MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_016051	AGA	2	6	1541891	1541896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477559
30503	NC_016051	GAG	2	6	1541923	1541928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477559
30504	NC_016051	CCGG	2	8	1542008	1542015	0 %	0 %	50 %	50 %	223477354
30505	NC_016051	G	6	6	1542227	1542232	0 %	0 %	100 %	0 %	223477354
30506	NC_016051	GAA	2	6	1542269	1542274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477354
30507	NC_016051	AG	3	6	1542296	1542301	50 %	0 %	50 %	0 %	223477354
30508	NC_016051	CTC	2	6	1542431	1542436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477354
30509	NC_016051	GGA	2	6	1542527	1542532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477354
30510	NC_016051	CTC	2	6	1542536	1542541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477354
30511	NC_016051	GTT	2	6	1542564	1542569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477354
30512	NC_016051	CTCC	2	8	1542694	1542701	0 %	25 %	0 %	75 %	223477354
30513	NC_016051	CTC	2	6	1542705	1542710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477354
30514	NC_016051	AAG	2	6	1542735	1542740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477354
30515	NC_016051	CGA	2	6	1542743	1542748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477354
30516	NC_016051	GGA	2	6	1542752	1542757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477354
30517	NC_016051	GC	3	6	1542759	1542764	0 %	0 %	50 %	50 %	223477354
30518	NC_016051	TAC	2	6	1542792	1542797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477354
30519	NC_016051	GTTCT	2	10	1542804	1542813	0 %	60 %	20 %	20 %	223477354
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30521	NC_016051	GGA	2	6	1542908	1542913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477354
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30524	NC_016051	AACG	2	8	1542950	1542957	50 %	0 %	25 %	25 %	223477354
30525	NC_016051	GTC	2	6	1542960	1542965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477354
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30533	NC_016051	GCTGC	2	10	1543185	1543194	0 %	20 %	40 %	40 %	223477354
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30543	NC_016051	CGG	2	6	1543631	1543636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477354
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30601	NC_016051	GC	3	6	1545872	1545877	0 %	0 %	50 %	50 %	223477543
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30963	NC_016051	GCT	2	6	1563832	1563837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477548
30964	NC_016051	TCGGTC	2	12	1563864	1563875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477548
30965	NC_016051	CGT	2	6	1563892	1563897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477548
30966	NC_016051	TGA	2	6	1563898	1563903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477548
30967	NC_016051	GAC	2	6	1563947	1563952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477548
30968	NC_016051	GAC	2	6	1563965	1563970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477548
30969	NC_016051	TGA	2	6	1563976	1563981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477548
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30974	NC_016051	CTC	3	9	1564115	1564123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477548
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30981	NC_016051	TGA	2	6	1564249	1564254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477548
30982	NC_016051	TTC	2	6	1564286	1564291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477548
30983	NC_016051	CTT	2	6	1564295	1564300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477548
30984	NC_016051	GAG	2	6	1564301	1564306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477548
30985	NC_016051	CGG	2	6	1564324	1564329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477548
30986	NC_016051	CCT	2	6	1564348	1564353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477548
30987	NC_016051	CAT	2	6	1564379	1564384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477548
30988	NC_016051	TCG	2	6	1564413	1564418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477548
30989	NC_016051	CGT	2	6	1564432	1564437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477548
30990	NC_016051	TGA	2	6	1564441	1564446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477548
30991	NC_016051	GGT	2	6	1564499	1564504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477548
30992	NC_016051	CTTTTT	2	12	1564642	1564653	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30993	NC_016051	CTC	2	6	1564795	1564800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477554
30994	NC_016051	CAG	2	6	1564838	1564843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477554
30995	NC_016051	CT	3	6	1564929	1564934	0 %	50 %	0 %	50 %	223477554
30996	NC_016051	AAC	2	6	1565017	1565022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477554
30997	NC_016051	GGA	2	6	1565090	1565095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477554
30998	NC_016051	CCA	2	6	1565121	1565126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477554
30999	NC_016051	AG	4	8	1565217	1565224	50 %	0 %	50 %	0 %	223477554
31000	NC_016051	AGT	2	6	1565271	1565276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477554

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