MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_016051	AGG	2	6	1565309	1565314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477554
31003	NC_016051	CAGAGC	2	12	1565396	1565407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477554
31004	NC_016051	AGG	2	6	1565494	1565499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477308
31005	NC_016051	AGT	2	6	1565500	1565505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477308
31006	NC_016051	CCT	2	6	1565507	1565512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477308
31007	NC_016051	CTT	2	6	1565525	1565530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477308
31008	NC_016051	GTA	2	6	1565561	1565566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477308
31009	NC_016051	ATT	2	6	1565571	1565576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477308
31010	NC_016051	CGT	2	6	1565633	1565638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477308
31011	NC_016051	AGT	2	6	1565641	1565646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477308
31012	NC_016051	CAT	2	6	1565768	1565773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477308
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31014	NC_016051	TCT	2	6	1565800	1565805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477308
31015	NC_016051	AG	3	6	1565835	1565840	50 %	0 %	50 %	0 %	223477308
31016	NC_016051	GTA	2	6	1565843	1565848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477308
31017	NC_016051	CGC	2	6	1565942	1565947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477308
31018	NC_016051	CCA	2	6	1566031	1566036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477308
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31021	NC_016051	TCCT	2	8	1566069	1566076	0 %	50 %	0 %	50 %	223477308
31022	NC_016051	CTC	2	6	1566083	1566088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477308
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31028	NC_016051	GTT	2	6	1566351	1566356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477308
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31037	NC_016051	TCA	2	6	1566930	1566935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477308
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31045	NC_016051	CAT	2	6	1567552	1567557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477308
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31051	NC_016051	TC	3	6	1567915	1567920	0 %	50 %	0 %	50 %	223477308
31052	NC_016051	CTG	2	6	1568048	1568053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477308
31053	NC_016051	CTTT	2	8	1568076	1568083	0 %	75 %	0 %	25 %	223477308
31054	NC_016051	AGT	2	6	1568140	1568145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477308
31055	NC_016051	GGCC	2	8	1568201	1568208	0 %	0 %	50 %	50 %	223477308
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31062	NC_016051	TCCA	2	8	1568493	1568500	25 %	25 %	0 %	50 %	223477308
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31064	NC_016051	GTCG	2	8	1568567	1568574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31065	NC_016051	GGA	2	6	1568619	1568624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31117	NC_016051	CTT	2	6	1570819	1570824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477455
31118	NC_016051	CTCC	2	8	1570857	1570864	0 %	25 %	0 %	75 %	223477455
31119	NC_016051	CGA	2	6	1570866	1570871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477455
31120	NC_016051	CTT	2	6	1570873	1570878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477455
31121	NC_016051	TTC	2	6	1570949	1570954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477455
31122	NC_016051	TTC	2	6	1571130	1571135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477581
31123	NC_016051	TCC	2	6	1571136	1571141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477581
31124	NC_016051	GCC	2	6	1571204	1571209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477581
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31126	NC_016051	GTC	2	6	1571423	1571428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477581
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31130	NC_016051	CCT	2	6	1571572	1571577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477581
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31133	NC_016051	GAA	2	6	1571627	1571632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31146	NC_016051	TGA	2	6	1572220	1572225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477429
31147	NC_016051	GTT	2	6	1572244	1572249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477429
31148	NC_016051	AGTA	2	8	1572251	1572258	50 %	25 %	25 %	0 %	223477429
31149	NC_016051	GAA	2	6	1572274	1572279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477429
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31153	NC_016051	TAC	2	6	1572590	1572595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477429
31154	NC_016051	C	6	6	1572611	1572616	0 %	0 %	0 %	100 %	223477429
31155	NC_016051	CGA	2	6	1572622	1572627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477429
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31178	NC_016051	TA	3	6	1574096	1574101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31179	NC_016051	CAC	2	6	1574124	1574129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31180	NC_016051	AGT	2	6	1574134	1574139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31187	NC_016051	CGTC	2	8	1574516	1574523	0 %	25 %	25 %	50 %	223477411
31188	NC_016051	CCA	2	6	1574585	1574590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31189	NC_016051	TCC	2	6	1574606	1574611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31190	NC_016051	TTCA	2	8	1574800	1574807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31191	NC_016051	TCG	2	6	1574816	1574821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31192	NC_016051	C	6	6	1574850	1574855	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31193	NC_016051	CCT	2	6	1574862	1574867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31194	NC_016051	CGA	2	6	1574868	1574873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525934
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31206	NC_016051	CGGG	2	8	1575477	1575484	0 %	0 %	75 %	25 %	350525934
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31209	NC_016051	CGG	2	6	1575666	1575671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477328
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31212	NC_016051	AGG	2	6	1575833	1575838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477328
31213	NC_016051	TCG	2	6	1575896	1575901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477328
31214	NC_016051	TCC	2	6	1575908	1575913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477328
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31219	NC_016051	TTC	2	6	1576157	1576162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477328
31220	NC_016051	TC	3	6	1576165	1576170	0 %	50 %	0 %	50 %	223477328
31221	NC_016051	ATC	2	6	1576187	1576192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477328
31222	NC_016051	T	6	6	1576288	1576293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31223	NC_016051	GCT	2	6	1576348	1576353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477457
31224	NC_016051	ACA	2	6	1576407	1576412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477457
31225	NC_016051	GAA	2	6	1576458	1576463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477457
31226	NC_016051	ATA	2	6	1576553	1576558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477457
31227	NC_016051	TA	3	6	1576652	1576657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31228	NC_016051	GTG	2	6	1576681	1576686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31229	NC_016051	CAT	2	6	1576750	1576755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477385
31230	NC_016051	GAG	2	6	1576766	1576771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477385
31231	NC_016051	GAA	2	6	1576846	1576851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477385
31232	NC_016051	AG	3	6	1576929	1576934	50 %	0 %	50 %	0 %	223477385
31233	NC_016051	TCA	2	6	1576968	1576973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477385
31234	NC_016051	GACTAC	2	12	1576997	1577008	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223477385
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31467	NC_016051	GCC	2	6	1586765	1586770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477562
31468	NC_016051	GAG	2	6	1586771	1586776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477562
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