MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_016051	TCC	2	6	1637279	1637284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477424
32502	NC_016051	GA	3	6	1637384	1637389	50 %	0 %	50 %	0 %	223477424
32503	NC_016051	CCCG	2	8	1637399	1637406	0 %	0 %	25 %	75 %	223477424
32504	NC_016051	CT	3	6	1637616	1637621	0 %	50 %	0 %	50 %	223477424
32505	NC_016051	AGC	2	6	1637626	1637631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477424
32506	NC_016051	TCT	2	6	1637788	1637793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477424
32507	NC_016051	TCC	2	6	1637861	1637866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477587
32508	NC_016051	TCC	2	6	1637872	1637877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477587
32509	NC_016051	GAA	2	6	1637892	1637897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477587
32510	NC_016051	CTC	2	6	1637910	1637915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477587
32511	NC_016051	GGGA	2	8	1637917	1637924	25 %	0 %	75 %	0 %	223477587
32512	NC_016051	GCG	2	6	1638031	1638036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477587
32513	NC_016051	CGA	2	6	1638119	1638124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477587
32514	NC_016051	ACG	2	6	1638157	1638162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477587
32515	NC_016051	C	6	6	1638196	1638201	0 %	0 %	0 %	100 %	223477587
32516	NC_016051	CAG	2	6	1638213	1638218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477587
32517	NC_016051	TCC	2	6	1638396	1638401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477587
32518	NC_016051	TCC	2	6	1638423	1638428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525945
32519	NC_016051	CTC	2	6	1638431	1638436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525945
32520	NC_016051	CTT	2	6	1638488	1638493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525945
32521	NC_016051	AGT	2	6	1638526	1638531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525945
32522	NC_016051	CG	3	6	1638604	1638609	0 %	0 %	50 %	50 %	350525945
32523	NC_016051	ACG	3	9	1638726	1638734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525945
32524	NC_016051	AGA	2	6	1638775	1638780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525945
32525	NC_016051	GA	3	6	1638786	1638791	50 %	0 %	50 %	0 %	350525945
32526	NC_016051	CTT	2	6	1638833	1638838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525945
32527	NC_016051	CTT	2	6	1638842	1638847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525945
32528	NC_016051	CAC	2	6	1638868	1638873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32529	NC_016051	CTC	3	9	1639121	1639129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477622
32530	NC_016051	GAT	2	6	1639130	1639135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477622
32531	NC_016051	CCG	2	6	1639232	1639237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477331
32532	NC_016051	CTT	3	9	1639248	1639256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477331
32533	NC_016051	TCG	2	6	1639282	1639287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477331
32534	NC_016051	CGA	2	6	1639418	1639423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477331
32535	NC_016051	GTA	2	6	1639458	1639463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477331
32536	NC_016051	ACG	2	6	1639468	1639473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477331
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32538	NC_016051	CGG	2	6	1639572	1639577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477331
32539	NC_016051	TCT	3	9	1639604	1639612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477331
32540	NC_016051	GAG	2	6	1639623	1639628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477331
32541	NC_016051	TCC	2	6	1639651	1639656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477331
32542	NC_016051	CGG	2	6	1639662	1639667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477331
32543	NC_016051	ATC	2	6	1639699	1639704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477331
32544	NC_016051	TCCC	2	8	1639729	1639736	0 %	25 %	0 %	75 %	223477331
32545	NC_016051	G	6	6	1639742	1639747	0 %	0 %	100 %	0 %	223477331
32546	NC_016051	TGT	2	6	1639769	1639774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477331
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32549	NC_016051	CGA	2	6	1639811	1639816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477331
32550	NC_016051	CTT	2	6	1639851	1639856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477331
32551	NC_016051	TGA	2	6	1639892	1639897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477331
32552	NC_016051	GTA	2	6	1639956	1639961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477331
32553	NC_016051	CTC	2	6	1640057	1640062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477342
32554	NC_016051	TTC	2	6	1640070	1640075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477342
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32556	NC_016051	CTC	2	6	1640261	1640266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477342
32557	NC_016051	CGA	2	6	1640287	1640292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477342
32558	NC_016051	CGA	2	6	1640296	1640301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477342
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32562	NC_016051	CGC	2	6	1640399	1640404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477342
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32605	NC_016051	TCG	2	6	1642446	1642451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477370
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32614	NC_016051	GCC	2	6	1642767	1642772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477336
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32734	NC_016051	GA	3	6	1649577	1649582	50 %	0 %	50 %	0 %	223477393
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32843	NC_016051	CA	3	6	1655396	1655401	50 %	0 %	0 %	50 %	223477621
32844	NC_016051	GC	3	6	1655472	1655477	0 %	0 %	50 %	50 %	223477621
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