MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_016051	GAA	3	9	1588536	1588544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477487
31502	NC_016051	GAA	2	6	1588554	1588559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477487
31503	NC_016051	GAA	2	6	1588605	1588610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477487
31504	NC_016051	CAG	2	6	1588641	1588646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477487
31505	NC_016051	CT	3	6	1588658	1588663	0 %	50 %	0 %	50 %	223477487
31506	NC_016051	TGGAAC	2	12	1588712	1588723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	223477324
31507	NC_016051	GAG	2	6	1588730	1588735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477324
31508	NC_016051	CTT	2	6	1588736	1588741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477324
31509	NC_016051	GTC	2	6	1588832	1588837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477324
31510	NC_016051	TCCC	2	8	1588851	1588858	0 %	25 %	0 %	75 %	223477324
31511	NC_016051	GCG	2	6	1588866	1588871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477324
31512	NC_016051	CTT	2	6	1588934	1588939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477324
31513	NC_016051	TCC	2	6	1588941	1588946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477324
31514	NC_016051	GC	3	6	1589013	1589018	0 %	0 %	50 %	50 %	223477324
31515	NC_016051	TCC	2	6	1589067	1589072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477324
31516	NC_016051	TTC	2	6	1589073	1589078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477324
31517	NC_016051	GGA	2	6	1589095	1589100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477324
31518	NC_016051	TCC	3	9	1589109	1589117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477324
31519	NC_016051	CCT	2	6	1589188	1589193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477324
31520	NC_016051	CTATGA	2	12	1589215	1589226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	223477324
31521	NC_016051	TC	3	6	1589270	1589275	0 %	50 %	0 %	50 %	223477324
31522	NC_016051	CTT	2	6	1589363	1589368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477324
31523	NC_016051	GAACTC	2	12	1589369	1589380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223477324
31524	NC_016051	TCG	2	6	1589551	1589556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477324
31525	NC_016051	CTT	2	6	1589597	1589602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477324
31526	NC_016051	CTT	2	6	1589638	1589643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477324
31527	NC_016051	TCA	2	6	1589650	1589655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477391
31528	NC_016051	CAA	2	6	1589666	1589671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477391
31529	NC_016051	A	6	6	1589698	1589703	100 %	0 %	0 %	0 %	223477391
31530	NC_016051	TCCT	2	8	1589710	1589717	0 %	50 %	0 %	50 %	223477391
31531	NC_016051	AGG	3	9	1589722	1589730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477391
31532	NC_016051	CTC	2	6	1589811	1589816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477391
31533	NC_016051	CTT	2	6	1589841	1589846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477391
31534	NC_016051	TC	3	6	1589889	1589894	0 %	50 %	0 %	50 %	223477391
31535	NC_016051	TCCT	2	8	1589902	1589909	0 %	50 %	0 %	50 %	223477391
31536	NC_016051	CTC	2	6	1589937	1589942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477391
31537	NC_016051	TGA	2	6	1589963	1589968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477391
31538	NC_016051	C	6	6	1590021	1590026	0 %	0 %	0 %	100 %	223477391
31539	NC_016051	AGGA	2	8	1590052	1590059	50 %	0 %	50 %	0 %	223477391
31540	NC_016051	CATC	2	8	1590072	1590079	25 %	25 %	0 %	50 %	223477391
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31542	NC_016051	CCT	2	6	1590193	1590198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525936
31543	NC_016051	AACC	2	8	1590201	1590208	50 %	0 %	0 %	50 %	350525936
31544	NC_016051	CTC	2	6	1590334	1590339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525936
31545	NC_016051	CTTC	2	8	1590388	1590395	0 %	50 %	0 %	50 %	350525936
31546	NC_016051	ATC	2	6	1590401	1590406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525936
31547	NC_016051	GTA	2	6	1590412	1590417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525936
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31549	NC_016051	CCCT	2	8	1590499	1590506	0 %	25 %	0 %	75 %	350525936
31550	NC_016051	GAG	2	6	1590516	1590521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525936
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31552	NC_016051	GTC	2	6	1590563	1590568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525936
31553	NC_016051	GTT	2	6	1590571	1590576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525936
31554	NC_016051	GAA	2	6	1590655	1590660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525936
31555	NC_016051	ATC	3	9	1590752	1590760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525936
31556	NC_016051	ATT	2	6	1590782	1590787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525936
31557	NC_016051	TC	3	6	1590817	1590822	0 %	50 %	0 %	50 %	350525936
31558	NC_016051	GAG	2	6	1590865	1590870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525936
31559	NC_016051	TGA	2	6	1590986	1590991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31561	NC_016051	GAG	2	6	1591047	1591052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477539
31562	NC_016051	GGA	2	6	1591076	1591081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477539
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31564	NC_016051	AAGG	2	8	1591280	1591287	50 %	0 %	50 %	0 %	223477539
31565	NC_016051	CGA	2	6	1591289	1591294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477539
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31569	NC_016051	ACG	2	6	1591386	1591391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477539
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31572	NC_016051	TCC	2	6	1591486	1591491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477539
31573	NC_016051	GAA	2	6	1591560	1591565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31574	NC_016051	GTG	2	6	1591596	1591601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477425
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31580	NC_016051	GAG	2	6	1591952	1591957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477425
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31584	NC_016051	CTGGGC	2	12	1592243	1592254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	223477467
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31587	NC_016051	TGA	3	9	1592326	1592334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477467
31588	NC_016051	CAT	2	6	1592339	1592344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477467
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31590	NC_016051	CGT	2	6	1592398	1592403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477467
31591	NC_016051	CT	3	6	1592440	1592445	0 %	50 %	0 %	50 %	223477467
31592	NC_016051	GAT	3	9	1592456	1592464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477467
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31596	NC_016051	AGA	2	6	1592662	1592667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477467
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31599	NC_016051	GAC	3	9	1592798	1592806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477467
31600	NC_016051	GAG	2	6	1592822	1592827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477467
31601	NC_016051	TC	3	6	1592921	1592926	0 %	50 %	0 %	50 %	223477467
31602	NC_016051	TCACC	2	10	1592975	1592984	20 %	20 %	0 %	60 %	223477334
31603	NC_016051	TAT	2	6	1593013	1593018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477334
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31607	NC_016051	CTC	2	6	1593409	1593414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477334
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31610	NC_016051	GCC	2	6	1593583	1593588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477334
31611	NC_016051	CAT	2	6	1593610	1593615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477334
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31615	NC_016051	TCC	2	6	1593852	1593857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477334
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