 %	0 %	50 %	223477397
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35092	NC_016051	GCG	3	9	1769535	1769543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35093	NC_016051	GC	3	6	1769545	1769550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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35099	NC_016051	CGG	2	6	1769803	1769808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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35101	NC_016051	CGC	2	6	1769848	1769853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35102	NC_016051	AT	3	6	1769875	1769880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35105	NC_016051	GCTG	2	8	1769993	1770000	0 %	25 %	50 %	25 %	223477623
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35114	NC_016051	TTC	2	6	1770451	1770456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477623
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35342	NC_016051	CA	3	6	1782405	1782410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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35345	NC_016051	TAT	2	6	1782478	1782483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35348	NC_016051	TGT	2	6	1782646	1782651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35353	NC_016051	CAC	2	6	1782713	1782718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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35471	NC_016051	CGT	2	6	1788674	1788679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476911
35472	NC_016051	ACA	2	6	1788718	1788723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476911
35473	NC_016051	GATGAC	2	12	1788737	1788748	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	223476911
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35476	NC_016051	C	6	6	1788973	1788978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35477	NC_016051	CGA	2	6	1788993	1788998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35486	NC_016051	TTCA	2	8	1789318	1789325	25 %	50 %	0 %	25 %	223476919
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